MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	TC	3	6	1021	1026	0 %	50 %	0 %	50 %	409249476
2	NT_187088	AT	3	6	1362	1367	50 %	50 %	0 %	0 %	409249476
3	NT_187088	TC	3	6	2555	2560	0 %	50 %	0 %	50 %	409249479
4	NT_187088	GC	3	6	2727	2732	0 %	0 %	50 %	50 %	409249479
5	NT_187088	GC	3	6	3019	3024	0 %	0 %	50 %	50 %	409249479
6	NT_187088	GA	3	6	3889	3894	50 %	0 %	50 %	0 %	409249479
7	NT_187088	TA	3	6	4540	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	409249481
8	NT_187088	TC	3	6	4570	4575	0 %	50 %	0 %	50 %	409249481
9	NT_187088	CT	3	6	4609	4614	0 %	50 %	0 %	50 %	409249481
10	NT_187088	CG	3	6	5395	5400	0 %	0 %	50 %	50 %	409249482
11	NT_187088	GC	3	6	6062	6067	0 %	0 %	50 %	50 %	409249482
12	NT_187088	CG	3	6	6819	6824	0 %	0 %	50 %	50 %	409249483
13	NT_187088	GC	3	6	7799	7804	0 %	0 %	50 %	50 %	409249484
14	NT_187088	CG	3	6	8148	8153	0 %	0 %	50 %	50 %	409249484
15	NT_187088	CG	3	6	8194	8199	0 %	0 %	50 %	50 %	409249484
16	NT_187088	GC	3	6	9431	9436	0 %	0 %	50 %	50 %	409249486
17	NT_187088	GC	3	6	9528	9533	0 %	0 %	50 %	50 %	409249486
18	NT_187088	CG	3	6	11978	11983	0 %	0 %	50 %	50 %	409249488
19	NT_187088	TC	3	6	12360	12365	0 %	50 %	0 %	50 %	409249489
20	NT_187088	AG	3	6	12589	12594	50 %	0 %	50 %	0 %	409249489
21	NT_187088	AT	3	6	13105	13110	50 %	50 %	0 %	0 %	409249489
22	NT_187088	GC	5	10	13764	13773	0 %	0 %	50 %	50 %	409249490
23	NT_187088	CG	3	6	13883	13888	0 %	0 %	50 %	50 %	409249490
24	NT_187088	GC	3	6	14000	14005	0 %	0 %	50 %	50 %	409249490
25	NT_187088	GC	4	8	14359	14366	0 %	0 %	50 %	50 %	409249491
26	NT_187088	CG	3	6	14480	14485	0 %	0 %	50 %	50 %	409249491
27	NT_187088	GC	3	6	14532	14537	0 %	0 %	50 %	50 %	409249491
28	NT_187088	GC	3	6	16675	16680	0 %	0 %	50 %	50 %	409249494
29	NT_187088	GC	3	6	17169	17174	0 %	0 %	50 %	50 %	409249494
30	NT_187088	GC	3	6	17504	17509	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
31	NT_187088	GC	3	6	17606	17611	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
32	NT_187088	CG	3	6	17854	17859	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
33	NT_187088	GC	3	6	17965	17970	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
34	NT_187088	GC	3	6	17989	17994	0 %	0 %	50 %	50 %	409249495
35	NT_187088	CG	3	6	19471	19476	0 %	0 %	50 %	50 %	409249496
36	NT_187088	AG	3	6	19842	19847	50 %	0 %	50 %	0 %	409249497
37	NT_187088	GC	3	6	20933	20938	0 %	0 %	50 %	50 %	409249498
38	NT_187088	GC	3	6	22906	22911	0 %	0 %	50 %	50 %	409249500
39	NT_187088	GC	3	6	23807	23812	0 %	0 %	50 %	50 %	409249501
40	NT_187088	GC	3	6	25896	25901	0 %	0 %	50 %	50 %	409249503
41	NT_187088	GC	3	6	25989	25994	0 %	0 %	50 %	50 %	409249503
42	NT_187088	GC	3	6	26157	26162	0 %	0 %	50 %	50 %	409249503
43	NT_187088	GA	3	6	26813	26818	50 %	0 %	50 %	0 %	409249504
44	NT_187088	GC	4	8	27223	27230	0 %	0 %	50 %	50 %	409249505
45	NT_187088	GC	3	6	27461	27466	0 %	0 %	50 %	50 %	409249505
46	NT_187088	AC	3	6	28029	28034	50 %	0 %	0 %	50 %	409249506
47	NT_187088	AT	3	6	28642	28647	50 %	50 %	0 %	0 %	409249506
48	NT_187088	GC	3	6	28677	28682	0 %	0 %	50 %	50 %	409249506
49	NT_187088	GA	3	6	28775	28780	50 %	0 %	50 %	0 %	409249506
50	NT_187088	AG	3	6	29356	29361	50 %	0 %	50 %	0 %	409249508
51	NT_187088	GC	3	6	29589	29594	0 %	0 %	50 %	50 %	409249508
52	NT_187088	GC	3	6	30696	30701	0 %	0 %	50 %	50 %	409249510
53	NT_187088	CG	3	6	32676	32681	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
54	NT_187088	GC	3	6	32706	32711	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
55	NT_187088	CG	3	6	33808	33813	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
56	NT_187088	GT	3	6	33998	34003	0 %	50 %	50 %	0 %	409249512
57	NT_187088	GT	4	8	34162	34169	0 %	50 %	50 %	0 %	409249512
58	NT_187088	GC	3	6	34300	34305	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
59	NT_187088	GC	3	6	34553	34558	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
60	NT_187088	GC	3	6	34615	34620	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
61	NT_187088	CG	3	6	35092	35097	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
62	NT_187088	AG	3	6	35162	35167	50 %	0 %	50 %	0 %	409249512
63	NT_187088	CG	3	6	35201	35206	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
64	NT_187088	GC	3	6	35291	35296	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
65	NT_187088	GA	3	6	35362	35367	50 %	0 %	50 %	0 %	409249512
66	NT_187088	CG	3	6	35590	35595	0 %	0 %	50 %	50 %	409249512
67	NT_187088	GC	3	6	36821	36826	0 %	0 %	50 %	50 %	409249514
68	NT_187088	TA	3	6	37125	37130	50 %	50 %	0 %	0 %	409249514
69	NT_187088	GC	3	6	37341	37346	0 %	0 %	50 %	50 %	409249514
70	NT_187088	GT	3	6	38503	38508	0 %	50 %	50 %	0 %	409249515
71	NT_187088	GC	3	6	38598	38603	0 %	0 %	50 %	50 %	409249515
72	NT_187088	CG	3	6	39109	39114	0 %	0 %	50 %	50 %	409249515
73	NT_187088	TG	3	6	40069	40074	0 %	50 %	50 %	0 %	409249516
74	NT_187088	CG	3	6	40076	40081	0 %	0 %	50 %	50 %	409249516
75	NT_187088	AT	3	6	40129	40134	50 %	50 %	0 %	0 %	409249516
76	NT_187088	AT	3	6	44536	44541	50 %	50 %	0 %	0 %	409249519
77	NT_187088	TA	3	6	45197	45202	50 %	50 %	0 %	0 %	409249520
78	NT_187088	GA	3	6	45383	45388	50 %	0 %	50 %	0 %	409249520
79	NT_187088	AT	3	6	48778	48783	50 %	50 %	0 %	0 %	409249523
80	NT_187088	AT	3	6	49321	49326	50 %	50 %	0 %	0 %	409249524
81	NT_187088	TA	3	6	50266	50271	50 %	50 %	0 %	0 %	409249525
82	NT_187088	TG	3	6	50961	50966	0 %	50 %	50 %	0 %	409249525
83	NT_187088	AT	3	6	51093	51098	50 %	50 %	0 %	0 %	409249526
84	NT_187088	GC	3	6	51813	51818	0 %	0 %	50 %	50 %	409249527
85	NT_187088	GC	3	6	51851	51856	0 %	0 %	50 %	50 %	409249527
86	NT_187088	GT	3	6	52373	52378	0 %	50 %	50 %	0 %	409249527
87	NT_187088	GC	3	6	52671	52676	0 %	0 %	50 %	50 %	409249527
88	NT_187088	CG	3	6	52829	52834	0 %	0 %	50 %	50 %	409249527
89	NT_187088	GC	3	6	53097	53102	0 %	0 %	50 %	50 %	409249528
90	NT_187088	AG	3	6	53947	53952	50 %	0 %	50 %	0 %	409249528
91	NT_187088	GC	3	6	54089	54094	0 %	0 %	50 %	50 %	409249528
92	NT_187088	GT	3	6	54524	54529	0 %	50 %	50 %	0 %	409249528
93	NT_187088	AG	3	6	55385	55390	50 %	0 %	50 %	0 %	409249528
94	NT_187088	GC	3	6	56562	56567	0 %	0 %	50 %	50 %	409249529
95	NT_187088	CG	3	6	56592	56597	0 %	0 %	50 %	50 %	409249529
96	NT_187088	AT	3	6	57725	57730	50 %	50 %	0 %	0 %	409249529
97	NT_187088	GC	3	6	57756	57761	0 %	0 %	50 %	50 %	409249529
98	NT_187088	GC	3	6	58318	58323	0 %	0 %	50 %	50 %	409249530
99	NT_187088	CG	3	6	58763	58768	0 %	0 %	50 %	50 %	409249531
100	NT_187088	GC	3	6	58847	58852	0 %	0 %	50 %	50 %	409249531
101	NT_187088	GT	3	6	59276	59281	0 %	50 %	50 %	0 %	409249532
102	NT_187088	GC	3	6	60332	60337	0 %	0 %	50 %	50 %	409249532
103	NT_187088	GC	3	6	60604	60609	0 %	0 %	50 %	50 %	409249532
104	NT_187088	TC	4	8	62031	62038	0 %	50 %	0 %	50 %	409249533
105	NT_187088	GC	3	6	64794	64799	0 %	0 %	50 %	50 %	409249536
106	NT_187088	GC	3	6	65325	65330	0 %	0 %	50 %	50 %	409249537
107	NT_187088	GA	3	6	65468	65473	50 %	0 %	50 %	0 %	409249537
108	NT_187088	GC	3	6	66081	66086	0 %	0 %	50 %	50 %	409249537
109	NT_187088	AG	3	6	66214	66219	50 %	0 %	50 %	0 %	409249537
110	NT_187088	GC	3	6	67038	67043	0 %	0 %	50 %	50 %	409249538
111	NT_187088	AG	3	6	67736	67741	50 %	0 %	50 %	0 %	409249538
112	NT_187088	CG	3	6	68565	68570	0 %	0 %	50 %	50 %	409249539
113	NT_187088	AT	3	6	68623	68628	50 %	50 %	0 %	0 %	409249540
114	NT_187088	TC	3	6	68805	68810	0 %	50 %	0 %	50 %	409249540
115	NT_187088	GC	3	6	69364	69369	0 %	0 %	50 %	50 %	409249540
116	NT_187088	CA	3	6	71661	71666	50 %	0 %	0 %	50 %	409249543
117	NT_187088	GC	4	8	71968	71975	0 %	0 %	50 %	50 %	409249543
118	NT_187088	GC	3	6	72511	72516	0 %	0 %	50 %	50 %	409249544
119	NT_187088	CG	3	6	73485	73490	0 %	0 %	50 %	50 %	409249544

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.