MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	AAT	2	6	372	377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249915
2	NT_187100	CAT	2	6	468	473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249915
3	NT_187100	TCT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249915
4	NT_187100	GAT	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249915
5	NT_187100	CGC	2	6	581	586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249915
6	NT_187100	TGA	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249915
7	NT_187100	GTG	2	6	639	644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249915
8	NT_187100	CAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249915
9	NT_187100	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249915
10	NT_187100	CGG	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249915
11	NT_187100	AGA	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249915
12	NT_187100	GCA	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249916
13	NT_187100	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249916
14	NT_187100	GAT	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249916
15	NT_187100	ATC	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249916
16	NT_187100	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249916
17	NT_187100	AAT	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249916
18	NT_187100	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249917
19	NT_187100	TAA	2	6	1983	1988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249917
20	NT_187100	AGG	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249917
21	NT_187100	CGA	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249917
22	NT_187100	ATG	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249917
23	NT_187100	GCA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249917
24	NT_187100	GAT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249917
25	NT_187100	GCG	2	6	2665	2670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249917
26	NT_187100	TTG	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
27	NT_187100	GAA	4	12	3223	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249918
28	NT_187100	CCG	2	6	3275	3280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
29	NT_187100	TTG	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
30	NT_187100	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249918
31	NT_187100	CCG	2	6	3362	3367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
32	NT_187100	TTG	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
33	NT_187100	CAA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249918
34	NT_187100	ATC	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
35	NT_187100	CTA	2	6	3621	3626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
36	NT_187100	CCG	2	6	3659	3664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
37	NT_187100	TCA	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
38	NT_187100	AGC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249918
39	NT_187100	AGG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249918
40	NT_187100	TGT	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
41	NT_187100	TGC	2	6	4104	4109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
42	NT_187100	TGC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
43	NT_187100	CGT	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
44	NT_187100	GCT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
45	NT_187100	GGA	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249919
46	NT_187100	TAT	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249919
47	NT_187100	CCG	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249919
48	NT_187100	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249919
49	NT_187100	AGA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
50	NT_187100	TAA	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249919
51	NT_187100	GAA	3	9	4922	4930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
52	NT_187100	AAG	2	6	4940	4945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
53	NT_187100	ATT	2	6	5079	5084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249920
54	NT_187100	TTC	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
55	NT_187100	CAG	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
56	NT_187100	TTC	2	6	5335	5340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
57	NT_187100	CAG	4	12	5346	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
58	NT_187100	TCT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
59	NT_187100	ACG	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
60	NT_187100	TTC	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
61	NT_187100	TGT	2	6	5463	5468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249920
62	NT_187100	CTA	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249921
63	NT_187100	CGT	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
64	NT_187100	CGG	2	6	6265	6270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249921
65	NT_187100	CGA	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
66	NT_187100	GTC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
67	NT_187100	CGA	2	6	6413	6418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
68	NT_187100	CAG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
69	NT_187100	TGG	2	6	6568	6573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249921
70	NT_187100	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
71	NT_187100	GGT	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249921
72	NT_187100	GGA	2	6	6725	6730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249921
73	NT_187100	ACG	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
74	NT_187100	GTA	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249922
75	NT_187100	CAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
76	NT_187100	CAG	2	6	7252	7257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
77	NT_187100	GCG	2	6	7271	7276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249922
78	NT_187100	GGT	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
79	NT_187100	ACG	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
80	NT_187100	CAG	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
81	NT_187100	CAG	2	6	7603	7608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
82	NT_187100	ACC	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249922
83	NT_187100	TCG	2	6	7808	7813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249922
84	NT_187100	GTG	3	9	7856	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
85	NT_187100	TTC	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249922
86	NT_187100	CCG	2	6	8012	8017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249922
87	NT_187100	GAT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249922
88	NT_187100	GAA	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249922
89	NT_187100	GTT	2	6	8170	8175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249922
90	NT_187100	CGG	2	6	8258	8263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249922
91	NT_187100	TTG	2	6	8327	8332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249922
92	NT_187100	ACC	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249922
93	NT_187100	ACC	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249922
94	NT_187100	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
95	NT_187100	CTT	2	6	8595	8600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249922
96	NT_187100	TCA	2	6	8666	8671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
97	NT_187100	TGG	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
98	NT_187100	CGA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
99	NT_187100	AGC	2	6	8764	8769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
100	NT_187100	GCA	2	6	8826	8831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249922
101	NT_187100	GCC	2	6	8836	8841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249922
102	NT_187100	CAT	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
103	NT_187100	CAA	2	6	8883	8888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249922
104	NT_187100	ACA	2	6	8891	8896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249922
105	NT_187100	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249922
106	NT_187100	GTG	2	6	9097	9102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249922
107	NT_187100	CTT	2	6	9216	9221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249922
108	NT_187100	GAT	2	6	9244	9249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249922
109	NT_187100	AAT	2	6	9328	9333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249922
110	NT_187100	GTC	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249922
111	NT_187100	CGC	2	6	9387	9392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249922
112	NT_187100	TCA	2	6	10216	10221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249923
113	NT_187100	TAA	2	6	10253	10258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249923
114	NT_187100	GAT	2	6	10403	10408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249923
115	NT_187100	TGC	2	6	10611	10616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249923
116	NT_187100	TTA	2	6	10678	10683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249923
117	NT_187100	GTT	3	9	10697	10705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249923
118	NT_187100	ATA	2	6	11160	11165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249924
119	NT_187100	CGC	2	6	11605	11610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249925
120	NT_187100	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249925
121	NT_187100	TAA	2	6	11677	11682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249925
122	NT_187100	TTA	2	6	11765	11770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249925
123	NT_187100	TGA	2	6	12043	12048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249925
124	NT_187100	TTG	2	6	12098	12103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249925
125	NT_187100	GTG	2	6	12215	12220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249925
126	NT_187100	TCA	2	6	12276	12281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249925
127	NT_187100	GCG	2	6	12339	12344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249925
128	NT_187100	ATT	2	6	12379	12384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249925
129	NT_187100	GAA	2	6	12394	12399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249925
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254	NT_187100	GCC	2	6	20967	20972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249936
255	NT_187100	GCC	3	9	20985	20993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249936
256	NT_187100	GGT	2	6	21000	21005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249936
257	NT_187100	AAG	2	6	21047	21052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249936
258	NT_187100	GTG	2	6	21058	21063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249936
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262	NT_187100	CGG	2	6	21242	21247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249936
263	NT_187100	GCT	2	6	21358	21363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249936
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274	NT_187100	TAA	2	6	22467	22472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249938
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278	NT_187100	CGC	2	6	22615	22620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249938
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282	NT_187100	ATA	2	6	23029	23034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249939
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286	NT_187100	GGC	2	6	23238	23243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249939
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363	NT_187100	TAA	2	6	28972	28977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249948
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