MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187084	TTTGC	2	10	308	317	0 %	60 %	20 %	20 %	409249397
2	NT_187084	GCTTC	2	10	741	750	0 %	40 %	20 %	40 %	409249397
3	NT_187084	CTGCG	2	10	1036	1045	0 %	20 %	40 %	40 %	409249397
4	NT_187084	GCGTG	2	10	4465	4474	0 %	20 %	60 %	20 %	409249399
5	NT_187084	GCAGC	2	10	6165	6174	20 %	0 %	40 %	40 %	409249400
6	NT_187084	TGGAA	2	10	7681	7690	40 %	20 %	40 %	0 %	409249403
7	NT_187084	AATTA	2	10	9029	9038	60 %	40 %	0 %	0 %	409249404
8	NT_187084	GGTAG	2	10	9119	9128	20 %	20 %	60 %	0 %	409249404
9	NT_187084	TGCTG	2	10	9826	9835	0 %	40 %	40 %	20 %	409249405
10	NT_187084	GGCGG	2	10	10855	10864	0 %	0 %	80 %	20 %	409249406
11	NT_187084	ATGGT	2	10	12068	12077	20 %	40 %	40 %	0 %	409249408
12	NT_187084	GCTGA	2	10	12724	12733	20 %	20 %	40 %	20 %	409249409
13	NT_187084	GCGTC	2	10	14802	14811	0 %	20 %	40 %	40 %	409249409
14	NT_187084	TGAGC	2	10	15924	15933	20 %	20 %	40 %	20 %	409249409
15	NT_187084	CTGCG	2	10	17845	17854	0 %	20 %	40 %	40 %	409249410
16	NT_187084	TTCCG	2	10	18520	18529	0 %	40 %	20 %	40 %	409249410
17	NT_187084	CGGCG	2	10	19953	19962	0 %	0 %	60 %	40 %	409249412
18	NT_187084	AGATG	2	10	20394	20403	40 %	20 %	40 %	0 %	409249412
19	NT_187084	GCGAC	2	10	24700	24709	20 %	0 %	40 %	40 %	409249415
20	NT_187084	GAAAA	2	10	25229	25238	80 %	0 %	20 %	0 %	409249416
21	NT_187084	GCCGC	2	10	26925	26934	0 %	0 %	40 %	60 %	409249417
22	NT_187084	TTTTA	2	10	27464	27473	20 %	80 %	0 %	0 %	409249419
23	NT_187084	AAACA	2	10	27554	27563	80 %	0 %	0 %	20 %	409249419
24	NT_187084	ACTTC	2	10	30677	30686	20 %	40 %	0 %	40 %	409249421

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.