MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	CGCT	2	8	5949	5956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187100	ACTC	2	8	5991	5998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187100	AGTG	2	8	9964	9971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187100	ATAA	2	8	9992	9999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187100	TATT	2	8	10911	10918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187100	TTTC	2	8	11136	11143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NT_187100	CGAA	2	8	11403	11410	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NT_187100	AATA	2	8	11418	11425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187100	TTGC	2	8	27247	27254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187100	TTGT	2	8	27484	27491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187100	CCGC	2	8	34321	34328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NT_187100	GAAG	2	8	36095	36102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187100	ACTC	2	8	43204	43211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NT_187100	GATT	2	8	44529	44536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187100	TTTA	2	8	44583	44590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187100	TTAT	2	8	45197	45204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187100	TTTG	2	8	45283	45290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187100	CAGG	2	8	48057	48064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NT_187100	TTAT	2	8	48852	48859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187100	GGCG	2	8	49679	49686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187100	ACAG	2	8	53905	53912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187100	AAAG	2	8	56278	56285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187100	GAGC	2	8	56489	56496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NT_187100	CGAT	2	8	59686	59693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NT_187100	GTGA	2	8	59805	59812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187100	TATT	2	8	61131	61138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187100	ATTG	2	8	63036	63043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187100	AGCC	2	8	66006	66013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187100	GGCG	2	8	66472	66479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NT_187100	TCCT	2	8	74992	74999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NT_187100	TTTC	2	8	79094	79101	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NT_187100	CGCC	2	8	80801	80808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NT_187100	AGCG	2	8	80839	80846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NT_187100	TAGA	2	8	81820	81827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187100	AGCA	2	8	82945	82952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187100	TTTA	2	8	86008	86015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187100	ATGA	2	8	86934	86941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187100	TTAA	2	8	87138	87145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187100	ATTT	2	8	87376	87383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187100	AAGA	2	8	88467	88474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187100	CAGG	2	8	89558	89565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NT_187100	ATCA	2	8	93549	93556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187100	TGAA	2	8	97552	97559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187100	ATTT	2	8	98532	98539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187100	ATGG	2	8	100084	100091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187100	TGGC	2	8	105537	105544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NT_187100	CGAA	2	8	106992	106999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.