MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187094	CTATG	2	10	1752	1761	20 %	40 %	20 %	20 %	409249697
2	NT_187094	AAAGG	2	10	2096	2105	60 %	0 %	40 %	0 %	409249697
3	NT_187094	AACCC	2	10	4148	4157	40 %	0 %	0 %	60 %	409249700
4	NT_187094	GGCCA	2	10	4924	4933	20 %	0 %	40 %	40 %	409249700
5	NT_187094	GGCGC	2	10	5716	5725	0 %	0 %	60 %	40 %	409249700
6	NT_187094	CGGGA	2	10	6183	6192	20 %	0 %	60 %	20 %	409249700
7	NT_187094	GGCCA	2	10	6433	6442	20 %	0 %	40 %	40 %	409249700
8	NT_187094	CGCCC	2	10	8188	8197	0 %	0 %	20 %	80 %	409249703
9	NT_187094	GCGCT	2	10	8470	8479	0 %	20 %	40 %	40 %	409249703
10	NT_187094	CGGCG	2	10	8751	8760	0 %	0 %	60 %	40 %	409249703
11	NT_187094	GGCGG	2	10	8776	8785	0 %	0 %	80 %	20 %	409249703
12	NT_187094	GCCTG	2	10	9489	9498	0 %	20 %	40 %	40 %	409249704
13	NT_187094	GCTGT	2	10	11411	11420	0 %	40 %	40 %	20 %	409249707
14	NT_187094	GCTTG	2	10	12293	12302	0 %	40 %	40 %	20 %	409249708
15	NT_187094	ATCGC	2	10	13005	13014	20 %	20 %	20 %	40 %	409249708
16	NT_187094	GCCGC	2	10	16011	16020	0 %	0 %	40 %	60 %	409249710
17	NT_187094	CCGTG	2	10	20453	20462	0 %	20 %	40 %	40 %	409249715
18	NT_187094	GTTTT	2	10	20567	20576	0 %	80 %	20 %	0 %	409249715
19	NT_187094	CTGGA	2	10	21906	21915	20 %	20 %	40 %	20 %	409249718
20	NT_187094	CTTTG	2	10	25498	25507	0 %	60 %	20 %	20 %	409249719
21	NT_187094	AACCT	2	10	28660	28669	40 %	20 %	0 %	40 %	409249725
22	NT_187094	TTGAC	2	10	33788	33797	20 %	40 %	20 %	20 %	409249733
23	NT_187094	GCATG	2	10	33883	33892	20 %	20 %	40 %	20 %	409249733
24	NT_187094	AGCAG	2	10	34503	34512	40 %	0 %	40 %	20 %	409249734
25	NT_187094	TGTGG	2	10	36183	36192	0 %	40 %	60 %	0 %	409249735
26	NT_187094	AGCGC	2	10	41491	41500	20 %	0 %	40 %	40 %	409249741
27	NT_187094	CAGGG	2	10	41779	41788	20 %	0 %	60 %	20 %	409249742
28	NT_187094	TCCGG	2	10	43222	43231	0 %	20 %	40 %	40 %	409249743
29	NT_187094	GGCAT	2	10	44642	44651	20 %	20 %	40 %	20 %	409249744
30	NT_187094	CCGGG	2	10	49507	49516	0 %	0 %	60 %	40 %	409249753
31	NT_187094	CGAAC	2	10	53562	53571	40 %	0 %	20 %	40 %	409249757
32	NT_187094	TGGTC	2	10	53697	53706	0 %	40 %	40 %	20 %	409249757
33	NT_187094	TGAAA	2	10	55328	55337	60 %	20 %	20 %	0 %	409249759
34	NT_187094	CACAA	2	10	56035	56044	60 %	0 %	0 %	40 %	409249760
35	NT_187094	GTTAA	2	10	60333	60342	40 %	40 %	20 %	0 %	409249762
36	NT_187094	ATTAA	2	10	61685	61694	60 %	40 %	0 %	0 %	409249762
37	NT_187094	AGTAA	2	10	63067	63076	60 %	20 %	20 %	0 %	409249764
38	NT_187094	CTTAT	2	10	63742	63751	20 %	60 %	0 %	20 %	409249766

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.