MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187094	GAA	2	6	14	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187094	CCG	2	6	107	112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187094	GGC	2	6	116	121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187094	CAA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187094	TCT	2	6	3851	3856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187094	GAC	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187094	AAT	2	6	3904	3909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187094	GAG	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187094	ACA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187094	TGG	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187094	ATG	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187094	CTT	2	6	9927	9932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187094	TCA	2	6	10052	10057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187094	CAA	2	6	10133	10138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187094	AAT	2	6	10179	10184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187094	TAA	2	6	10600	10605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187094	TGG	2	6	11332	11337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187094	GTT	2	6	13711	13716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187094	TTA	2	6	16155	16160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187094	ACG	2	6	16272	16277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187094	GTT	2	6	16305	16310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187094	ACA	2	6	16350	16355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187094	GTT	2	6	19214	19219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187094	GCG	2	6	19343	19348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187094	ATA	2	6	19416	19421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187094	GAA	2	6	19434	19439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187094	CAT	2	6	19583	19588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187094	CCA	2	6	19607	19612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NT_187094	ATG	2	6	19628	19633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187094	CCT	2	6	21454	21459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NT_187094	GTT	2	6	25598	25603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187094	ACT	2	6	26030	26035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187094	CAG	2	6	26216	26221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187094	GGC	2	6	26230	26235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187094	CTG	2	6	26569	26574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187094	GGC	2	6	26617	26622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187094	TGA	2	6	26644	26649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187094	TGC	2	6	26655	26660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187094	TAT	2	6	26676	26681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187094	TGA	2	6	26711	26716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187094	TAG	2	6	26793	26798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187094	AAT	2	6	27281	27286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187094	AAT	2	6	27309	27314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187094	TGG	2	6	27978	27983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187094	AAT	2	6	31746	31751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187094	GAA	2	6	31758	31763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187094	AGC	2	6	31809	31814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187094	GGC	2	6	31831	31836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187094	GCG	2	6	31888	31893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187094	CAA	2	6	31977	31982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187094	GCG	2	6	32029	32034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187094	ACA	2	6	32062	32067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187094	AGT	2	6	32139	32144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187094	AGA	2	6	32462	32467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187094	GTT	2	6	32497	32502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187094	GTA	2	6	32530	32535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187094	TCG	2	6	32564	32569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187094	TGA	2	6	32603	32608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187094	ATT	2	6	32627	32632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187094	AAC	2	6	32702	32707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187094	CTG	2	6	32714	32719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187094	CAT	3	9	33362	33370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187094	TTC	2	6	34246	34251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187094	AAT	2	6	35093	35098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187094	TTA	2	6	35150	35155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187094	GGT	2	6	35213	35218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187094	GTC	2	6	35295	35300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187094	GAG	2	6	35323	35328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187094	TCT	2	6	35393	35398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187094	AAG	2	6	35438	35443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187094	CGG	2	6	35521	35526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187094	CAT	2	6	35551	35556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187094	TCA	2	6	35604	35609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187094	GCC	2	6	35863	35868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NT_187094	TCT	2	6	36372	36377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187094	TAT	2	6	36416	36421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187094	TTC	2	6	36425	36430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187094	TAT	2	6	36464	36469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187094	TCC	2	6	36498	36503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187094	GGA	2	6	36513	36518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187094	CTG	2	6	36639	36644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187094	TGT	2	6	36678	36683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187094	TTA	2	6	37423	37428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187094	ATC	2	6	37654	37659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187094	CGG	2	6	48427	48432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187094	TCA	2	6	48717	48722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187094	GCC	2	6	48749	48754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NT_187094	TGG	2	6	48789	48794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187094	CAG	2	6	48796	48801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187094	GGC	2	6	48856	48861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187094	CTG	3	9	52153	52161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187094	AAT	2	6	52183	52188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187094	TAA	2	6	53391	53396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187094	ACA	2	6	55496	55501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187094	CGG	2	6	55528	55533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187094	ACA	2	6	63312	63317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187094	TGT	2	6	63521	63526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187094	AGA	2	6	63641	63646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187094	GAA	2	6	64296	64301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187094	ATA	2	6	64346	64351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187094	TGA	2	6	64381	64386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187094	TAT	2	6	64468	64473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187094	GAA	2	6	64511	64516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187094	GCA	2	6	64615	64620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187094	ACC	2	6	64634	64639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NT_187094	CTT	2	6	64664	64669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.