MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	CAC	2	6	22	27	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187100	TGC	2	6	43	48	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187100	ATT	2	6	70	75	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187100	CTC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187100	CAT	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187100	CGC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187100	CGA	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187100	GTC	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187100	GCG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187100	GTA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187100	GGT	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187100	TTG	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187100	TAA	2	6	5534	5539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187100	TTA	2	6	5598	5603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187100	ATG	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187100	TGA	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187100	TTG	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187100	GCC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NT_187100	ATT	2	6	6023	6028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187100	ATT	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187100	CCT	2	6	6835	6840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NT_187100	GAT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187100	GCG	3	9	9533	9541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187100	ATC	2	6	9684	9689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187100	CGA	2	6	9716	9721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187100	GGT	2	6	9748	9753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187100	CAG	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187100	TAA	2	6	9943	9948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187100	TCT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187100	GGC	2	6	10794	10799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187100	GCC	2	6	10811	10816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NT_187100	CTT	2	6	10850	10855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187100	TTA	2	6	10920	10925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187100	TAT	2	6	10933	10938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187100	TGA	2	6	11003	11008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187100	ATT	2	6	11012	11017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187100	TTA	2	6	11024	11029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187100	GTT	2	6	11030	11035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187100	AAT	2	6	11063	11068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187100	GAG	2	6	11128	11133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187100	AGA	2	6	11301	11306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187100	TTG	2	6	11314	11319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187100	GAT	2	6	11337	11342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187100	CGT	2	6	11374	11379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187100	CGA	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187100	ACC	2	6	11466	11471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NT_187100	CTT	2	6	17192	17197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187100	GTT	2	6	19947	19952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187100	GCC	2	6	21537	21542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NT_187100	CTG	2	6	21563	21568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187100	GCG	2	6	21569	21574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187100	CTA	2	6	22028	22033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187100	GAT	2	6	22130	22135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187100	CAT	2	6	22700	22705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187100	TTA	2	6	24196	24201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187100	TCA	2	6	24219	24224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187100	ATG	2	6	24898	24903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187100	CCT	2	6	25858	25863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NT_187100	TTA	2	6	25866	25871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187100	ATA	2	6	26413	26418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187100	AGA	2	6	26991	26996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187100	ATT	2	6	27229	27234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187100	ATA	2	6	27377	27382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187100	TTA	2	6	27436	27441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187100	TGA	2	6	27625	27630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187100	GCC	2	6	27677	27682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NT_187100	CCA	2	6	34343	34348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NT_187100	AAT	2	6	34427	34432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187100	ATG	2	6	34469	34474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187100	TAC	2	6	36022	36027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187100	ATC	2	6	37009	37014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187100	GGC	2	6	37038	37043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187100	CTC	2	6	38423	38428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NT_187100	GTG	2	6	38435	38440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187100	TTC	2	6	38561	38566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187100	TGT	2	6	38608	38613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187100	TAA	2	6	40115	40120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187100	CGT	2	6	40204	40209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187100	TCG	2	6	40328	40333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187100	GAA	2	6	40370	40375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187100	TTG	2	6	43214	43219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187100	ATT	2	6	43235	43240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187100	TTA	2	6	43256	43261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187100	ATT	2	6	43327	43332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187100	AGC	2	6	43343	43348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187100	ATG	2	6	43352	43357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187100	GAT	2	6	43394	43399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187100	GCC	2	6	44420	44425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NT_187100	TGA	2	6	44605	44610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187100	TTA	2	6	45000	45005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187100	TTA	2	6	45014	45019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187100	GCA	2	6	45024	45029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187100	TAT	2	6	45127	45132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187100	CTC	2	6	45223	45228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NT_187100	GTT	2	6	45262	45267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187100	AGG	2	6	45346	45351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187100	GTC	2	6	48710	48715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187100	GGC	2	6	48750	48755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187100	ATC	2	6	49669	49674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187100	ACA	2	6	51298	51303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187100	TGA	2	6	51308	51313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187100	ACG	2	6	51327	51332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187100	CGG	2	6	51340	51345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187100	CAT	2	6	51441	51446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187100	AAG	2	6	51448	51453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187100	TAT	2	6	52609	52614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187100	ACA	2	6	53036	53041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187100	GAT	2	6	53086	53091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187100	AAT	2	6	53950	53955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187100	ATG	2	6	54177	54182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187100	TAT	2	6	54248	54253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187100	CGC	2	6	54254	54259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NT_187100	GAA	3	9	56445	56453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187100	GCA	2	6	58499	58504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187100	GCA	2	6	59823	59828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187100	TGC	2	6	59835	59840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187100	TAA	2	6	59845	59850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187100	ATT	2	6	60720	60725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187100	CCG	2	6	60781	60786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187100	CCA	2	6	60985	60990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NT_187100	AAT	2	6	61097	61102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187100	AGT	2	6	61188	61193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187100	TAT	2	6	61225	61230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187100	ATT	2	6	62692	62697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187100	CGT	2	6	62894	62899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187100	GTT	2	6	62906	62911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187100	GTA	2	6	62916	62921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187100	AGA	2	6	62943	62948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187100	GCG	2	6	65812	65817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187100	CGG	2	6	65867	65872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187100	GGC	2	6	65931	65936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187100	TCA	2	6	65959	65964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187100	ACG	2	6	66058	66063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187100	AGC	2	6	66094	66099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187100	GCC	2	6	66184	66189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NT_187100	CGC	2	6	66206	66211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NT_187100	GGC	2	6	66239	66244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187100	AGG	2	6	66308	66313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187100	GCC	2	6	66369	66374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NT_187100	ACA	2	6	66383	66388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187100	CCA	2	6	66416	66421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NT_187100	CAC	2	6	70223	70228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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165	NT_187100	ATC	2	6	78996	79001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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196	NT_187100	AAT	2	6	92514	92519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.