MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187091	AGCGC	2	10	480	489	20 %	0 %	40 %	40 %	409249555
2	NT_187091	AGACC	2	10	3059	3068	40 %	0 %	20 %	40 %	409249560
3	NT_187091	CAAAC	2	10	5822	5831	60 %	0 %	0 %	40 %	409249562
4	NT_187091	GCTGA	2	10	5927	5936	20 %	20 %	40 %	20 %	409249562
5	NT_187091	GGCAT	2	10	6254	6263	20 %	20 %	40 %	20 %	409249563
6	NT_187091	TTACG	2	10	6961	6970	20 %	40 %	20 %	20 %	409249563
7	NT_187091	AGCGT	2	10	9654	9663	20 %	20 %	40 %	20 %	409249566
8	NT_187091	GCGAC	2	10	12054	12063	20 %	0 %	40 %	40 %	409249568
9	NT_187091	GCGCG	2	10	19106	19115	0 %	0 %	60 %	40 %	409249579
10	NT_187091	GACAA	2	10	20865	20874	60 %	0 %	20 %	20 %	409249581
11	NT_187091	GGGCC	2	10	21580	21589	0 %	0 %	60 %	40 %	409249581
12	NT_187091	GGTTG	2	10	25264	25273	0 %	40 %	60 %	0 %	409249584
13	NT_187091	ACGTT	2	10	33932	33941	20 %	40 %	20 %	20 %	409249596
14	NT_187091	GCGTT	2	10	37789	37798	0 %	40 %	40 %	20 %	409249600
15	NT_187091	TCGCG	2	10	39502	39511	0 %	20 %	40 %	40 %	409249602
16	NT_187091	ATCCT	2	10	43155	43164	20 %	40 %	0 %	40 %	409249608
17	NT_187091	TCTGC	2	10	45060	45069	0 %	40 %	20 %	40 %	409249609
18	NT_187091	AATAC	2	10	48815	48824	60 %	20 %	0 %	20 %	409249614
19	NT_187091	GAAAG	2	10	51108	51117	60 %	0 %	40 %	0 %	409249616
20	NT_187091	AAACG	2	10	52077	52086	60 %	0 %	20 %	20 %	409249618
21	NT_187091	GCCAG	2	10	52576	52585	20 %	0 %	40 %	40 %	409249619
22	NT_187091	GCTGA	2	10	52911	52920	20 %	20 %	40 %	20 %	409249619
23	NT_187091	TAATT	2	10	54853	54862	40 %	60 %	0 %	0 %	409249622
24	NT_187091	ATTCC	2	10	56733	56742	20 %	40 %	0 %	40 %	409249625
25	NT_187091	CGGCG	2	10	57434	57443	0 %	0 %	60 %	40 %	409249625
26	NT_187091	CTTAT	2	10	59984	59993	20 %	60 %	0 %	20 %	409249629
27	NT_187091	TCGCG	2	10	61528	61537	0 %	20 %	40 %	40 %	409249630
28	NT_187091	GTCAG	2	10	63876	63885	20 %	20 %	40 %	20 %	409249632
29	NT_187091	ATCAA	2	10	67981	67990	60 %	20 %	0 %	20 %	409249635
30	NT_187091	CGGCG	2	10	71008	71017	0 %	0 %	60 %	40 %	409249639
31	NT_187091	CCGCT	2	10	73081	73090	0 %	20 %	20 %	60 %	409249640
32	NT_187091	AGCTT	2	10	73323	73332	20 %	40 %	20 %	20 %	409249641
33	NT_187091	CCGTT	2	10	74896	74905	0 %	40 %	20 %	40 %	409249643
34	NT_187091	GCCAT	2	10	74916	74925	20 %	20 %	20 %	40 %	409249643
35	NT_187091	TGAAA	2	10	76027	76036	60 %	20 %	20 %	0 %	409249643
36	NT_187091	GTTAC	2	10	76236	76245	20 %	40 %	20 %	20 %	409249643
37	NT_187091	CGGAA	2	10	77308	77317	40 %	0 %	40 %	20 %	409249644
38	NT_187091	GAACT	2	10	78289	78298	40 %	20 %	20 %	20 %	409249644
39	NT_187091	TAGAG	2	10	79905	79914	40 %	20 %	40 %	0 %	409249647
40	NT_187091	TGAAA	2	10	79929	79938	60 %	20 %	20 %	0 %	409249647
41	NT_187091	GCGGG	2	10	80236	80245	0 %	0 %	80 %	20 %	409249648
42	NT_187091	CTGAA	2	10	85488	85497	40 %	20 %	20 %	20 %	409249653
43	NT_187091	GCGAC	2	10	86059	86068	20 %	0 %	40 %	40 %	409249654
44	NT_187091	TATTT	2	10	88600	88609	20 %	80 %	0 %	0 %	409249658
45	NT_187091	GCGCA	2	10	90819	90828	20 %	0 %	40 %	40 %	409249661
46	NT_187091	CGCCA	2	10	91564	91573	20 %	0 %	20 %	60 %	409249662
47	NT_187091	AAACT	2	10	92849	92858	60 %	20 %	0 %	20 %	409249663
48	NT_187091	TCGCT	2	10	93028	93037	0 %	40 %	20 %	40 %	409249664

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.