MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187088	A	6	6	935	940	100 %	0 %	0 %	0 %	409249476
2	NT_187088	A	7	7	1267	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	409249476
3	NT_187088	A	7	7	1469	1475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187088	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	409249477
5	NT_187088	T	6	6	1719	1724	0 %	100 %	0 %	0 %	409249477
6	NT_187088	A	6	6	2106	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	409249478
7	NT_187088	A	6	6	3257	3262	100 %	0 %	0 %	0 %	409249479
8	NT_187088	T	6	6	3460	3465	0 %	100 %	0 %	0 %	409249479
9	NT_187088	T	6	6	3917	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	409249479
10	NT_187088	A	7	7	4080	4086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187088	G	6	6	4160	4165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187088	T	6	6	5280	5285	0 %	100 %	0 %	0 %	409249482
13	NT_187088	A	7	7	5319	5325	100 %	0 %	0 %	0 %	409249482
14	NT_187088	T	7	7	6792	6798	0 %	100 %	0 %	0 %	409249483
15	NT_187088	A	6	6	8812	8817	100 %	0 %	0 %	0 %	409249485
16	NT_187088	T	6	6	10394	10399	0 %	100 %	0 %	0 %	409249487
17	NT_187088	T	6	6	11654	11659	0 %	100 %	0 %	0 %	409249488
18	NT_187088	A	6	6	14294	14299	100 %	0 %	0 %	0 %	409249490
19	NT_187088	A	6	6	15116	15121	100 %	0 %	0 %	0 %	409249492
20	NT_187088	G	7	7	15900	15906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187088	A	8	8	16331	16338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187088	A	6	6	17240	17245	100 %	0 %	0 %	0 %	409249495
23	NT_187088	A	7	7	18005	18011	100 %	0 %	0 %	0 %	409249495
24	NT_187088	A	8	8	18104	18111	100 %	0 %	0 %	0 %	409249496
25	NT_187088	A	6	6	18801	18806	100 %	0 %	0 %	0 %	409249496
26	NT_187088	T	6	6	19638	19643	0 %	100 %	0 %	0 %	409249497
27	NT_187088	T	6	6	20251	20256	0 %	100 %	0 %	0 %	409249497
28	NT_187088	A	7	7	20413	20419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187088	A	6	6	21217	21222	100 %	0 %	0 %	0 %	409249498
30	NT_187088	T	6	6	21443	21448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187088	A	6	6	21642	21647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187088	T	6	6	22039	22044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187088	T	6	6	22222	22227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187088	T	6	6	22251	22256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187088	A	6	6	22548	22553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187088	G	6	6	23266	23271	0 %	0 %	100 %	0 %	409249501
37	NT_187088	A	6	6	24634	24639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187088	A	6	6	25578	25583	100 %	0 %	0 %	0 %	409249503
39	NT_187088	A	6	6	26501	26506	100 %	0 %	0 %	0 %	409249503
40	NT_187088	A	6	6	26981	26986	100 %	0 %	0 %	0 %	409249504
41	NT_187088	A	6	6	27779	27784	100 %	0 %	0 %	0 %	409249506
42	NT_187088	A	6	6	28194	28199	100 %	0 %	0 %	0 %	409249506
43	NT_187088	T	6	6	29155	29160	0 %	100 %	0 %	0 %	409249507
44	NT_187088	A	6	6	30412	30417	100 %	0 %	0 %	0 %	409249509
45	NT_187088	T	7	7	30525	30531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187088	A	7	7	30602	30608	100 %	0 %	0 %	0 %	409249510
47	NT_187088	T	6	6	30672	30677	0 %	100 %	0 %	0 %	409249510
48	NT_187088	T	6	6	31160	31165	0 %	100 %	0 %	0 %	409249510
49	NT_187088	T	6	6	34220	34225	0 %	100 %	0 %	0 %	409249512
50	NT_187088	A	7	7	35764	35770	100 %	0 %	0 %	0 %	409249513
51	NT_187088	A	6	6	35850	35855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187088	T	6	6	38000	38005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187088	T	6	6	38819	38824	0 %	100 %	0 %	0 %	409249515
54	NT_187088	A	6	6	39317	39322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187088	T	6	6	40166	40171	0 %	100 %	0 %	0 %	409249516
56	NT_187088	A	7	7	40314	40320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187088	T	7	7	40913	40919	0 %	100 %	0 %	0 %	409249517
58	NT_187088	A	6	6	41148	41153	100 %	0 %	0 %	0 %	409249517
59	NT_187088	C	6	6	41494	41499	0 %	0 %	0 %	100 %	409249517
60	NT_187088	A	6	6	41715	41720	100 %	0 %	0 %	0 %	409249517
61	NT_187088	A	6	6	41735	41740	100 %	0 %	0 %	0 %	409249517
62	NT_187088	T	6	6	41915	41920	0 %	100 %	0 %	0 %	409249517
63	NT_187088	A	8	8	43844	43851	100 %	0 %	0 %	0 %	409249519
64	NT_187088	A	7	7	44067	44073	100 %	0 %	0 %	0 %	409249519
65	NT_187088	T	7	7	44116	44122	0 %	100 %	0 %	0 %	409249519
66	NT_187088	A	6	6	44489	44494	100 %	0 %	0 %	0 %	409249519
67	NT_187088	T	6	6	44690	44695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187088	A	7	7	45278	45284	100 %	0 %	0 %	0 %	409249520
69	NT_187088	A	7	7	45756	45762	100 %	0 %	0 %	0 %	409249521
70	NT_187088	T	7	7	46231	46237	0 %	100 %	0 %	0 %	409249521
71	NT_187088	T	6	6	47367	47372	0 %	100 %	0 %	0 %	409249522
72	NT_187088	A	7	7	47796	47802	100 %	0 %	0 %	0 %	409249522
73	NT_187088	A	7	7	48218	48224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187088	G	6	6	48267	48272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187088	C	6	6	48447	48452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NT_187088	G	8	8	48524	48531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187088	T	6	6	49292	49297	0 %	100 %	0 %	0 %	409249524
78	NT_187088	A	7	7	49522	49528	100 %	0 %	0 %	0 %	409249524
79	NT_187088	A	7	7	49599	49605	100 %	0 %	0 %	0 %	409249524
80	NT_187088	T	6	6	49919	49924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187088	T	7	7	49941	49947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187088	T	8	8	50081	50088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187088	T	6	6	50872	50877	0 %	100 %	0 %	0 %	409249525
84	NT_187088	T	7	7	51180	51186	0 %	100 %	0 %	0 %	409249526
85	NT_187088	T	7	7	51312	51318	0 %	100 %	0 %	0 %	409249526
86	NT_187088	G	8	8	51531	51538	0 %	0 %	100 %	0 %	409249527
87	NT_187088	C	7	7	55354	55360	0 %	0 %	0 %	100 %	409249528
88	NT_187088	T	6	6	56925	56930	0 %	100 %	0 %	0 %	409249529
89	NT_187088	T	6	6	59600	59605	0 %	100 %	0 %	0 %	409249532
90	NT_187088	T	6	6	60284	60289	0 %	100 %	0 %	0 %	409249532
91	NT_187088	T	7	7	61477	61483	0 %	100 %	0 %	0 %	409249533
92	NT_187088	G	6	6	62231	62236	0 %	0 %	100 %	0 %	409249534
93	NT_187088	T	6	6	62294	62299	0 %	100 %	0 %	0 %	409249534
94	NT_187088	G	6	6	62957	62962	0 %	0 %	100 %	0 %	409249534
95	NT_187088	T	6	6	63425	63430	0 %	100 %	0 %	0 %	409249535
96	NT_187088	T	8	8	63865	63872	0 %	100 %	0 %	0 %	409249535
97	NT_187088	C	6	6	64487	64492	0 %	0 %	0 %	100 %	409249536
98	NT_187088	A	6	6	66224	66229	100 %	0 %	0 %	0 %	409249537
99	NT_187088	A	6	6	67121	67126	100 %	0 %	0 %	0 %	409249538
100	NT_187088	T	7	7	70871	70877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187088	T	6	6	70945	70950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187088	T	6	6	71065	71070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187088	T	6	6	71091	71096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187088	A	7	7	71203	71209	100 %	0 %	0 %	0 %	409249542
105	NT_187088	A	7	7	72051	72057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187088	A	6	6	74391	74396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187088	A	7	7	75584	75590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187088	G	6	6	77031	77036	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.