MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187084	AGGC	2	8	390	397	25 %	0 %	50 %	25 %	409249397
2	NT_187084	CAGG	2	8	1290	1297	25 %	0 %	50 %	25 %	409249397
3	NT_187084	GGGC	2	8	1886	1893	0 %	0 %	75 %	25 %	409249397
4	NT_187084	CAGC	2	8	2611	2618	25 %	0 %	25 %	50 %	409249398
5	NT_187084	TTAC	2	8	2881	2888	25 %	50 %	0 %	25 %	409249398
6	NT_187084	TTAC	2	8	3544	3551	25 %	50 %	0 %	25 %	409249398
7	NT_187084	GATG	2	8	3701	3708	25 %	25 %	50 %	0 %	409249398
8	NT_187084	CGGA	2	8	3819	3826	25 %	0 %	50 %	25 %	409249398
9	NT_187084	CGGG	2	8	4844	4851	0 %	0 %	75 %	25 %	409249399
10	NT_187084	CTGG	2	8	5474	5481	0 %	25 %	50 %	25 %	409249400
11	NT_187084	TTTA	2	8	5762	5769	25 %	75 %	0 %	0 %	409249400
12	NT_187084	TGGC	2	8	5940	5947	0 %	25 %	50 %	25 %	409249400
13	NT_187084	AATT	2	8	6625	6632	50 %	50 %	0 %	0 %	409249401
14	NT_187084	CTTC	2	8	8228	8235	0 %	50 %	0 %	50 %	409249403
15	NT_187084	CTGC	2	8	8284	8291	0 %	25 %	25 %	50 %	409249403
16	NT_187084	ATCG	2	8	8690	8697	25 %	25 %	25 %	25 %	409249404
17	NT_187084	GAAA	2	8	8743	8750	75 %	0 %	25 %	0 %	409249404
18	NT_187084	GCCA	2	8	9189	9196	25 %	0 %	25 %	50 %	409249404
19	NT_187084	CTTT	2	8	9313	9320	0 %	75 %	0 %	25 %	409249404
20	NT_187084	GGCG	2	8	9593	9600	0 %	0 %	75 %	25 %	409249405
21	NT_187084	TCTG	2	8	9688	9695	0 %	50 %	25 %	25 %	409249405
22	NT_187084	TGGC	2	8	10063	10070	0 %	25 %	50 %	25 %	409249405
23	NT_187084	GCGT	2	8	10089	10096	0 %	25 %	50 %	25 %	409249405
24	NT_187084	AGAC	2	8	10343	10350	50 %	0 %	25 %	25 %	409249406
25	NT_187084	CGAT	2	8	11129	11136	25 %	25 %	25 %	25 %	409249407
26	NT_187084	GCCA	2	8	11520	11527	25 %	0 %	25 %	50 %	409249407
27	NT_187084	TCGC	2	8	12294	12301	0 %	25 %	25 %	50 %	409249409
28	NT_187084	GGCG	2	8	12519	12526	0 %	0 %	75 %	25 %	409249409
29	NT_187084	GCGT	2	8	12581	12588	0 %	25 %	50 %	25 %	409249409
30	NT_187084	AACG	2	8	12694	12701	50 %	0 %	25 %	25 %	409249409
31	NT_187084	CTGG	2	8	14082	14089	0 %	25 %	50 %	25 %	409249409
32	NT_187084	CCAG	2	8	14144	14151	25 %	0 %	25 %	50 %	409249409
33	NT_187084	AGCC	2	8	14263	14270	25 %	0 %	25 %	50 %	409249409
34	NT_187084	CGTG	2	8	16107	16114	0 %	25 %	50 %	25 %	409249409
35	NT_187084	ACGC	2	8	16254	16261	25 %	0 %	25 %	50 %	409249409
36	NT_187084	GGCT	2	8	16339	16346	0 %	25 %	50 %	25 %	409249409
37	NT_187084	TGTC	2	8	17112	17119	0 %	50 %	25 %	25 %	409249410
38	NT_187084	CTTC	2	8	17331	17338	0 %	50 %	0 %	50 %	409249410
39	NT_187084	CATG	2	8	17744	17751	25 %	25 %	25 %	25 %	409249410
40	NT_187084	CGAT	2	8	18472	18479	25 %	25 %	25 %	25 %	409249410
41	NT_187084	ATCT	2	8	18600	18607	25 %	50 %	0 %	25 %	409249410
42	NT_187084	TGCG	2	8	18666	18673	0 %	25 %	50 %	25 %	409249410
43	NT_187084	GCTG	2	8	18717	18724	0 %	25 %	50 %	25 %	409249410
44	NT_187084	TCAA	2	8	19339	19346	50 %	25 %	0 %	25 %	409249411
45	NT_187084	GCTG	2	8	20093	20100	0 %	25 %	50 %	25 %	409249412
46	NT_187084	TTGA	2	8	20278	20285	25 %	50 %	25 %	0 %	409249412
47	NT_187084	GGCT	2	8	21172	21179	0 %	25 %	50 %	25 %	409249413
48	NT_187084	CGTG	2	8	21377	21384	0 %	25 %	50 %	25 %	409249413
49	NT_187084	GTAA	2	8	21861	21868	50 %	25 %	25 %	0 %	409249414
50	NT_187084	CGCC	2	8	21986	21993	0 %	0 %	25 %	75 %	409249414
51	NT_187084	TTTG	2	8	22125	22132	0 %	75 %	25 %	0 %	409249414
52	NT_187084	TTAT	2	8	22943	22950	25 %	75 %	0 %	0 %	409249414
53	NT_187084	TTTC	2	8	23863	23870	0 %	75 %	0 %	25 %	409249415
54	NT_187084	GGTA	2	8	24622	24629	25 %	25 %	50 %	0 %	409249415
55	NT_187084	AGGA	2	8	24834	24841	50 %	0 %	50 %	0 %	409249415
56	NT_187084	CTTG	2	8	25173	25180	0 %	50 %	25 %	25 %	409249416
57	NT_187084	TCCA	2	8	26112	26119	25 %	25 %	0 %	50 %	409249417
58	NT_187084	CAAA	2	8	26481	26488	75 %	0 %	0 %	25 %	409249417
59	NT_187084	AAAC	2	8	26599	26606	75 %	0 %	0 %	25 %	409249417
60	NT_187084	ATGA	2	8	26760	26767	50 %	25 %	25 %	0 %	409249417
61	NT_187084	AATT	2	8	27365	27372	50 %	50 %	0 %	0 %	409249418
62	NT_187084	GCTG	2	8	29394	29401	0 %	25 %	50 %	25 %	409249420
63	NT_187084	GCAT	2	8	30489	30496	25 %	25 %	25 %	25 %	409249421
64	NT_187084	TCCT	2	8	31180	31187	0 %	50 %	0 %	50 %	409249421

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.