MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187098	CAGCG	2	10	985	994	20 %	0 %	40 %	40 %	409249776
2	NT_187098	CATCG	2	10	1927	1936	20 %	20 %	20 %	40 %	409249777
3	NT_187098	TGGGG	2	10	3017	3026	0 %	20 %	80 %	0 %	409249779
4	NT_187098	TATCG	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	409249779
5	NT_187098	CTGAA	2	10	3943	3952	40 %	20 %	20 %	20 %	409249779
6	NT_187098	AGGTC	2	10	4892	4901	20 %	20 %	40 %	20 %	409249780
7	NT_187098	GAATG	2	10	6032	6041	40 %	20 %	40 %	0 %	409249780
8	NT_187098	CGCAG	2	10	8333	8342	20 %	0 %	40 %	40 %	409249782
9	NT_187098	ATCGT	2	10	9004	9013	20 %	40 %	20 %	20 %	409249784
10	NT_187098	GTACC	2	10	11050	11059	20 %	20 %	20 %	40 %	409249787
11	NT_187098	ACGTG	2	10	11244	11253	20 %	20 %	40 %	20 %	409249787
12	NT_187098	ATGGG	2	10	11745	11754	20 %	20 %	60 %	0 %	409249787
13	NT_187098	GGCGG	2	10	13449	13458	0 %	0 %	80 %	20 %	409249789
14	NT_187098	GCGCC	2	10	16795	16804	0 %	0 %	40 %	60 %	409249796
15	NT_187098	TTTAC	2	10	17573	17582	20 %	60 %	0 %	20 %	409249797
16	NT_187098	CAGGC	2	10	18784	18793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NT_187098	GAAGA	2	10	19991	20000	60 %	0 %	40 %	0 %	409249798
18	NT_187098	TGATG	2	10	24016	24025	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187098	ACTGA	2	10	25026	25035	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187098	CATTT	2	10	29610	29619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NT_187098	TTGAA	2	10	29852	29861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187098	AAAAT	2	10	29975	29984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187098	TTTGG	2	10	32029	32038	0 %	60 %	40 %	0 %	409249812
24	NT_187098	CGGAT	2	10	32591	32600	20 %	20 %	40 %	20 %	409249814
25	NT_187098	GCCGC	2	10	34781	34790	0 %	0 %	40 %	60 %	409249816
26	NT_187098	AACGA	2	10	37626	37635	60 %	0 %	20 %	20 %	409249817
27	NT_187098	AGGCC	2	10	39631	39640	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NT_187098	ATCGT	2	10	40483	40492	20 %	40 %	20 %	20 %	409249821
29	NT_187098	CGCGG	2	10	43018	43027	0 %	0 %	60 %	40 %	409249823
30	NT_187098	GCGCC	2	10	43829	43838	0 %	0 %	40 %	60 %	409249823
31	NT_187098	CTGGC	2	10	44818	44827	0 %	20 %	40 %	40 %	409249824
32	NT_187098	AAGCA	2	10	44872	44881	60 %	0 %	20 %	20 %	409249824
33	NT_187098	ACAAT	2	10	45577	45586	60 %	20 %	0 %	20 %	409249825
34	NT_187098	CTTTT	2	10	45616	45625	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NT_187098	GAGTG	2	10	45758	45767	20 %	20 %	60 %	0 %	409249826
36	NT_187098	CTTTT	2	10	46561	46570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NT_187098	AAAAG	2	10	47504	47513	80 %	0 %	20 %	0 %	409249830
38	NT_187098	TGGAC	2	10	49649	49658	20 %	20 %	40 %	20 %	409249831
39	NT_187098	CATCG	2	10	50324	50333	20 %	20 %	20 %	40 %	409249832
40	NT_187098	TTCCA	2	10	50478	50487	20 %	40 %	0 %	40 %	409249832
41	NT_187098	TTAAA	2	10	50996	51005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187098	CGCGT	2	10	56763	56772	0 %	20 %	40 %	40 %	409249838
43	NT_187098	GCCCA	2	10	63668	63677	20 %	0 %	20 %	60 %	409249844
44	NT_187098	CGGCG	2	10	63740	63749	0 %	0 %	60 %	40 %	409249844
45	NT_187098	CGTTA	2	10	68958	68967	20 %	40 %	20 %	20 %	409249849
46	NT_187098	ACGAC	2	10	69844	69853	40 %	0 %	20 %	40 %	409249850
47	NT_187098	GCGCC	2	10	71174	71183	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NT_187098	TGCTG	2	10	71431	71440	0 %	40 %	40 %	20 %	409249853
49	NT_187098	TGGCG	2	10	71500	71509	0 %	20 %	60 %	20 %	409249853
50	NT_187098	CAATT	2	10	74359	74368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NT_187098	GAAAT	2	10	74385	74394	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187098	CATCA	2	10	77061	77070	40 %	20 %	0 %	40 %	409249862
53	NT_187098	GTAAT	2	10	78049	78058	40 %	40 %	20 %	0 %	409249862
54	NT_187098	CCGGC	2	10	78941	78950	0 %	0 %	40 %	60 %	409249863
55	NT_187098	GCACC	2	10	81986	81995	20 %	0 %	20 %	60 %	409249865
56	NT_187098	TCCAG	2	10	82466	82475	20 %	20 %	20 %	40 %	409249865
57	NT_187098	TAATG	2	10	82506	82515	40 %	40 %	20 %	0 %	409249865
58	NT_187098	TGAGT	2	10	83150	83159	20 %	40 %	40 %	0 %	409249866
59	NT_187098	GCGCC	2	10	83321	83330	0 %	0 %	40 %	60 %	409249866
60	NT_187098	TGGCG	2	10	84494	84503	0 %	20 %	60 %	20 %	409249867
61	NT_187098	GTTCA	2	10	85038	85047	20 %	40 %	20 %	20 %	409249868
62	NT_187098	ACGTA	2	10	85143	85152	40 %	20 %	20 %	20 %	409249868
63	NT_187098	GGGCG	2	10	86907	86916	0 %	0 %	80 %	20 %	409249870
64	NT_187098	AGAAC	2	10	87729	87738	60 %	0 %	20 %	20 %	409249870
65	NT_187098	TCCCA	2	10	93140	93149	20 %	20 %	0 %	60 %	409249878
66	NT_187098	AGCGC	2	10	93229	93238	20 %	0 %	40 %	40 %	409249878
67	NT_187098	CTGCG	2	10	93372	93381	0 %	20 %	40 %	40 %	409249879
68	NT_187098	TCGCC	2	10	94901	94910	0 %	20 %	20 %	60 %	409249881
69	NT_187098	AAGAA	2	10	99764	99773	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187098	TAAAA	2	10	100457	100466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187098	TTTAC	2	10	102638	102647	20 %	60 %	0 %	20 %	409249886
72	NT_187098	GTCGC	2	10	103637	103646	0 %	20 %	40 %	40 %	409249887
73	NT_187098	TAAAT	2	10	103782	103791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187098	ATCAC	2	10	105881	105890	40 %	20 %	0 %	40 %	409249889
75	NT_187098	ATCAT	2	10	106386	106395	40 %	40 %	0 %	20 %	409249890
76	NT_187098	ACTGT	2	10	109653	109662	20 %	40 %	20 %	20 %	409249894
77	NT_187098	GCGAA	2	10	110648	110657	40 %	0 %	40 %	20 %	409249895
78	NT_187098	GCGCC	2	10	114505	114514	0 %	0 %	40 %	60 %	409249900
79	NT_187098	GATAT	2	10	117369	117378	40 %	40 %	20 %	0 %	409249903
80	NT_187098	CCGCG	2	10	118435	118444	0 %	0 %	40 %	60 %	409249904
81	NT_187098	ATCAA	2	10	120849	120858	60 %	20 %	0 %	20 %	409249906
82	NT_187098	GGCTG	2	10	121956	121965	0 %	20 %	60 %	20 %	409249906
83	NT_187098	AATTT	2	10	122452	122461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187098	CAGCT	2	10	123907	123916	20 %	20 %	20 %	40 %	409249907
85	NT_187098	TGACC	2	10	124083	124092	20 %	20 %	20 %	40 %	409249907
86	NT_187098	CTGGT	2	10	125694	125703	0 %	40 %	40 %	20 %	409249907
87	NT_187098	AAGCG	2	10	128308	128317	40 %	0 %	40 %	20 %	409249909
88	NT_187098	GTTAC	2	10	128715	128724	20 %	40 %	20 %	20 %	409249910
89	NT_187098	GTACA	2	10	130391	130400	40 %	20 %	20 %	20 %	409249912

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.