MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187091	CA	3	6	859	864	50 %	0 %	0 %	50 %	409249555
2	NT_187091	TC	3	6	1501	1506	0 %	50 %	0 %	50 %	409249557
3	NT_187091	AG	3	6	1598	1603	50 %	0 %	50 %	0 %	409249557
4	NT_187091	AG	3	6	3639	3644	50 %	0 %	50 %	0 %	409249560
5	NT_187091	AT	3	6	3829	3834	50 %	50 %	0 %	0 %	409249560
6	NT_187091	GC	3	6	5733	5738	0 %	0 %	50 %	50 %	409249562
7	NT_187091	AC	3	6	6090	6095	50 %	0 %	0 %	50 %	409249563
8	NT_187091	AT	3	6	7043	7048	50 %	50 %	0 %	0 %	409249563
9	NT_187091	GC	3	6	7158	7163	0 %	0 %	50 %	50 %	409249563
10	NT_187091	GA	3	6	7292	7297	50 %	0 %	50 %	0 %	409249563
11	NT_187091	GC	3	6	7300	7305	0 %	0 %	50 %	50 %	409249563
12	NT_187091	AG	4	8	7465	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	409249563
13	NT_187091	GC	3	6	7521	7526	0 %	0 %	50 %	50 %	409249564
14	NT_187091	GC	3	6	7577	7582	0 %	0 %	50 %	50 %	409249564
15	NT_187091	TG	3	6	7654	7659	0 %	50 %	50 %	0 %	409249564
16	NT_187091	GC	3	6	7910	7915	0 %	0 %	50 %	50 %	409249564
17	NT_187091	GA	3	6	8723	8728	50 %	0 %	50 %	0 %	409249565
18	NT_187091	GC	3	6	8823	8828	0 %	0 %	50 %	50 %	409249565
19	NT_187091	GC	3	6	10862	10867	0 %	0 %	50 %	50 %	409249568
20	NT_187091	GC	3	6	11290	11295	0 %	0 %	50 %	50 %	409249568
21	NT_187091	TA	3	6	11589	11594	50 %	50 %	0 %	0 %	409249568
22	NT_187091	GC	3	6	11601	11606	0 %	0 %	50 %	50 %	409249568
23	NT_187091	CG	4	8	12263	12270	0 %	0 %	50 %	50 %	409249569
24	NT_187091	GC	3	6	14266	14271	0 %	0 %	50 %	50 %	409249572
25	NT_187091	GC	3	6	15368	15373	0 %	0 %	50 %	50 %	409249573
26	NT_187091	CG	3	6	16095	16100	0 %	0 %	50 %	50 %	409249574
27	NT_187091	GC	3	6	16109	16114	0 %	0 %	50 %	50 %	409249574
28	NT_187091	CG	3	6	16681	16686	0 %	0 %	50 %	50 %	409249575
29	NT_187091	CG	5	10	18497	18506	0 %	0 %	50 %	50 %	409249578
30	NT_187091	CG	4	8	18899	18906	0 %	0 %	50 %	50 %	409249579
31	NT_187091	GT	3	6	18967	18972	0 %	50 %	50 %	0 %	409249579
32	NT_187091	GC	3	6	19217	19222	0 %	0 %	50 %	50 %	409249579
33	NT_187091	GC	3	6	19295	19300	0 %	0 %	50 %	50 %	409249579
34	NT_187091	GC	4	8	19483	19490	0 %	0 %	50 %	50 %	409249579
35	NT_187091	AG	3	6	19530	19535	50 %	0 %	50 %	0 %	409249579
36	NT_187091	TC	3	6	19616	19621	0 %	50 %	0 %	50 %	409249579
37	NT_187091	AG	3	6	20589	20594	50 %	0 %	50 %	0 %	409249581
38	NT_187091	CG	4	8	21234	21241	0 %	0 %	50 %	50 %	409249581
39	NT_187091	GC	3	6	21335	21340	0 %	0 %	50 %	50 %	409249581
40	NT_187091	CG	3	6	23317	23322	0 %	0 %	50 %	50 %	409249583
41	NT_187091	CG	3	6	23660	23665	0 %	0 %	50 %	50 %	409249584
42	NT_187091	GA	3	6	24139	24144	50 %	0 %	50 %	0 %	409249584
43	NT_187091	GC	3	6	24350	24355	0 %	0 %	50 %	50 %	409249584
44	NT_187091	GC	4	8	24890	24897	0 %	0 %	50 %	50 %	409249584
45	NT_187091	CG	3	6	25230	25235	0 %	0 %	50 %	50 %	409249584
46	NT_187091	CG	4	8	25571	25578	0 %	0 %	50 %	50 %	409249586
47	NT_187091	CG	3	6	25666	25671	0 %	0 %	50 %	50 %	409249586
48	NT_187091	GC	3	6	26667	26672	0 %	0 %	50 %	50 %	409249587
49	NT_187091	GC	4	8	27319	27326	0 %	0 %	50 %	50 %	409249588
50	NT_187091	CG	3	6	27654	27659	0 %	0 %	50 %	50 %	409249588
51	NT_187091	AG	3	6	27950	27955	50 %	0 %	50 %	0 %	409249588
52	NT_187091	CA	3	6	28855	28860	50 %	0 %	0 %	50 %	409249590
53	NT_187091	CG	3	6	29716	29721	0 %	0 %	50 %	50 %	409249590
54	NT_187091	GC	3	6	30879	30884	0 %	0 %	50 %	50 %	409249592
55	NT_187091	GC	3	6	31488	31493	0 %	0 %	50 %	50 %	409249593
56	NT_187091	GC	3	6	32916	32921	0 %	0 %	50 %	50 %	409249596
57	NT_187091	CG	3	6	34073	34078	0 %	0 %	50 %	50 %	409249596
58	NT_187091	CT	3	6	34142	34147	0 %	50 %	0 %	50 %	409249596
59	NT_187091	GC	3	6	35111	35116	0 %	0 %	50 %	50 %	409249597
60	NT_187091	CG	3	6	35222	35227	0 %	0 %	50 %	50 %	409249597
61	NT_187091	GC	3	6	36491	36496	0 %	0 %	50 %	50 %	409249599
62	NT_187091	AT	4	8	36959	36966	50 %	50 %	0 %	0 %	409249599
63	NT_187091	CT	3	6	37878	37883	0 %	50 %	0 %	50 %	409249600
64	NT_187091	GC	3	6	38116	38121	0 %	0 %	50 %	50 %	409249601
65	NT_187091	GC	3	6	38554	38559	0 %	0 %	50 %	50 %	409249601
66	NT_187091	AG	3	6	38579	38584	50 %	0 %	50 %	0 %	409249601
67	NT_187091	CT	3	6	38625	38630	0 %	50 %	0 %	50 %	409249601
68	NT_187091	TA	3	6	38926	38931	50 %	50 %	0 %	0 %	409249601
69	NT_187091	GC	3	6	39239	39244	0 %	0 %	50 %	50 %	409249602
70	NT_187091	GC	3	6	39397	39402	0 %	0 %	50 %	50 %	409249602
71	NT_187091	GA	4	8	39728	39735	50 %	0 %	50 %	0 %	409249602
72	NT_187091	TG	3	6	40856	40861	0 %	50 %	50 %	0 %	409249604
73	NT_187091	GT	3	6	41088	41093	0 %	50 %	50 %	0 %	409249604
74	NT_187091	TC	3	6	41129	41134	0 %	50 %	0 %	50 %	409249604
75	NT_187091	GC	3	6	42241	42246	0 %	0 %	50 %	50 %	409249607
76	NT_187091	TG	3	6	43648	43653	0 %	50 %	50 %	0 %	409249608
77	NT_187091	CG	3	6	43895	43900	0 %	0 %	50 %	50 %	409249608
78	NT_187091	TG	3	6	44089	44094	0 %	50 %	50 %	0 %	409249608
79	NT_187091	CG	3	6	44500	44505	0 %	0 %	50 %	50 %	409249608
80	NT_187091	AT	3	6	44577	44582	50 %	50 %	0 %	0 %	409249608
81	NT_187091	GC	3	6	44848	44853	0 %	0 %	50 %	50 %	409249609
82	NT_187091	AG	3	6	46025	46030	50 %	0 %	50 %	0 %	409249611
83	NT_187091	CT	3	6	46158	46163	0 %	50 %	0 %	50 %	409249611
84	NT_187091	TA	3	6	46240	46245	50 %	50 %	0 %	0 %	409249611
85	NT_187091	TA	3	6	47968	47973	50 %	50 %	0 %	0 %	409249612
86	NT_187091	CA	3	6	50298	50303	50 %	0 %	0 %	50 %	409249615
87	NT_187091	GC	3	6	51025	51030	0 %	0 %	50 %	50 %	409249616
88	NT_187091	CG	3	6	51451	51456	0 %	0 %	50 %	50 %	409249617
89	NT_187091	GC	3	6	52774	52779	0 %	0 %	50 %	50 %	409249619
90	NT_187091	AG	3	6	53621	53626	50 %	0 %	50 %	0 %	409249620
91	NT_187091	GT	3	6	55126	55131	0 %	50 %	50 %	0 %	409249623
92	NT_187091	GA	3	6	56260	56265	50 %	0 %	50 %	0 %	409249624
93	NT_187091	GC	3	6	56356	56361	0 %	0 %	50 %	50 %	409249625
94	NT_187091	TG	3	6	56797	56802	0 %	50 %	50 %	0 %	409249625
95	NT_187091	CG	3	6	57510	57515	0 %	0 %	50 %	50 %	409249625
96	NT_187091	GC	3	6	57783	57788	0 %	0 %	50 %	50 %	409249626
97	NT_187091	CA	3	6	57846	57851	50 %	0 %	0 %	50 %	409249626
98	NT_187091	CG	3	6	57962	57967	0 %	0 %	50 %	50 %	409249626
99	NT_187091	AC	3	6	59064	59069	50 %	0 %	0 %	50 %	409249627
100	NT_187091	CG	3	6	59178	59183	0 %	0 %	50 %	50 %	409249627
101	NT_187091	CA	3	6	59204	59209	50 %	0 %	0 %	50 %	409249627
102	NT_187091	AG	3	6	60295	60300	50 %	0 %	50 %	0 %	409249629
103	NT_187091	GC	3	6	61263	61268	0 %	0 %	50 %	50 %	409249630
104	NT_187091	CG	3	6	61931	61936	0 %	0 %	50 %	50 %	409249631
105	NT_187091	AT	3	6	62149	62154	50 %	50 %	0 %	0 %	409249631
106	NT_187091	AG	3	6	62248	62253	50 %	0 %	50 %	0 %	409249631
107	NT_187091	GC	3	6	64238	64243	0 %	0 %	50 %	50 %	409249632
108	NT_187091	CT	3	6	65439	65444	0 %	50 %	0 %	50 %	409249633
109	NT_187091	CG	3	6	65576	65581	0 %	0 %	50 %	50 %	409249633
110	NT_187091	CG	4	8	65728	65735	0 %	0 %	50 %	50 %	409249633
111	NT_187091	CG	3	6	65917	65922	0 %	0 %	50 %	50 %	409249633
112	NT_187091	CG	3	6	67643	67648	0 %	0 %	50 %	50 %	409249635
113	NT_187091	TG	3	6	68178	68183	0 %	50 %	50 %	0 %	409249635
114	NT_187091	CG	3	6	68197	68202	0 %	0 %	50 %	50 %	409249635
115	NT_187091	GC	3	6	68775	68780	0 %	0 %	50 %	50 %	409249637
116	NT_187091	GC	3	6	68871	68876	0 %	0 %	50 %	50 %	409249637
117	NT_187091	CG	3	6	68922	68927	0 %	0 %	50 %	50 %	409249637
118	NT_187091	GC	3	6	69244	69249	0 %	0 %	50 %	50 %	409249637
119	NT_187091	AG	3	6	70254	70259	50 %	0 %	50 %	0 %	409249638
120	NT_187091	GC	3	6	70412	70417	0 %	0 %	50 %	50 %	409249638
121	NT_187091	GC	4	8	71157	71164	0 %	0 %	50 %	50 %	409249639
122	NT_187091	GC	3	6	71948	71953	0 %	0 %	50 %	50 %	409249639
123	NT_187091	TC	3	6	72249	72254	0 %	50 %	0 %	50 %	409249639
124	NT_187091	GC	3	6	72630	72635	0 %	0 %	50 %	50 %	409249639
125	NT_187091	GC	3	6	74094	74099	0 %	0 %	50 %	50 %	409249642
126	NT_187091	TG	3	6	74622	74627	0 %	50 %	50 %	0 %	409249643
127	NT_187091	CT	3	6	75021	75026	0 %	50 %	0 %	50 %	409249643
128	NT_187091	GC	3	6	75421	75426	0 %	0 %	50 %	50 %	409249643
129	NT_187091	GA	3	6	76152	76157	50 %	0 %	50 %	0 %	409249643
130	NT_187091	CG	3	6	76282	76287	0 %	0 %	50 %	50 %	409249643
131	NT_187091	CG	3	6	76862	76867	0 %	0 %	50 %	50 %	409249644
132	NT_187091	GC	3	6	76944	76949	0 %	0 %	50 %	50 %	409249644
133	NT_187091	GC	4	8	77193	77200	0 %	0 %	50 %	50 %	409249644
134	NT_187091	CG	4	8	77765	77772	0 %	0 %	50 %	50 %	409249644
135	NT_187091	GC	3	6	78336	78341	0 %	0 %	50 %	50 %	409249644
136	NT_187091	GA	3	6	78374	78379	50 %	0 %	50 %	0 %	409249644
137	NT_187091	GC	4	8	78493	78500	0 %	0 %	50 %	50 %	409249645
138	NT_187091	TG	3	6	78891	78896	0 %	50 %	50 %	0 %	409249646
139	NT_187091	GC	3	6	79259	79264	0 %	0 %	50 %	50 %	409249647
140	NT_187091	TG	3	6	79301	79306	0 %	50 %	50 %	0 %	409249647
141	NT_187091	AG	3	6	79468	79473	50 %	0 %	50 %	0 %	409249647
142	NT_187091	CG	3	6	80228	80233	0 %	0 %	50 %	50 %	409249648
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.