MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187085	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187085	AGC	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187085	ACA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187085	GGC	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187085	GAT	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187085	ATA	2	6	729	734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187085	CGG	2	6	765	770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187085	TAC	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187085	GGT	2	6	1050	1055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187085	GCC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187085	CTT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249424
12	NT_187085	GGT	2	6	1246	1251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249424
13	NT_187085	CAG	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249425
14	NT_187085	GGC	2	6	1310	1315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249425
15	NT_187085	CTG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187085	TTG	2	6	1447	1452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187085	GTT	2	6	1612	1617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187085	CAG	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187085	GGA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187085	GGA	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187085	TCT	2	6	1715	1720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187085	TCA	2	6	1724	1729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187085	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187085	CCG	2	6	1815	1820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187085	TTG	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187085	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249426
27	NT_187085	CTC	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249426
28	NT_187085	CAG	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249426
29	NT_187085	CCA	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NT_187085	CAG	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187085	CAG	2	6	2615	2620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187085	GCA	2	6	2694	2699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187085	ACA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249427
34	NT_187085	CAT	2	6	3069	3074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249427
35	NT_187085	TGA	3	9	3180	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249427
36	NT_187085	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249427
37	NT_187085	ATT	2	6	3388	3393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249427
38	NT_187085	TGC	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249427
39	NT_187085	TCA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249427
40	NT_187085	CTG	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249428
41	NT_187085	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
42	NT_187085	GCG	2	6	4113	4118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249428
43	NT_187085	ATC	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249428
44	NT_187085	CGG	2	6	4142	4147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249428
45	NT_187085	TGG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
46	NT_187085	ACG	2	6	4204	4209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249428
47	NT_187085	TGA	2	6	4235	4240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249428
48	NT_187085	CTG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249428
49	NT_187085	GTG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
50	NT_187085	GAT	2	6	4548	4553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249429
51	NT_187085	ACG	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
52	NT_187085	ACG	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
53	NT_187085	CGG	2	6	4643	4648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249429
54	NT_187085	GGC	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249429
55	NT_187085	CAG	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
56	NT_187085	CAA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249429
57	NT_187085	TCA	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249430
58	NT_187085	GAA	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249430
59	NT_187085	GCC	2	6	5034	5039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249430
60	NT_187085	GCT	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249430
61	NT_187085	GCA	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249430
62	NT_187085	CAG	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249430
63	NT_187085	CAG	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187085	TTA	2	6	5209	5214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187085	TGT	2	6	5236	5241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187085	ATT	2	6	5244	5249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187085	TGA	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187085	GAA	2	6	5294	5299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187085	TAA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187085	TGA	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187085	GCA	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187085	AAG	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187085	CCG	2	6	5665	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NT_187085	GCG	2	6	5701	5706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187085	ACA	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187085	TCG	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249431
77	NT_187085	TGC	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249431
78	NT_187085	GAC	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249431
79	NT_187085	TTA	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249431
80	NT_187085	TGC	3	9	6127	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187085	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187085	TAA	2	6	6391	6396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187085	AAC	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187085	TCA	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249432
85	NT_187085	TGG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249432
86	NT_187085	CGC	2	6	6630	6635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
87	NT_187085	CGG	2	6	6680	6685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249432
88	NT_187085	CCG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
89	NT_187085	GCA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249432
90	NT_187085	CAG	2	6	6969	6974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249432
91	NT_187085	CGC	3	9	7052	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
92	NT_187085	CAT	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187085	GCC	2	6	7334	7339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NT_187085	CGC	2	6	7485	7490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.