MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187094	GCTC	2	8	951	958	0 %	25 %	25 %	50 %	409249697
2	NT_187094	ATGC	2	8	1646	1653	25 %	25 %	25 %	25 %	409249697
3	NT_187094	ATTG	2	8	1861	1868	25 %	50 %	25 %	0 %	409249697
4	NT_187094	GTTC	2	8	2028	2035	0 %	50 %	25 %	25 %	409249697
5	NT_187094	TAAT	2	8	2498	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	409249699
6	NT_187094	CTTT	2	8	2960	2967	0 %	75 %	0 %	25 %	409249699
7	NT_187094	ACTG	2	8	3769	3776	25 %	25 %	25 %	25 %	409249699
8	NT_187094	CAAT	2	8	4118	4125	50 %	25 %	0 %	25 %	409249700
9	NT_187094	CCAC	2	8	4460	4467	25 %	0 %	0 %	75 %	409249700
10	NT_187094	GGAT	2	8	4585	4592	25 %	25 %	50 %	0 %	409249700
11	NT_187094	GCAG	2	8	5642	5649	25 %	0 %	50 %	25 %	409249700
12	NT_187094	GGCG	2	8	6465	6472	0 %	0 %	75 %	25 %	409249700
13	NT_187094	CCGC	2	8	6499	6506	0 %	0 %	25 %	75 %	409249700
14	NT_187094	CGAT	2	8	6569	6576	25 %	25 %	25 %	25 %	409249700
15	NT_187094	GCCG	2	8	7132	7139	0 %	0 %	50 %	50 %	409249701
16	NT_187094	CAGC	2	8	7436	7443	25 %	0 %	25 %	50 %	409249702
17	NT_187094	ATGT	2	8	8086	8093	25 %	50 %	25 %	0 %	409249703
18	NT_187094	GCCA	2	8	10978	10985	25 %	0 %	25 %	50 %	409249706
19	NT_187094	CCCA	2	8	11002	11009	25 %	0 %	0 %	75 %	409249706
20	NT_187094	ATGA	2	8	11019	11026	50 %	25 %	25 %	0 %	409249706
21	NT_187094	GTCG	2	8	12674	12681	0 %	25 %	50 %	25 %	409249708
22	NT_187094	CGGA	2	8	13914	13921	25 %	0 %	50 %	25 %	409249709
23	NT_187094	ATCC	2	8	15053	15060	25 %	25 %	0 %	50 %	409249710
24	NT_187094	GAGC	2	8	16493	16500	25 %	0 %	50 %	25 %	409249711
25	NT_187094	GAAA	2	8	16826	16833	75 %	0 %	25 %	0 %	409249711
26	NT_187094	TCCC	2	8	16899	16906	0 %	25 %	0 %	75 %	409249711
27	NT_187094	AGAA	2	8	17102	17109	75 %	0 %	25 %	0 %	409249712
28	NT_187094	GATG	2	8	17124	17131	25 %	25 %	50 %	0 %	409249712
29	NT_187094	AGCC	2	8	17529	17536	25 %	0 %	25 %	50 %	409249712
30	NT_187094	CAGT	2	8	17858	17865	25 %	25 %	25 %	25 %	409249713
31	NT_187094	ACGC	2	8	17932	17939	25 %	0 %	25 %	50 %	409249713
32	NT_187094	CAGA	2	8	18157	18164	50 %	0 %	25 %	25 %	409249713
33	NT_187094	TGGA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	50 %	0 %	409249713
34	NT_187094	AGAA	2	8	20018	20025	75 %	0 %	25 %	0 %	409249715
35	NT_187094	CGTT	2	8	20044	20051	0 %	50 %	25 %	25 %	409249715
36	NT_187094	CGAA	2	8	20710	20717	50 %	0 %	25 %	25 %	409249715
37	NT_187094	CTGA	2	8	20728	20735	25 %	25 %	25 %	25 %	409249715
38	NT_187094	GAAC	2	8	22142	22149	50 %	0 %	25 %	25 %	409249718
39	NT_187094	CGAT	2	8	22892	22899	25 %	25 %	25 %	25 %	409249719
40	NT_187094	CGCA	2	8	22918	22925	25 %	0 %	25 %	50 %	409249719
41	NT_187094	GGCT	2	8	24230	24237	0 %	25 %	50 %	25 %	409249719
42	NT_187094	CGAT	2	8	24791	24798	25 %	25 %	25 %	25 %	409249719
43	NT_187094	ATGG	2	8	25669	25676	25 %	25 %	50 %	0 %	409249720
44	NT_187094	CTTT	2	8	25878	25885	0 %	75 %	0 %	25 %	409249720
45	NT_187094	ATCA	2	8	26297	26304	50 %	25 %	0 %	25 %	409249722
46	NT_187094	CTGC	2	8	26350	26357	0 %	25 %	25 %	50 %	409249722
47	NT_187094	TGCC	2	8	26886	26893	0 %	25 %	25 %	50 %	409249723
48	NT_187094	ACCA	2	8	27111	27118	50 %	0 %	0 %	50 %	409249723
49	NT_187094	AAGA	2	8	28529	28536	75 %	0 %	25 %	0 %	409249725
50	NT_187094	GACG	2	8	28710	28717	25 %	0 %	50 %	25 %	409249725
51	NT_187094	ACTG	2	8	28890	28897	25 %	25 %	25 %	25 %	409249725
52	NT_187094	CGCC	2	8	29188	29195	0 %	0 %	25 %	75 %	409249726
53	NT_187094	GATG	2	8	29802	29809	25 %	25 %	50 %	0 %	409249727
54	NT_187094	CTGG	2	8	29836	29843	0 %	25 %	50 %	25 %	409249727
55	NT_187094	ACAG	2	8	29941	29948	50 %	0 %	25 %	25 %	409249727
56	NT_187094	AATT	2	8	32232	32239	50 %	50 %	0 %	0 %	409249731
57	NT_187094	CAAA	2	8	33575	33582	75 %	0 %	0 %	25 %	409249733
58	NT_187094	CATC	2	8	33948	33955	25 %	25 %	0 %	50 %	409249733
59	NT_187094	TGCG	2	8	34127	34134	0 %	25 %	50 %	25 %	409249733
60	NT_187094	TACT	2	8	34409	34416	25 %	50 %	0 %	25 %	409249734
61	NT_187094	AATT	2	8	34655	34662	50 %	50 %	0 %	0 %	409249734
62	NT_187094	TTAC	2	8	34688	34695	25 %	50 %	0 %	25 %	409249734
63	NT_187094	TCCG	2	8	34743	34750	0 %	25 %	25 %	50 %	409249734
64	NT_187094	AATG	2	8	34828	34835	50 %	25 %	25 %	0 %	409249734
65	NT_187094	TGGC	2	8	35951	35958	0 %	25 %	50 %	25 %	409249735
66	NT_187094	CCGA	2	8	36244	36251	25 %	0 %	25 %	50 %	409249735
67	NT_187094	GTGG	2	8	36258	36265	0 %	25 %	75 %	0 %	409249735
68	NT_187094	ATGA	2	8	37679	37686	50 %	25 %	25 %	0 %	409249737
69	NT_187094	AAAT	2	8	37813	37820	75 %	25 %	0 %	0 %	409249737
70	NT_187094	GCTT	2	8	38173	38180	0 %	50 %	25 %	25 %	409249738
71	NT_187094	TGTT	2	8	38463	38470	0 %	75 %	25 %	0 %	409249739
72	NT_187094	CAGC	2	8	38790	38797	25 %	0 %	25 %	50 %	409249739
73	NT_187094	TGGC	2	8	40133	40140	0 %	25 %	50 %	25 %	409249741
74	NT_187094	ATCA	2	8	40142	40149	50 %	25 %	0 %	25 %	409249741
75	NT_187094	CTGA	2	8	40185	40192	25 %	25 %	25 %	25 %	409249741
76	NT_187094	TGGA	2	8	40662	40669	25 %	25 %	50 %	0 %	409249741
77	NT_187094	ACGA	2	8	40738	40745	50 %	0 %	25 %	25 %	409249741
78	NT_187094	TCGC	2	8	40811	40818	0 %	25 %	25 %	50 %	409249741
79	NT_187094	AGCC	2	8	41040	41047	25 %	0 %	25 %	50 %	409249741
80	NT_187094	CATT	2	8	41435	41442	25 %	50 %	0 %	25 %	409249741
81	NT_187094	CTGG	2	8	41450	41457	0 %	25 %	50 %	25 %	409249741
82	NT_187094	GTCA	2	8	41862	41869	25 %	25 %	25 %	25 %	409249742
83	NT_187094	ACCC	2	8	42075	42082	25 %	0 %	0 %	75 %	409249743
84	NT_187094	GGCG	2	8	42459	42466	0 %	0 %	75 %	25 %	409249743
85	NT_187094	GCGG	2	8	42978	42985	0 %	0 %	75 %	25 %	409249743
86	NT_187094	TGGC	2	8	43141	43148	0 %	25 %	50 %	25 %	409249743
87	NT_187094	GTGC	2	8	43315	43322	0 %	25 %	50 %	25 %	409249743
88	NT_187094	GGGA	2	8	43509	43516	25 %	0 %	75 %	0 %	409249743
89	NT_187094	ATTC	2	8	43667	43674	25 %	50 %	0 %	25 %	409249744
90	NT_187094	GGTA	2	8	43792	43799	25 %	25 %	50 %	0 %	409249744
91	NT_187094	ATTC	2	8	44066	44073	25 %	50 %	0 %	25 %	409249744
92	NT_187094	TCCG	2	8	45180	45187	0 %	25 %	25 %	50 %	409249744
93	NT_187094	CAGT	2	8	45337	45344	25 %	25 %	25 %	25 %	409249744
94	NT_187094	GACT	2	8	46019	46026	25 %	25 %	25 %	25 %	409249746
95	NT_187094	GACA	2	8	47194	47201	50 %	0 %	25 %	25 %	409249750
96	NT_187094	CCGT	2	8	47641	47648	0 %	25 %	25 %	50 %	409249750
97	NT_187094	AAAG	2	8	47995	48002	75 %	0 %	25 %	0 %	409249751
98	NT_187094	ATGG	2	8	48113	48120	25 %	25 %	50 %	0 %	409249751
99	NT_187094	CTGG	2	8	48178	48185	0 %	25 %	50 %	25 %	409249751
100	NT_187094	CGCT	2	8	48191	48198	0 %	25 %	25 %	50 %	409249751
101	NT_187094	TCAG	2	8	48238	48245	25 %	25 %	25 %	25 %	409249751
102	NT_187094	AAGA	2	8	48323	48330	75 %	0 %	25 %	0 %	409249751
103	NT_187094	AGTG	2	8	48478	48485	25 %	25 %	50 %	0 %	409249752
104	NT_187094	TTTC	2	8	48492	48499	0 %	75 %	0 %	25 %	409249752
105	NT_187094	GAAA	2	8	48579	48586	75 %	0 %	25 %	0 %	409249752
106	NT_187094	GCAG	2	8	49009	49016	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
107	NT_187094	GAAA	2	8	49621	49628	75 %	0 %	25 %	0 %	409249753
108	NT_187094	TCGC	2	8	49709	49716	0 %	25 %	25 %	50 %	409249753
109	NT_187094	GCAG	2	8	49789	49796	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
110	NT_187094	CAGT	2	8	49844	49851	25 %	25 %	25 %	25 %	409249753
111	NT_187094	CGGG	2	8	50039	50046	0 %	0 %	75 %	25 %	409249753
112	NT_187094	CGGG	2	8	50137	50144	0 %	0 %	75 %	25 %	409249753
113	NT_187094	GAAC	2	8	50254	50261	50 %	0 %	25 %	25 %	409249753
114	NT_187094	GCAG	2	8	50305	50312	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
115	NT_187094	AACG	2	8	50474	50481	50 %	0 %	25 %	25 %	409249753
116	NT_187094	CAGC	2	8	50563	50570	25 %	0 %	25 %	50 %	409249753
117	NT_187094	CCAG	2	8	50829	50836	25 %	0 %	25 %	50 %	409249753
118	NT_187094	GGCA	2	8	51169	51176	25 %	0 %	50 %	25 %	409249753
119	NT_187094	TCAG	2	8	51459	51466	25 %	25 %	25 %	25 %	409249753
120	NT_187094	GGCT	2	8	52323	52330	0 %	25 %	50 %	25 %	409249755
121	NT_187094	TACA	2	8	52409	52416	50 %	25 %	0 %	25 %	409249755
122	NT_187094	AGGT	2	8	52447	52454	25 %	25 %	50 %	0 %	409249755
123	NT_187094	CCCG	2	8	53666	53673	0 %	0 %	25 %	75 %	409249757
124	NT_187094	GCCC	2	8	53999	54006	0 %	0 %	25 %	75 %	409249757
125	NT_187094	TCTG	2	8	54255	54262	0 %	50 %	25 %	25 %	409249758
126	NT_187094	GAAT	2	8	54943	54950	50 %	25 %	25 %	0 %	409249759
127	NT_187094	CAGA	2	8	55242	55249	50 %	0 %	25 %	25 %	409249759
128	NT_187094	TGAT	2	8	55635	55642	25 %	50 %	25 %	0 %	409249760
129	NT_187094	CAGC	2	8	56242	56249	25 %	0 %	25 %	50 %	409249760
130	NT_187094	ACCC	2	8	56399	56406	25 %	0 %	0 %	75 %	409249760
131	NT_187094	CGGA	2	8	56496	56503	25 %	0 %	50 %	25 %	409249760
132	NT_187094	GGCG	2	8	56690	56697	0 %	0 %	75 %	25 %	409249760
133	NT_187094	TGGC	2	8	56770	56777	0 %	25 %	50 %	25 %	409249760
134	NT_187094	GTCG	2	8	57013	57020	0 %	25 %	50 %	25 %	409249760
135	NT_187094	CCCT	2	8	57236	57243	0 %	25 %	0 %	75 %	409249760
136	NT_187094	TGCG	2	8	57263	57270	0 %	25 %	50 %	25 %	409249760
137	NT_187094	CCGC	2	8	57395	57402	0 %	0 %	25 %	75 %	409249760
138	NT_187094	CTGG	2	8	57923	57930	0 %	25 %	50 %	25 %	409249760
139	NT_187094	ACCG	2	8	59083	59090	25 %	0 %	25 %	50 %	409249761
140	NT_187094	GGCA	2	8	59626	59633	25 %	0 %	50 %	25 %	409249762
141	NT_187094	CAGC	2	8	59794	59801	25 %	0 %	25 %	50 %	409249762
142	NT_187094	GTTG	2	8	60539	60546	0 %	50 %	50 %	0 %	409249762
143	NT_187094	ACTG	2	8	60878	60885	25 %	25 %	25 %	25 %	409249762
144	NT_187094	TATG	2	8	61190	61197	25 %	50 %	25 %	0 %	409249762
145	NT_187094	TCCG	2	8	61244	61251	0 %	25 %	25 %	50 %	409249762
146	NT_187094	GATG	2	8	61837	61844	25 %	25 %	50 %	0 %	409249763
147	NT_187094	CTGT	2	8	63115	63122	0 %	50 %	25 %	25 %	409249765
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149	NT_187094	GAAG	2	8	64213	64220	50 %	0 %	50 %	0 %	409249766

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.