MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187097	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249770
2	NT_187097	TCG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249770
3	NT_187097	CCT	2	6	1233	1238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249770
4	NT_187097	ACC	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
5	NT_187097	CAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
6	NT_187097	CGG	2	6	1585	1590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249771
7	NT_187097	ACC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
8	NT_187097	TTC	2	6	1619	1624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249771
9	NT_187097	CAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249772
10	NT_187097	TGG	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249772
11	NT_187097	TAT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249772
12	NT_187097	GCT	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249772
13	NT_187097	CGA	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249772
14	NT_187097	TCT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249772
15	NT_187097	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249772
16	NT_187097	AAT	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249772
17	NT_187097	GGC	2	6	3030	3035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249773
18	NT_187097	TCA	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
19	NT_187097	AAG	2	6	3110	3115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
20	NT_187097	CAT	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
21	NT_187097	TTA	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249773
22	NT_187097	GGA	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249773
23	NT_187097	AGA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
24	NT_187097	TAA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249773
25	NT_187097	CAT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
26	NT_187097	ACC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249773
27	NT_187097	AAC	2	6	3365	3370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
28	NT_187097	GAA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
29	NT_187097	TCT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249773
30	NT_187097	CTG	2	6	3538	3543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249773
31	NT_187097	ACA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
32	NT_187097	TCA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
33	NT_187097	CCT	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249774
34	NT_187097	TAT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
35	NT_187097	ATT	2	6	4795	4800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
36	NT_187097	AAT	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
37	NT_187097	GAA	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249774
38	NT_187097	CGT	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249774
39	NT_187097	CAT	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
40	NT_187097	TAT	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
41	NT_187097	AGC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249774
42	NT_187097	TAA	2	6	5145	5150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
43	NT_187097	AGG	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.