MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	GTC	2	6	59	64	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187088	CCA	2	6	115	120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187088	CTT	2	6	301	306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187088	ATT	2	6	328	333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187088	AAT	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187088	CAA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187088	CTT	2	6	490	495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187088	CTT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187088	AAT	2	6	1463	1468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187088	GAT	2	6	1546	1551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187088	AAT	2	6	1591	1596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187088	TGA	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187088	CCA	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NT_187088	AAC	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187088	CTT	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187088	CGC	2	6	9017	9022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NT_187088	GCG	2	6	9025	9030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187088	TAC	2	6	9066	9071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187088	TGG	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187088	CGC	2	6	9160	9165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187088	CGG	2	6	9188	9193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187088	GGT	2	6	9234	9239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187088	CCT	2	6	9785	9790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NT_187088	TAA	2	6	11394	11399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187088	TGT	2	6	11413	11418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187088	CGG	2	6	11467	11472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187088	GAA	3	9	11493	11501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187088	CGG	2	6	11553	11558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187088	ATT	2	6	12038	12043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187088	AAT	2	6	12052	12057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187088	ATT	3	9	12153	12161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187088	GAG	2	6	12280	12285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187088	GCA	3	9	16400	16408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187088	GTA	2	6	18075	18080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187088	ATG	2	6	20407	20412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187088	ATG	2	6	21378	21383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187088	ATT	2	6	21439	21444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187088	ACT	2	6	21455	21460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187088	GAT	2	6	21489	21494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187088	CTC	2	6	21604	21609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NT_187088	AGT	2	6	21724	21729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187088	TTA	2	6	21763	21768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187088	TTA	2	6	21953	21958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187088	TTA	2	6	21967	21972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187088	GAT	2	6	21978	21983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187088	ATT	2	6	22361	22366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187088	TGT	2	6	22381	22386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187088	CAT	2	6	23997	24002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187088	GTT	2	6	24119	24124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187088	TTA	2	6	24601	24606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187088	AAC	2	6	27756	27761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187088	TCC	2	6	29284	29289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NT_187088	TAC	2	6	29899	29904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187088	CCT	2	6	29958	29963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NT_187088	AAT	2	6	30006	30011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187088	TTG	2	6	30026	30031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187088	TTA	2	6	30099	30104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187088	TGA	2	6	30196	30201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187088	GAG	2	6	30221	30226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187088	CTC	2	6	30230	30235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NT_187088	ATG	2	6	30250	30255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187088	CCG	3	9	30504	30512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NT_187088	CGG	2	6	30519	30524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187088	ACC	2	6	35940	35945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187088	ATT	2	6	37582	37587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187088	GGC	2	6	37609	37614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187088	GGT	2	6	37959	37964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187088	AAT	2	6	38022	38027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187088	AAT	2	6	38063	38068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187088	ATT	2	6	38101	38106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187088	TGT	2	6	38116	38121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187088	TAG	2	6	38125	38130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187088	AGT	2	6	38215	38220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187088	ACA	2	6	38222	38227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187088	GGT	3	9	38251	38259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187088	TCA	2	6	38279	38284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187088	GTG	2	6	38318	38323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187088	CGT	2	6	38341	38346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187088	TGT	2	6	39283	39288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187088	CAG	2	6	39301	39306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187088	AGG	2	6	40336	40341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187088	CAT	2	6	42078	42083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187088	AGC	2	6	42212	42217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187088	ATT	2	6	42274	42279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187088	TGC	2	6	43083	43088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187088	GCA	2	6	43211	43216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187088	TTA	2	6	43226	43231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187088	TTG	2	6	43314	43319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187088	ATT	2	6	43428	43433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187088	TTG	2	6	43465	43470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187088	ATG	2	6	43495	43500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187088	TTC	2	6	43521	43526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187088	TGA	2	6	44717	44722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187088	GAT	2	6	45558	45563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187088	TGG	2	6	48122	48127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187088	GCC	2	6	48185	48190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187088	TCG	2	6	48317	48322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187088	GGC	2	6	48516	48521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187088	CTT	2	6	48562	48567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187088	AGA	2	6	48578	48583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187088	ATA	3	9	48587	48595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187088	CTC	2	6	48629	48634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NT_187088	ATG	2	6	48643	48648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187088	TCC	2	6	49224	49229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NT_187088	TCT	2	6	49936	49941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187088	TGT	2	6	50002	50007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187088	ATT	2	6	50013	50018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187088	CAC	2	6	50054	50059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NT_187088	ATT	2	6	50099	50104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187088	TGT	2	6	56410	56415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187088	CTG	2	6	70131	70136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187088	GAT	2	6	70152	70157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187088	TAA	2	6	70908	70913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187088	TTC	2	6	70985	70990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187088	GTT	2	6	71014	71019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187088	TCA	2	6	71308	71313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187088	TTA	2	6	72083	72088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187088	CGG	2	6	72115	72120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187088	CGC	2	6	72160	72165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187088	GAA	2	6	74397	74402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187088	CGG	2	6	74435	74440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187088	AGA	2	6	74553	74558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187088	GCT	2	6	74583	74588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187088	TAC	2	6	74600	74605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187088	CAG	2	6	74664	74669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187088	GTC	2	6	74820	74825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187088	GTG	2	6	74976	74981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187088	CGC	2	6	75032	75037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NT_187088	GCC	2	6	75039	75044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NT_187088	CGC	2	6	75102	75107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NT_187088	GGC	2	6	75201	75206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187088	GGC	2	6	75210	75215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187088	CAG	2	6	75224	75229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187088	GCC	2	6	75403	75408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NT_187088	ATG	2	6	75518	75523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187088	AGC	2	6	75542	75547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187088	TGC	2	6	75629	75634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187088	GTG	2	6	75664	75669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187088	CGT	2	6	75677	75682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187088	CGG	2	6	75716	75721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187088	CGG	2	6	75746	75751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.