MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	TACCCA	2	12	6133	6144	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409249482
2	NT_187088	CGGTAT	2	12	11137	11148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409249487
3	NT_187088	CGAAGC	2	12	13165	13176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249489
4	NT_187088	GTTAGC	2	12	15056	15067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409249492
5	NT_187088	CTATGA	2	12	15314	15325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409249492
6	NT_187088	CCGCGC	2	12	18578	18589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249496
7	NT_187088	TCCTTT	2	12	23224	23235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249501
8	NT_187088	CGGTGG	2	12	36909	36920	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409249514
9	NT_187088	AGTGAC	2	12	39800	39811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409249516
10	NT_187088	TATCAA	2	12	42675	42686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	409249518
11	NT_187088	GCGGCT	2	12	44042	44053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409249519
12	NT_187088	TTATAA	2	12	44992	45003	50 %	50 %	0 %	0 %	409249520
13	NT_187088	TTCATT	2	12	50422	50433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409249525
14	NT_187088	TTTCTG	2	12	50454	50465	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409249525
15	NT_187088	GCCAGC	2	12	52729	52740	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249527
16	NT_187088	CGTCGC	2	12	54486	54497	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409249528
17	NT_187088	CGCCAG	2	12	56308	56319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249528
18	NT_187088	CCGGAG	2	12	57246	57257	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409249529
19	NT_187088	CGGTTT	2	12	59359	59370	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409249532
20	NT_187088	CAGCGT	2	12	62973	62984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409249534
21	NT_187088	CCCTGA	2	12	65259	65270	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409249537
22	NT_187088	GCAGGC	2	12	66232	66243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409249537
23	NT_187088	CCGCAG	2	12	67296	67307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249538
24	NT_187088	GTGGCT	2	12	69234	69245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409249540
25	NT_187088	GATGGT	2	12	71190	71201	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409249542
26	NT_187088	GCTCAG	2	12	73212	73223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409249544
27	NT_187088	CGGGTG	2	12	73370	73381	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409249544

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.