MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187093	ATG	2	6	110	115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249674
2	NT_187093	TTG	2	6	162	167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249674
3	NT_187093	GCC	2	6	296	301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249674
4	NT_187093	GCC	2	6	363	368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249674
5	NT_187093	TGC	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249674
6	NT_187093	CGC	2	6	446	451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249674
7	NT_187093	TGC	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249674
8	NT_187093	ATC	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249674
9	NT_187093	TTA	2	6	1088	1093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249675
10	NT_187093	GGA	3	9	1600	1608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249676
11	NT_187093	TGA	2	6	1704	1709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249676
12	NT_187093	GCC	2	6	1990	1995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249676
13	NT_187093	GAT	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249676
14	NT_187093	AAT	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249676
15	NT_187093	ACC	2	6	2108	2113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249677
16	NT_187093	TGA	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249677
17	NT_187093	TCC	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249677
18	NT_187093	CTG	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249677
19	NT_187093	TTC	2	6	2473	2478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249677
20	NT_187093	CGG	2	6	2500	2505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249677
21	NT_187093	GCA	2	6	2507	2512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249677
22	NT_187093	AAG	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249677
23	NT_187093	GCT	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249677
24	NT_187093	GGC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249677
25	NT_187093	GAA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249677
26	NT_187093	GAG	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249677
27	NT_187093	CCG	2	6	2972	2977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249677
28	NT_187093	ACC	2	6	3023	3028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249677
29	NT_187093	ATT	2	6	3038	3043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249677
30	NT_187093	GCG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249677
31	NT_187093	GTG	2	6	3200	3205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249677
32	NT_187093	ATG	3	9	3318	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249677
33	NT_187093	TAA	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249677
34	NT_187093	CTG	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249677
35	NT_187093	CGG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249677
36	NT_187093	TGC	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249677
37	NT_187093	TTA	2	6	3519	3524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249677
38	NT_187093	CGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249677
39	NT_187093	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249677
40	NT_187093	CGT	2	6	3773	3778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249677
41	NT_187093	AAC	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249677
42	NT_187093	AGG	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249677
43	NT_187093	CAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249677
44	NT_187093	TGA	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249678
45	NT_187093	CGC	2	6	4110	4115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249678
46	NT_187093	TGG	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249679
47	NT_187093	CGC	2	6	4176	4181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249679
48	NT_187093	CGG	2	6	4204	4209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249679
49	NT_187093	CGG	2	6	4222	4227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249679
50	NT_187093	CGG	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249679
51	NT_187093	GCT	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249679
52	NT_187093	TGA	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249679
53	NT_187093	TAA	2	6	4324	4329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249679
54	NT_187093	GCA	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249679
55	NT_187093	TGA	3	9	4751	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249679
56	NT_187093	TGG	2	6	4772	4777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249680
57	NT_187093	GAC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249680
58	NT_187093	CGC	2	6	4964	4969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249680
59	NT_187093	CGG	2	6	5017	5022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249680
60	NT_187093	TGA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249680
61	NT_187093	GCT	2	6	5195	5200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249680
62	NT_187093	GCC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249680
63	NT_187093	AGC	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249680
64	NT_187093	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249680
65	NT_187093	GCG	2	6	5318	5323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249680
66	NT_187093	CTG	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249680
67	NT_187093	GGA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249680
68	NT_187093	AGG	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249680
69	NT_187093	CAG	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249680
70	NT_187093	GAA	2	6	5613	5618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249680
71	NT_187093	CGG	2	6	5619	5624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249680
72	NT_187093	CAA	2	6	5667	5672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249680
73	NT_187093	GGA	3	9	5696	5704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249680
74	NT_187093	CAT	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249681
75	NT_187093	TGC	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249681
76	NT_187093	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249681
77	NT_187093	CGG	2	6	5982	5987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
78	NT_187093	ACA	2	6	6039	6044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249681
79	NT_187093	CTG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249681
80	NT_187093	CGG	2	6	6096	6101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
81	NT_187093	CGG	2	6	6194	6199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
82	NT_187093	GGC	2	6	6210	6215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
83	NT_187093	CAG	2	6	6403	6408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249681
84	NT_187093	GGC	2	6	6492	6497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
85	NT_187093	TGC	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249681
86	NT_187093	AGG	2	6	6603	6608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249681
87	NT_187093	GCC	2	6	6769	6774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249681
88	NT_187093	CGG	2	6	6779	6784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
89	NT_187093	GAA	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249681
90	NT_187093	TGG	2	6	6828	6833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249681
91	NT_187093	GGC	2	6	6858	6863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
92	NT_187093	GCA	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249681
93	NT_187093	ATG	2	6	6938	6943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249681
94	NT_187093	TGA	2	6	6957	6962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249681
95	NT_187093	CTG	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249681
96	NT_187093	AAC	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249681
97	NT_187093	CGG	2	6	7134	7139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249681
98	NT_187093	ACG	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249681
99	NT_187093	TTG	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249681
100	NT_187093	ACC	2	6	7228	7233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249682
101	NT_187093	CGG	2	6	7313	7318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249682
102	NT_187093	GAT	2	6	7348	7353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249682
103	NT_187093	ACC	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249682
104	NT_187093	TGG	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249682
105	NT_187093	CGG	2	6	7397	7402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249682
106	NT_187093	CTG	2	6	7440	7445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249682
107	NT_187093	CGC	2	6	7550	7555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249682
108	NT_187093	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249682
109	NT_187093	ACC	2	6	7632	7637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249683
110	NT_187093	GGT	2	6	7787	7792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249683
111	NT_187093	CGG	2	6	7817	7822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249683
112	NT_187093	GTT	2	6	7884	7889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249683
113	NT_187093	CGT	2	6	7938	7943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249683
114	NT_187093	GGA	2	6	7997	8002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249683
115	NT_187093	CCG	2	6	8089	8094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249683
116	NT_187093	ATT	2	6	8103	8108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249683
117	NT_187093	CTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249683
118	NT_187093	CGC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249683
119	NT_187093	CGG	2	6	8308	8313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249683
120	NT_187093	TGG	2	6	8371	8376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249683
121	NT_187093	CGG	2	6	8452	8457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249683
122	NT_187093	GCT	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249683
123	NT_187093	TTG	2	6	8515	8520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249683
124	NT_187093	CAA	2	6	8710	8715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249684
125	NT_187093	GAA	3	9	8820	8828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249684
126	NT_187093	TGT	2	6	8849	8854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249684
127	NT_187093	TGA	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249684
128	NT_187093	TGC	2	6	9038	9043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249684
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130	NT_187093	TGA	2	6	9120	9125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249685
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.