MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	A	6	6	1062	1067	100 %	0 %	0 %	0 %	409249915
2	NT_187100	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	409249916
3	NT_187100	A	6	6	1736	1741	100 %	0 %	0 %	0 %	409249916
4	NT_187100	A	6	6	4064	4069	100 %	0 %	0 %	0 %	409249919
5	NT_187100	T	6	6	5131	5136	0 %	100 %	0 %	0 %	409249920
6	NT_187100	T	6	6	6979	6984	0 %	100 %	0 %	0 %	409249922
7	NT_187100	T	6	6	6988	6993	0 %	100 %	0 %	0 %	409249922
8	NT_187100	T	6	6	9396	9401	0 %	100 %	0 %	0 %	409249922
9	NT_187100	A	7	7	11564	11570	100 %	0 %	0 %	0 %	409249925
10	NT_187100	A	6	6	12008	12013	100 %	0 %	0 %	0 %	409249925
11	NT_187100	A	6	6	12205	12210	100 %	0 %	0 %	0 %	409249925
12	NT_187100	A	6	6	12740	12745	100 %	0 %	0 %	0 %	409249925
13	NT_187100	T	6	6	13613	13618	0 %	100 %	0 %	0 %	409249926
14	NT_187100	T	6	6	14711	14716	0 %	100 %	0 %	0 %	409249927
15	NT_187100	G	6	6	16659	16664	0 %	0 %	100 %	0 %	409249929
16	NT_187100	A	6	6	18217	18222	100 %	0 %	0 %	0 %	409249931
17	NT_187100	A	6	6	19178	19183	100 %	0 %	0 %	0 %	409249932
18	NT_187100	T	6	6	21696	21701	0 %	100 %	0 %	0 %	409249937
19	NT_187100	A	6	6	22309	22314	100 %	0 %	0 %	0 %	409249938
20	NT_187100	T	6	6	22396	22401	0 %	100 %	0 %	0 %	409249938
21	NT_187100	A	6	6	22648	22653	100 %	0 %	0 %	0 %	409249938
22	NT_187100	A	6	6	22667	22672	100 %	0 %	0 %	0 %	409249938
23	NT_187100	A	6	6	23443	23448	100 %	0 %	0 %	0 %	409249939
24	NT_187100	A	6	6	23786	23791	100 %	0 %	0 %	0 %	409249940
25	NT_187100	A	6	6	24258	24263	100 %	0 %	0 %	0 %	409249942
26	NT_187100	T	6	6	25876	25881	0 %	100 %	0 %	0 %	409249944
27	NT_187100	T	7	7	26020	26026	0 %	100 %	0 %	0 %	409249944
28	NT_187100	T	6	6	27091	27096	0 %	100 %	0 %	0 %	409249946
29	NT_187100	T	6	6	29556	29561	0 %	100 %	0 %	0 %	409249948
30	NT_187100	A	6	6	30375	30380	100 %	0 %	0 %	0 %	409249949
31	NT_187100	T	7	7	33669	33675	0 %	100 %	0 %	0 %	409249951
32	NT_187100	A	6	6	34992	34997	100 %	0 %	0 %	0 %	409249952
33	NT_187100	T	7	7	35395	35401	0 %	100 %	0 %	0 %	409249953
34	NT_187100	A	8	8	38877	38884	100 %	0 %	0 %	0 %	409249957
35	NT_187100	A	6	6	39214	39219	100 %	0 %	0 %	0 %	409249957
36	NT_187100	A	6	6	39606	39611	100 %	0 %	0 %	0 %	409249957
37	NT_187100	T	6	6	39994	39999	0 %	100 %	0 %	0 %	409249958
38	NT_187100	A	6	6	41955	41960	100 %	0 %	0 %	0 %	409249959
39	NT_187100	G	6	6	42149	42154	0 %	0 %	100 %	0 %	409249959
40	NT_187100	T	6	6	44238	44243	0 %	100 %	0 %	0 %	409249960
41	NT_187100	A	6	6	46709	46714	100 %	0 %	0 %	0 %	409249963
42	NT_187100	A	6	6	46913	46918	100 %	0 %	0 %	0 %	409249963
43	NT_187100	A	6	6	47634	47639	100 %	0 %	0 %	0 %	409249963
44	NT_187100	A	6	6	49204	49209	100 %	0 %	0 %	0 %	409249965
45	NT_187100	A	6	6	50711	50716	100 %	0 %	0 %	0 %	409249967
46	NT_187100	A	6	6	52403	52408	100 %	0 %	0 %	0 %	409249969
47	NT_187100	T	7	7	52842	52848	0 %	100 %	0 %	0 %	409249970
48	NT_187100	T	7	7	53451	53457	0 %	100 %	0 %	0 %	409249971
49	NT_187100	T	7	7	54270	54276	0 %	100 %	0 %	0 %	409249973
50	NT_187100	T	6	6	54362	54367	0 %	100 %	0 %	0 %	409249973
51	NT_187100	A	6	6	55068	55073	100 %	0 %	0 %	0 %	409249973
52	NT_187100	G	6	6	55161	55166	0 %	0 %	100 %	0 %	409249973
53	NT_187100	C	6	6	55310	55315	0 %	0 %	0 %	100 %	409249973
54	NT_187100	T	6	6	55619	55624	0 %	100 %	0 %	0 %	409249973
55	NT_187100	A	7	7	55723	55729	100 %	0 %	0 %	0 %	409249973
56	NT_187100	T	6	6	56127	56132	0 %	100 %	0 %	0 %	409249973
57	NT_187100	A	6	6	57538	57543	100 %	0 %	0 %	0 %	409249974
58	NT_187100	T	6	6	58282	58287	0 %	100 %	0 %	0 %	409249974
59	NT_187100	T	6	6	58314	58319	0 %	100 %	0 %	0 %	409249974
60	NT_187100	A	6	6	58641	58646	100 %	0 %	0 %	0 %	409249975
61	NT_187100	A	6	6	59544	59549	100 %	0 %	0 %	0 %	409249975
62	NT_187100	A	6	6	61331	61336	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
63	NT_187100	T	6	6	61344	61349	0 %	100 %	0 %	0 %	409249977
64	NT_187100	T	6	6	61372	61377	0 %	100 %	0 %	0 %	409249977
65	NT_187100	A	7	7	61443	61449	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
66	NT_187100	T	6	6	61687	61692	0 %	100 %	0 %	0 %	409249977
67	NT_187100	A	7	7	61956	61962	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
68	NT_187100	G	6	6	62268	62273	0 %	0 %	100 %	0 %	409249977
69	NT_187100	A	7	7	62620	62626	100 %	0 %	0 %	0 %	409249977
70	NT_187100	T	7	7	63104	63110	0 %	100 %	0 %	0 %	409249978
71	NT_187100	T	6	6	63573	63578	0 %	100 %	0 %	0 %	409249978
72	NT_187100	A	6	6	63592	63597	100 %	0 %	0 %	0 %	409249978
73	NT_187100	C	6	6	65762	65767	0 %	0 %	0 %	100 %	409249980
74	NT_187100	T	6	6	67464	67469	0 %	100 %	0 %	0 %	409249982
75	NT_187100	T	6	6	68777	68782	0 %	100 %	0 %	0 %	409249982
76	NT_187100	T	6	6	70371	70376	0 %	100 %	0 %	0 %	409249985
77	NT_187100	A	6	6	71337	71342	100 %	0 %	0 %	0 %	409249987
78	NT_187100	T	6	6	71466	71471	0 %	100 %	0 %	0 %	409249987
79	NT_187100	A	6	6	71998	72003	100 %	0 %	0 %	0 %	409249989
80	NT_187100	A	7	7	72297	72303	100 %	0 %	0 %	0 %	409249989
81	NT_187100	A	6	6	73633	73638	100 %	0 %	0 %	0 %	409249990
82	NT_187100	A	6	6	75901	75906	100 %	0 %	0 %	0 %	409249992
83	NT_187100	T	6	6	75910	75915	0 %	100 %	0 %	0 %	409249992
84	NT_187100	A	7	7	76588	76594	100 %	0 %	0 %	0 %	409249992
85	NT_187100	T	7	7	81240	81246	0 %	100 %	0 %	0 %	409249999
86	NT_187100	T	6	6	82524	82529	0 %	100 %	0 %	0 %	409250000
87	NT_187100	A	6	6	82816	82821	100 %	0 %	0 %	0 %	409250000
88	NT_187100	A	6	6	83388	83393	100 %	0 %	0 %	0 %	409250001
89	NT_187100	A	6	6	83728	83733	100 %	0 %	0 %	0 %	409250001
90	NT_187100	A	6	6	85446	85451	100 %	0 %	0 %	0 %	409250003
91	NT_187100	A	6	6	86371	86376	100 %	0 %	0 %	0 %	409250005
92	NT_187100	A	6	6	86629	86634	100 %	0 %	0 %	0 %	409250005
93	NT_187100	A	6	6	86685	86690	100 %	0 %	0 %	0 %	409250005
94	NT_187100	A	7	7	87779	87785	100 %	0 %	0 %	0 %	409250006
95	NT_187100	T	6	6	87905	87910	0 %	100 %	0 %	0 %	409250006
96	NT_187100	T	7	7	88087	88093	0 %	100 %	0 %	0 %	409250006
97	NT_187100	A	7	7	88244	88250	100 %	0 %	0 %	0 %	409250006
98	NT_187100	T	7	7	88320	88326	0 %	100 %	0 %	0 %	409250006
99	NT_187100	A	6	6	88815	88820	100 %	0 %	0 %	0 %	409250007
100	NT_187100	A	7	7	89032	89038	100 %	0 %	0 %	0 %	409250007
101	NT_187100	T	6	6	92386	92391	0 %	100 %	0 %	0 %	409250009
102	NT_187100	A	6	6	92736	92741	100 %	0 %	0 %	0 %	409250010
103	NT_187100	T	8	8	93488	93495	0 %	100 %	0 %	0 %	409250011
104	NT_187100	T	6	6	93598	93603	0 %	100 %	0 %	0 %	409250012
105	NT_187100	A	7	7	94378	94384	100 %	0 %	0 %	0 %	409250013
106	NT_187100	A	6	6	95497	95502	100 %	0 %	0 %	0 %	409250014
107	NT_187100	A	6	6	95856	95861	100 %	0 %	0 %	0 %	409250014
108	NT_187100	A	6	6	95982	95987	100 %	0 %	0 %	0 %	409250014
109	NT_187100	A	6	6	96270	96275	100 %	0 %	0 %	0 %	409250015
110	NT_187100	C	6	6	98851	98856	0 %	0 %	0 %	100 %	409250018
111	NT_187100	A	6	6	101021	101026	100 %	0 %	0 %	0 %	409250020
112	NT_187100	A	7	7	101095	101101	100 %	0 %	0 %	0 %	409250020
113	NT_187100	A	6	6	103709	103714	100 %	0 %	0 %	0 %	409250023
114	NT_187100	A	6	6	103780	103785	100 %	0 %	0 %	0 %	409250023
115	NT_187100	A	6	6	104200	104205	100 %	0 %	0 %	0 %	409250023
116	NT_187100	T	7	7	106248	106254	0 %	100 %	0 %	0 %	409250026

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.