MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	TTAT	2	8	426	433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187088	TTTA	2	8	454	461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187088	TAGA	2	8	834	841	50 %	25 %	25 %	0 %	409249476
4	NT_187088	ACAT	2	8	1006	1013	50 %	25 %	0 %	25 %	409249476
5	NT_187088	GACA	2	8	1115	1122	50 %	0 %	25 %	25 %	409249476
6	NT_187088	TTTA	2	8	1180	1187	25 %	75 %	0 %	0 %	409249476
7	NT_187088	GTTA	2	8	1381	1388	25 %	50 %	25 %	0 %	409249476
8	NT_187088	CTTC	2	8	1617	1624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NT_187088	ACTG	2	8	2332	2339	25 %	25 %	25 %	25 %	409249479
10	NT_187088	GCCA	2	8	2770	2777	25 %	0 %	25 %	50 %	409249479
11	NT_187088	TATC	2	8	2854	2861	25 %	50 %	0 %	25 %	409249479
12	NT_187088	GTGC	2	8	3571	3578	0 %	25 %	50 %	25 %	409249479
13	NT_187088	GTAG	2	8	5009	5016	25 %	25 %	50 %	0 %	409249482
14	NT_187088	GCCA	2	8	5610	5617	25 %	0 %	25 %	50 %	409249482
15	NT_187088	CAGC	2	8	5815	5822	25 %	0 %	25 %	50 %	409249482
16	NT_187088	CGCC	2	8	5866	5873	0 %	0 %	25 %	75 %	409249482
17	NT_187088	CCAT	2	8	8209	8216	25 %	25 %	0 %	50 %	409249484
18	NT_187088	GCCT	2	8	8317	8324	0 %	25 %	25 %	50 %	409249484
19	NT_187088	TCAA	2	8	8369	8376	50 %	25 %	0 %	25 %	409249484
20	NT_187088	AAAT	2	8	9316	9323	75 %	25 %	0 %	0 %	409249486
21	NT_187088	ATAC	2	8	9619	9626	50 %	25 %	0 %	25 %	409249486
22	NT_187088	TTGA	2	8	9818	9825	25 %	50 %	25 %	0 %	409249487
23	NT_187088	CGTA	2	8	10086	10093	25 %	25 %	25 %	25 %	409249487
24	NT_187088	ATAC	2	8	10457	10464	50 %	25 %	0 %	25 %	409249487
25	NT_187088	CGTC	2	8	10810	10817	0 %	25 %	25 %	50 %	409249487
26	NT_187088	CCCG	2	8	11278	11285	0 %	0 %	25 %	75 %	409249487
27	NT_187088	GGTC	2	8	11924	11931	0 %	25 %	50 %	25 %	409249488
28	NT_187088	TTTA	2	8	12122	12129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187088	TATG	2	8	12288	12295	25 %	50 %	25 %	0 %	409249489
30	NT_187088	CAGC	2	8	12331	12338	25 %	0 %	25 %	50 %	409249489
31	NT_187088	CGCC	2	8	12919	12926	0 %	0 %	25 %	75 %	409249489
32	NT_187088	GCCT	2	8	13847	13854	0 %	25 %	25 %	50 %	409249490
33	NT_187088	CGTG	2	8	14226	14233	0 %	25 %	50 %	25 %	409249490
34	NT_187088	CCGA	2	8	14507	14514	25 %	0 %	25 %	50 %	409249491
35	NT_187088	GGCG	2	8	14611	14618	0 %	0 %	75 %	25 %	409249491
36	NT_187088	CCTG	2	8	14638	14645	0 %	25 %	25 %	50 %	409249491
37	NT_187088	CTGG	2	8	15218	15225	0 %	25 %	50 %	25 %	409249492
38	NT_187088	CTGC	2	8	15888	15895	0 %	25 %	25 %	50 %	409249492
39	NT_187088	CTGG	2	8	16043	16050	0 %	25 %	50 %	25 %	409249493
40	NT_187088	ACAA	2	8	16255	16262	75 %	0 %	0 %	25 %	409249493
41	NT_187088	ACCG	2	8	16722	16729	25 %	0 %	25 %	50 %	409249494
42	NT_187088	CCCG	2	8	17155	17162	0 %	0 %	25 %	75 %	409249494
43	NT_187088	CAGC	2	8	17439	17446	25 %	0 %	25 %	50 %	409249495
44	NT_187088	CGTC	2	8	17455	17462	0 %	25 %	25 %	50 %	409249495
45	NT_187088	ATAA	2	8	18195	18202	75 %	25 %	0 %	0 %	409249496
46	NT_187088	ATGG	2	8	18685	18692	25 %	25 %	50 %	0 %	409249496
47	NT_187088	GCTG	2	8	19159	19166	0 %	25 %	50 %	25 %	409249496
48	NT_187088	CGAC	2	8	19177	19184	25 %	0 %	25 %	50 %	409249496
49	NT_187088	TGGC	2	8	19358	19365	0 %	25 %	50 %	25 %	409249496
50	NT_187088	TGGC	2	8	19954	19961	0 %	25 %	50 %	25 %	409249497
51	NT_187088	CGCC	2	8	20193	20200	0 %	0 %	25 %	75 %	409249497
52	NT_187088	GCTG	2	8	20337	20344	0 %	25 %	50 %	25 %	409249497
53	NT_187088	TCCT	2	8	20709	20716	0 %	50 %	0 %	50 %	409249498
54	NT_187088	GCTG	2	8	21144	21151	0 %	25 %	50 %	25 %	409249498
55	NT_187088	TATG	2	8	22049	22056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187088	TTAT	2	8	22263	22270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187088	TTAT	2	8	22392	22399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187088	TTTA	2	8	22573	22580	25 %	75 %	0 %	0 %	409249499
59	NT_187088	CGCT	2	8	22921	22928	0 %	25 %	25 %	50 %	409249500
60	NT_187088	CAAA	2	8	23030	23037	75 %	0 %	0 %	25 %	409249500
61	NT_187088	CGTC	2	8	23946	23953	0 %	25 %	25 %	50 %	409249501
62	NT_187088	ATAC	2	8	24015	24022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NT_187088	CTCC	2	8	24366	24373	0 %	25 %	0 %	75 %	409249502
64	NT_187088	GGCT	2	8	24716	24723	0 %	25 %	50 %	25 %	409249503
65	NT_187088	CTGG	2	8	26107	26114	0 %	25 %	50 %	25 %	409249503
66	NT_187088	AATA	2	8	26276	26283	75 %	25 %	0 %	0 %	409249503
67	NT_187088	GAAA	2	8	27114	27121	75 %	0 %	25 %	0 %	409249504
68	NT_187088	TACG	2	8	27264	27271	25 %	25 %	25 %	25 %	409249505
69	NT_187088	TCGC	2	8	27378	27385	0 %	25 %	25 %	50 %	409249505
70	NT_187088	GCTG	2	8	27453	27460	0 %	25 %	50 %	25 %	409249505
71	NT_187088	AGCG	2	8	29346	29353	25 %	0 %	50 %	25 %	409249508
72	NT_187088	CTTT	2	8	29811	29818	0 %	75 %	0 %	25 %	409249508
73	NT_187088	TTAT	2	8	30082	30089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187088	TAGC	2	8	30441	30448	25 %	25 %	25 %	25 %	409249509
75	NT_187088	CTGG	2	8	30811	30818	0 %	25 %	50 %	25 %	409249510
76	NT_187088	GGCG	2	8	30943	30950	0 %	0 %	75 %	25 %	409249510
77	NT_187088	CGTT	3	12	31292	31303	0 %	50 %	25 %	25 %	409249511
78	NT_187088	CTGG	2	8	31318	31325	0 %	25 %	50 %	25 %	409249511
79	NT_187088	TTAA	2	8	31657	31664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187088	CGGT	2	8	32098	32105	0 %	25 %	50 %	25 %	409249512
81	NT_187088	GGGC	2	8	32291	32298	0 %	0 %	75 %	25 %	409249512
82	NT_187088	TCCG	2	8	34043	34050	0 %	25 %	25 %	50 %	409249512
83	NT_187088	GCAA	2	8	34212	34219	50 %	0 %	25 %	25 %	409249512
84	NT_187088	AGCG	2	8	34941	34948	25 %	0 %	50 %	25 %	409249512
85	NT_187088	CGAT	2	8	35556	35563	25 %	25 %	25 %	25 %	409249512
86	NT_187088	ATTT	2	8	35804	35811	25 %	75 %	0 %	0 %	409249513
87	NT_187088	AATA	2	8	36032	36039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187088	ATTG	2	8	36112	36119	25 %	50 %	25 %	0 %	409249514
89	NT_187088	GGCT	2	8	36227	36234	0 %	25 %	50 %	25 %	409249514
90	NT_187088	CGGT	2	8	36400	36407	0 %	25 %	50 %	25 %	409249514
91	NT_187088	CTAT	2	8	36468	36475	25 %	50 %	0 %	25 %	409249514
92	NT_187088	GGCG	2	8	36901	36908	0 %	0 %	75 %	25 %	409249514
93	NT_187088	TATT	2	8	36993	37000	25 %	75 %	0 %	0 %	409249514
94	NT_187088	GCCA	2	8	37151	37158	25 %	0 %	25 %	50 %	409249514
95	NT_187088	TGGC	2	8	37396	37403	0 %	25 %	50 %	25 %	409249514
96	NT_187088	GCCT	2	8	37622	37629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NT_187088	ATAA	2	8	37871	37878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187088	TCAC	2	8	38160	38167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NT_187088	AAGC	2	8	38353	38360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NT_187088	GCGT	2	8	39115	39122	0 %	25 %	50 %	25 %	409249515
101	NT_187088	TGCG	2	8	39198	39205	0 %	25 %	50 %	25 %	409249515
102	NT_187088	CATT	2	8	39371	39378	25 %	50 %	0 %	25 %	409249516
103	NT_187088	TGAC	2	8	39637	39644	25 %	25 %	25 %	25 %	409249516
104	NT_187088	GTAA	2	8	40328	40335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187088	TAAC	2	8	40874	40881	50 %	25 %	0 %	25 %	409249517
106	NT_187088	GATA	2	8	40934	40941	50 %	25 %	25 %	0 %	409249517
107	NT_187088	ACAA	2	8	41125	41132	75 %	0 %	0 %	25 %	409249517
108	NT_187088	GTAA	2	8	41188	41195	50 %	25 %	25 %	0 %	409249517
109	NT_187088	AGTC	2	8	41219	41226	25 %	25 %	25 %	25 %	409249517
110	NT_187088	TTCA	2	8	42610	42617	25 %	50 %	0 %	25 %	409249518
111	NT_187088	CCTG	2	8	42731	42738	0 %	25 %	25 %	50 %	409249518
112	NT_187088	TGTT	2	8	43132	43139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187088	TATT	2	8	43320	43327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187088	AATA	2	8	44482	44489	75 %	25 %	0 %	0 %	409249519
115	NT_187088	TGGA	2	8	45245	45252	25 %	25 %	50 %	0 %	409249520
116	NT_187088	AATT	2	8	45660	45667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187088	AGCG	2	8	46135	46142	25 %	0 %	50 %	25 %	409249521
118	NT_187088	TATT	2	8	46416	46423	25 %	75 %	0 %	0 %	409249521
119	NT_187088	GGTT	2	8	46728	46735	0 %	50 %	50 %	0 %	409249521
120	NT_187088	TCAA	2	8	46969	46976	50 %	25 %	0 %	25 %	409249521
121	NT_187088	TTAC	2	8	47213	47220	25 %	50 %	0 %	25 %	409249522
122	NT_187088	GATG	2	8	47870	47877	25 %	25 %	50 %	0 %	409249522
123	NT_187088	CGGT	2	8	48430	48437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NT_187088	GCAT	2	8	48728	48735	25 %	25 %	25 %	25 %	409249523
125	NT_187088	ATTT	2	8	49404	49411	25 %	75 %	0 %	0 %	409249524
126	NT_187088	ATCC	2	8	49493	49500	25 %	25 %	0 %	50 %	409249524
127	NT_187088	ATAA	2	8	49552	49559	75 %	25 %	0 %	0 %	409249524
128	NT_187088	AAAT	2	8	49582	49589	75 %	25 %	0 %	0 %	409249524
129	NT_187088	ATTA	2	8	49618	49625	50 %	50 %	0 %	0 %	409249524
130	NT_187088	TAAA	2	8	50247	50254	75 %	25 %	0 %	0 %	409249525
131	NT_187088	GCCC	2	8	50491	50498	0 %	0 %	25 %	75 %	409249525
132	NT_187088	CATT	2	8	51000	51007	25 %	50 %	0 %	25 %	409249525
133	NT_187088	AATC	2	8	51450	51457	50 %	25 %	0 %	25 %	409249526
134	NT_187088	TAAA	2	8	51480	51487	75 %	25 %	0 %	0 %	409249526
135	NT_187088	CAGC	2	8	51579	51586	25 %	0 %	25 %	50 %	409249527
136	NT_187088	AGCC	2	8	52026	52033	25 %	0 %	25 %	50 %	409249527
137	NT_187088	CAGG	2	8	52247	52254	25 %	0 %	50 %	25 %	409249527
138	NT_187088	CGTG	2	8	52658	52665	0 %	25 %	50 %	25 %	409249527
139	NT_187088	ACTG	2	8	52917	52924	25 %	25 %	25 %	25 %	409249528
140	NT_187088	TCTG	2	8	53292	53299	0 %	50 %	25 %	25 %	409249528
141	NT_187088	CCCA	2	8	53630	53637	25 %	0 %	0 %	75 %	409249528
142	NT_187088	GCAG	2	8	53651	53658	25 %	0 %	50 %	25 %	409249528
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.