MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187094	TA	3	6	236	241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187094	AT	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	409249697
3	NT_187094	CG	3	6	1499	1504	0 %	0 %	50 %	50 %	409249697
4	NT_187094	TG	3	6	1686	1691	0 %	50 %	50 %	0 %	409249697
5	NT_187094	GC	3	6	1767	1772	0 %	0 %	50 %	50 %	409249697
6	NT_187094	TC	3	6	1798	1803	0 %	50 %	0 %	50 %	409249697
7	NT_187094	GC	3	6	1854	1859	0 %	0 %	50 %	50 %	409249697
8	NT_187094	GA	3	6	2402	2407	50 %	0 %	50 %	0 %	409249698
9	NT_187094	TG	3	6	2604	2609	0 %	50 %	50 %	0 %	409249699
10	NT_187094	GC	3	6	3563	3568	0 %	0 %	50 %	50 %	409249699
11	NT_187094	CG	4	8	4218	4225	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
12	NT_187094	GC	3	6	4682	4687	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
13	NT_187094	GC	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
14	NT_187094	GC	3	6	4868	4873	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
15	NT_187094	CA	3	6	5585	5590	50 %	0 %	0 %	50 %	409249700
16	NT_187094	GC	3	6	5830	5835	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
17	NT_187094	CG	3	6	6023	6028	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
18	NT_187094	CG	3	6	6534	6539	0 %	0 %	50 %	50 %	409249700
19	NT_187094	CG	3	6	6991	6996	0 %	0 %	50 %	50 %	409249701
20	NT_187094	CA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	0 %	50 %	409249701
21	NT_187094	GC	4	8	7299	7306	0 %	0 %	50 %	50 %	409249701
22	NT_187094	CG	3	6	7877	7882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NT_187094	CG	3	6	8263	8268	0 %	0 %	50 %	50 %	409249703
24	NT_187094	GC	3	6	8427	8432	0 %	0 %	50 %	50 %	409249703
25	NT_187094	GT	3	6	8563	8568	0 %	50 %	50 %	0 %	409249703
26	NT_187094	GC	3	6	8696	8701	0 %	0 %	50 %	50 %	409249703
27	NT_187094	CG	3	6	8963	8968	0 %	0 %	50 %	50 %	409249703
28	NT_187094	CG	3	6	9104	9109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187094	AG	3	6	9311	9316	50 %	0 %	50 %	0 %	409249704
30	NT_187094	GC	3	6	9539	9544	0 %	0 %	50 %	50 %	409249704
31	NT_187094	TA	4	8	10117	10124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187094	GC	3	6	10289	10294	0 %	0 %	50 %	50 %	409249705
33	NT_187094	CA	3	6	10762	10767	50 %	0 %	0 %	50 %	409249706
34	NT_187094	GT	3	6	12017	12022	0 %	50 %	50 %	0 %	409249707
35	NT_187094	GC	3	6	12109	12114	0 %	0 %	50 %	50 %	409249707
36	NT_187094	CG	3	6	12346	12351	0 %	0 %	50 %	50 %	409249708
37	NT_187094	CG	3	6	12469	12474	0 %	0 %	50 %	50 %	409249708
38	NT_187094	TA	3	6	13169	13174	50 %	50 %	0 %	0 %	409249708
39	NT_187094	TG	3	6	13602	13607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187094	GC	3	6	14316	14321	0 %	0 %	50 %	50 %	409249709
41	NT_187094	CT	3	6	14538	14543	0 %	50 %	0 %	50 %	409249710
42	NT_187094	GC	3	6	14679	14684	0 %	0 %	50 %	50 %	409249710
43	NT_187094	CG	3	6	15196	15201	0 %	0 %	50 %	50 %	409249710
44	NT_187094	GC	3	6	15375	15380	0 %	0 %	50 %	50 %	409249710
45	NT_187094	GA	3	6	16182	16187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187094	CG	3	6	16665	16670	0 %	0 %	50 %	50 %	409249711
47	NT_187094	AT	3	6	17258	17263	50 %	50 %	0 %	0 %	409249712
48	NT_187094	GC	3	6	18189	18194	0 %	0 %	50 %	50 %	409249713
49	NT_187094	CG	4	8	19872	19879	0 %	0 %	50 %	50 %	409249715
50	NT_187094	GA	3	6	20281	20286	50 %	0 %	50 %	0 %	409249715
51	NT_187094	GA	3	6	20820	20825	50 %	0 %	50 %	0 %	409249715
52	NT_187094	AT	3	6	21027	21032	50 %	50 %	0 %	0 %	409249716
53	NT_187094	GC	3	6	21854	21859	0 %	0 %	50 %	50 %	409249718
54	NT_187094	GT	3	6	22365	22370	0 %	50 %	50 %	0 %	409249718
55	NT_187094	TC	3	6	22725	22730	0 %	50 %	0 %	50 %	409249719
56	NT_187094	CG	3	6	23780	23785	0 %	0 %	50 %	50 %	409249719
57	NT_187094	GT	3	6	24350	24355	0 %	50 %	50 %	0 %	409249719
58	NT_187094	GT	3	6	24671	24676	0 %	50 %	50 %	0 %	409249719
59	NT_187094	GC	3	6	25222	25227	0 %	0 %	50 %	50 %	409249719
60	NT_187094	AT	3	6	25589	25594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187094	GC	3	6	26101	26106	0 %	0 %	50 %	50 %	409249721
62	NT_187094	GT	3	6	27379	27384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187094	AG	3	6	27658	27663	50 %	0 %	50 %	0 %	409249724
64	NT_187094	CG	3	6	28072	28077	0 %	0 %	50 %	50 %	409249725
65	NT_187094	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	409249725
66	NT_187094	CG	3	6	29549	29554	0 %	0 %	50 %	50 %	409249726
67	NT_187094	TA	3	6	31085	31090	50 %	50 %	0 %	0 %	409249730
68	NT_187094	CG	3	6	31892	31897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NT_187094	TA	3	6	32132	32137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187094	GC	3	6	33714	33719	0 %	0 %	50 %	50 %	409249733
71	NT_187094	GC	3	6	33801	33806	0 %	0 %	50 %	50 %	409249733
72	NT_187094	TC	3	6	34399	34404	0 %	50 %	0 %	50 %	409249734
73	NT_187094	GT	3	6	34792	34797	0 %	50 %	50 %	0 %	409249734
74	NT_187094	AG	3	6	35351	35356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187094	CA	3	6	35608	35613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NT_187094	GT	3	6	36099	36104	0 %	50 %	50 %	0 %	409249735
77	NT_187094	CA	3	6	36552	36557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187094	TG	3	6	36753	36758	0 %	50 %	50 %	0 %	409249736
79	NT_187094	TG	3	6	37836	37841	0 %	50 %	50 %	0 %	409249737
80	NT_187094	CA	3	6	39184	39189	50 %	0 %	0 %	50 %	409249740
81	NT_187094	AT	3	6	39770	39775	50 %	50 %	0 %	0 %	409249741
82	NT_187094	TG	3	6	40176	40181	0 %	50 %	50 %	0 %	409249741
83	NT_187094	CG	3	6	42768	42773	0 %	0 %	50 %	50 %	409249743
84	NT_187094	AG	3	6	43302	43307	50 %	0 %	50 %	0 %	409249743
85	NT_187094	CG	3	6	43845	43850	0 %	0 %	50 %	50 %	409249744
86	NT_187094	GC	3	6	44148	44153	0 %	0 %	50 %	50 %	409249744
87	NT_187094	CT	3	6	44353	44358	0 %	50 %	0 %	50 %	409249744
88	NT_187094	GC	3	6	45131	45136	0 %	0 %	50 %	50 %	409249744
89	NT_187094	CA	3	6	47410	47415	50 %	0 %	0 %	50 %	409249750
90	NT_187094	CA	3	6	48913	48918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NT_187094	GC	3	6	49421	49426	0 %	0 %	50 %	50 %	409249753
92	NT_187094	CG	4	8	50188	50195	0 %	0 %	50 %	50 %	409249753
93	NT_187094	GC	3	6	50411	50416	0 %	0 %	50 %	50 %	409249753
94	NT_187094	TG	3	6	53138	53143	0 %	50 %	50 %	0 %	409249756
95	NT_187094	TC	3	6	53433	53438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NT_187094	AT	3	6	53439	53444	50 %	50 %	0 %	0 %	409249757
97	NT_187094	GC	3	6	53839	53844	0 %	0 %	50 %	50 %	409249757
98	NT_187094	AC	3	6	54796	54801	50 %	0 %	0 %	50 %	409249758
99	NT_187094	CA	3	6	55618	55623	50 %	0 %	0 %	50 %	409249760
100	NT_187094	GC	3	6	58344	58349	0 %	0 %	50 %	50 %	409249760
101	NT_187094	AG	3	6	58514	58519	50 %	0 %	50 %	0 %	409249760
102	NT_187094	TC	3	6	58818	58823	0 %	50 %	0 %	50 %	409249760
103	NT_187094	CG	3	6	58958	58963	0 %	0 %	50 %	50 %	409249761
104	NT_187094	CA	3	6	59720	59725	50 %	0 %	0 %	50 %	409249762
105	NT_187094	CG	3	6	59953	59958	0 %	0 %	50 %	50 %	409249762
106	NT_187094	GC	3	6	60865	60870	0 %	0 %	50 %	50 %	409249762
107	NT_187094	AT	3	6	61040	61045	50 %	50 %	0 %	0 %	409249762
108	NT_187094	GC	3	6	61304	61309	0 %	0 %	50 %	50 %	409249762
109	NT_187094	CG	3	6	61355	61360	0 %	0 %	50 %	50 %	409249762
110	NT_187094	AT	3	6	62323	62328	50 %	50 %	0 %	0 %	409249763
111	NT_187094	AT	3	6	62585	62590	50 %	50 %	0 %	0 %	409249764
112	NT_187094	AG	3	6	63437	63442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187094	TG	3	6	64415	64420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.