MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187097	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187097	GTT	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187097	TTC	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187097	CGT	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187097	CAG	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187097	GCA	2	6	871	876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187097	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249770
8	NT_187097	TCG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249770
9	NT_187097	CCT	2	6	1233	1238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249770
10	NT_187097	ACC	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
11	NT_187097	CAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
12	NT_187097	CGG	2	6	1585	1590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249771
13	NT_187097	ACC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
14	NT_187097	TTC	2	6	1619	1624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249771
15	NT_187097	CAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249772
16	NT_187097	TGG	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249772
17	NT_187097	TAT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249772
18	NT_187097	GCT	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249772
19	NT_187097	CGA	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249772
20	NT_187097	TCT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249772
21	NT_187097	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249772
22	NT_187097	AAT	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249772
23	NT_187097	TAA	2	6	2394	2399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187097	GTT	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187097	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187097	GAA	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187097	ATA	2	6	2597	2602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187097	TGC	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187097	CTT	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187097	AAT	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187097	GTA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187097	TAG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187097	TCG	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187097	GGC	2	6	3030	3035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249773
35	NT_187097	TCA	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
36	NT_187097	AAG	2	6	3110	3115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
37	NT_187097	CAT	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
38	NT_187097	TTA	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249773
39	NT_187097	GGA	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249773
40	NT_187097	AGA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
41	NT_187097	TAA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249773
42	NT_187097	CAT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
43	NT_187097	ACC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249773
44	NT_187097	AAC	2	6	3365	3370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
45	NT_187097	GAA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
46	NT_187097	TCT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249773
47	NT_187097	CTG	2	6	3538	3543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249773
48	NT_187097	ACA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
49	NT_187097	TCT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187097	AAT	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187097	GTT	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187097	CGT	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187097	CAG	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187097	TTA	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187097	AAT	3	9	4268	4276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187097	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187097	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187097	ATG	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187097	TCA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
60	NT_187097	CCT	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249774
61	NT_187097	TAT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
62	NT_187097	ATT	2	6	4795	4800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
63	NT_187097	AAT	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
64	NT_187097	GAA	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249774
65	NT_187097	CGT	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249774
66	NT_187097	CAT	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
67	NT_187097	TAT	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
68	NT_187097	AGC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249774
69	NT_187097	TAA	2	6	5145	5150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
70	NT_187097	AGG	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249774
71	NT_187097	ATT	2	6	5344	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187097	TGA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187097	CTC	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NT_187097	GCA	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187097	AGG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187097	GAC	2	6	5584	5589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187097	CGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187097	CGG	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187097	TTG	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187097	CCA	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.