MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187094	CAG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249696
2	NT_187094	CAG	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249696
3	NT_187094	TTC	2	6	386	391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249696
4	NT_187094	GTT	2	6	450	455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249696
5	NT_187094	GCA	2	6	468	473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249696
6	NT_187094	GAT	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249696
7	NT_187094	CGG	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249696
8	NT_187094	TGG	2	6	643	648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249696
9	NT_187094	ATT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249697
10	NT_187094	AAC	2	6	848	853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249697
11	NT_187094	GCG	2	6	871	876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249697
12	NT_187094	TCT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249697
13	NT_187094	ACT	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249697
14	NT_187094	GCC	2	6	1028	1033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249697
15	NT_187094	GGT	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249697
16	NT_187094	ATG	2	6	1124	1129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249697
17	NT_187094	GCT	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249697
18	NT_187094	ACT	2	6	1339	1344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249697
19	NT_187094	GCA	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249697
20	NT_187094	AAG	2	6	1509	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249697
21	NT_187094	CAC	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249697
22	NT_187094	CAG	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249697
23	NT_187094	GGC	2	6	1976	1981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249697
24	NT_187094	GGC	2	6	2208	2213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249698
25	NT_187094	TGC	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249698
26	NT_187094	AAC	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249698
27	NT_187094	GGC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249699
28	NT_187094	GTT	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249699
29	NT_187094	ATC	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
30	NT_187094	GTC	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249699
31	NT_187094	CAC	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249699
32	NT_187094	GCG	2	6	2850	2855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249699
33	NT_187094	CAA	2	6	2945	2950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249699
34	NT_187094	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249699
35	NT_187094	CAG	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249699
36	NT_187094	GCG	2	6	3113	3118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249699
37	NT_187094	GCT	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249699
38	NT_187094	TAT	2	6	3233	3238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249699
39	NT_187094	CAC	2	6	3251	3256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249699
40	NT_187094	TCA	2	6	3263	3268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
41	NT_187094	ATG	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249699
42	NT_187094	ATC	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
43	NT_187094	CAG	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249699
44	NT_187094	CAT	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249699
45	NT_187094	GTT	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249699
46	NT_187094	TTA	2	6	3814	3819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249699
47	NT_187094	ACA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249699
48	NT_187094	TCA	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
49	NT_187094	TCG	2	6	4003	4008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249700
50	NT_187094	GTA	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249700
51	NT_187094	TGG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249700
52	NT_187094	CAG	2	6	4578	4583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
53	NT_187094	CAG	2	6	4644	4649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
54	NT_187094	GCG	2	6	4754	4759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
55	NT_187094	CGA	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
56	NT_187094	CGC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249700
57	NT_187094	ACC	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249700
58	NT_187094	TGT	2	6	4966	4971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249700
59	NT_187094	CCA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249700
60	NT_187094	CCT	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249700
61	NT_187094	CGC	2	6	5393	5398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249700
62	NT_187094	GCT	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249700
63	NT_187094	TCA	2	6	5581	5586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
64	NT_187094	TGA	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249700
65	NT_187094	TCA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
66	NT_187094	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249700
67	NT_187094	CGG	2	6	5786	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
68	NT_187094	GCA	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
69	NT_187094	GCG	2	6	5953	5958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
70	NT_187094	CGG	2	6	5968	5973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
71	NT_187094	AGT	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249700
72	NT_187094	CGG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249700
73	NT_187094	GAG	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249700
74	NT_187094	CAG	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249700
75	NT_187094	AAG	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249700
76	NT_187094	TTC	2	6	6288	6293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249700
77	NT_187094	TGT	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249700
78	NT_187094	CAA	2	6	6507	6512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249700
79	NT_187094	CAT	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249700
80	NT_187094	GCC	2	6	6753	6758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249701
81	NT_187094	AAC	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249701
82	NT_187094	CGG	2	6	6799	6804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
83	NT_187094	GAT	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249701
84	NT_187094	ATA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249701
85	NT_187094	GCG	2	6	6955	6960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
86	NT_187094	CGG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
87	NT_187094	GCG	2	6	7072	7077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
88	NT_187094	CGC	2	6	7100	7105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249701
89	NT_187094	GCA	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249701
90	NT_187094	GCG	2	6	7259	7264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249701
91	NT_187094	ACC	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249702
92	NT_187094	TCG	2	6	7513	7518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249702
93	NT_187094	TGC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249702
94	NT_187094	TCT	2	6	7602	7607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249702
95	NT_187094	CAC	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249702
96	NT_187094	AAC	2	6	7743	7748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249702
97	NT_187094	TCG	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249702
98	NT_187094	TGA	3	9	8100	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249703
99	NT_187094	GCC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249703
100	NT_187094	TGA	2	6	8199	8204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249703
101	NT_187094	AAT	2	6	8209	8214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249703
102	NT_187094	TGG	2	6	8301	8306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249703
103	NT_187094	CGC	2	6	8453	8458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249703
104	NT_187094	GGC	2	6	8484	8489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249703
105	NT_187094	TGG	2	6	8510	8515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249703
106	NT_187094	CAC	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249703
107	NT_187094	GGC	2	6	8557	8562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249703
108	NT_187094	GGC	2	6	8619	8624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249703
109	NT_187094	ATG	2	6	8683	8688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249703
110	NT_187094	GTG	2	6	8719	8724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249703
111	NT_187094	GCG	2	6	8734	8739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249703
112	NT_187094	TTG	2	6	8816	8821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249703
113	NT_187094	GAT	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249703
114	NT_187094	GTG	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249703
115	NT_187094	ACG	2	6	8863	8868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249703
116	NT_187094	GCG	2	6	8959	8964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249703
117	NT_187094	CGA	2	6	8973	8978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249703
118	NT_187094	TGC	2	6	9044	9049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249703
119	NT_187094	GTG	2	6	9057	9062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249703
120	NT_187094	GTT	2	6	9250	9255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249704
121	NT_187094	TGG	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249704
122	NT_187094	AAT	2	6	9362	9367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249704
123	NT_187094	TCT	2	6	9376	9381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249704
124	NT_187094	AAG	2	6	9402	9407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249704
125	NT_187094	CGG	2	6	9626	9631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249704
126	NT_187094	CAC	2	6	9710	9715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249704
127	NT_187094	GCG	2	6	9766	9771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249704
128	NT_187094	TCA	2	6	9846	9851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249704
129	NT_187094	ACG	2	6	10239	10244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249705
130	NT_187094	CTG	2	6	10247	10252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249705
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373	NT_187094	ACC	2	6	31100	31105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249730
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498	NT_187094	TGG	2	6	42620	42625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249743
499	NT_187094	CCA	2	6	42626	42631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249743
500	NT_187094	TGC	2	6	42653	42658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249743

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