MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	AGTCA	2	10	1440	1449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NT_187088	CCCAT	2	10	8942	8951	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NT_187088	ATCAC	2	10	12179	12188	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NT_187088	TACTT	2	10	12192	12201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187088	GCGCT	2	10	16309	16318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NT_187088	CAGGG	2	10	21350	21359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NT_187088	TTCCA	2	10	22105	22114	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187088	TAACA	2	10	35973	35982	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NT_187088	CAGAG	2	10	40284	40293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NT_187088	ACGAT	2	10	42088	42097	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NT_187088	TTTTC	2	10	42329	42338	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NT_187088	TATGT	2	10	43063	43072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187088	GCGCT	2	10	48143	48152	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NT_187088	CTTTC	2	10	49882	49891	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NT_187088	GTTTT	2	10	71059	71068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187088	ACTGT	2	10	72146	72155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NT_187088	GCGTG	2	10	74519	74528	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NT_187088	GCCCG	2	10	74628	74637	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NT_187088	CGCAC	2	10	76553	76562	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NT_187088	GGAGG	2	10	77415	77424	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187088	GTGGC	2	10	77947	77956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.