MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187084	ACG	2	6	207	212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249397
2	NT_187084	GTA	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249397
3	NT_187084	GCC	2	6	384	389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249397
4	NT_187084	CGC	2	6	422	427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249397
5	NT_187084	AGG	2	6	433	438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249397
6	NT_187084	GTC	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249397
7	NT_187084	CTG	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249397
8	NT_187084	GCA	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249397
9	NT_187084	GCA	2	6	776	781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249397
10	NT_187084	AGG	2	6	826	831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249397
11	NT_187084	TGC	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249397
12	NT_187084	GGC	2	6	984	989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249397
13	NT_187084	GGC	2	6	1052	1057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249397
14	NT_187084	GGA	2	6	1071	1076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249397
15	NT_187084	GAC	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249397
16	NT_187084	TGC	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249397
17	NT_187084	ATT	2	6	1137	1142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249397
18	NT_187084	CGG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249397
19	NT_187084	TTG	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249397
20	NT_187084	GGC	2	6	1669	1674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249397
21	NT_187084	TTA	2	6	1810	1815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249397
22	NT_187084	ATC	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249397
23	NT_187084	CAG	2	6	1905	1910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249397
24	NT_187084	GCG	2	6	2160	2165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249397
25	NT_187084	CAT	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249397
26	NT_187084	GTA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249397
27	NT_187084	CGT	3	9	2200	2208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249397
28	NT_187084	GCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249397
29	NT_187084	GGC	2	6	2275	2280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249397
30	NT_187084	CAG	2	6	2313	2318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249397
31	NT_187084	CCA	2	6	2342	2347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249397
32	NT_187084	GCT	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249397
33	NT_187084	ATC	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249397
34	NT_187084	CCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249398
35	NT_187084	CTC	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249398
36	NT_187084	GAT	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249398
37	NT_187084	TGG	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249398
38	NT_187084	TGA	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249398
39	NT_187084	GGT	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249398
40	NT_187084	ATG	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249398
41	NT_187084	CTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249398
42	NT_187084	GCT	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249398
43	NT_187084	CTT	3	9	2905	2913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249398
44	NT_187084	GTG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249398
45	NT_187084	ATC	2	6	2955	2960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249398
46	NT_187084	ATG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249398
47	NT_187084	ATC	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249398
48	NT_187084	GTT	2	6	3012	3017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249398
49	NT_187084	GCA	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249398
50	NT_187084	TGC	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249398
51	NT_187084	GTG	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249398
52	NT_187084	TCC	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249398
53	NT_187084	GGC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249398
54	NT_187084	GTT	2	6	3449	3454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249398
55	NT_187084	TGG	2	6	3619	3624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249398
56	NT_187084	TGA	2	6	3683	3688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249398
57	NT_187084	GGC	2	6	3854	3859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249398
58	NT_187084	CAA	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249398
59	NT_187084	CAT	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249398
60	NT_187084	CGG	2	6	3944	3949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249398
61	NT_187084	TGA	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249398
62	NT_187084	CTG	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249399
63	NT_187084	GGT	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249399
64	NT_187084	TGG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249399
65	NT_187084	CGG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249399
66	NT_187084	GCT	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249399
67	NT_187084	GAC	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249399
68	NT_187084	CGC	2	6	4624	4629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249399
69	NT_187084	GGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249399
70	NT_187084	ATT	2	6	4667	4672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249399
71	NT_187084	GCA	2	6	4690	4695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249399
72	NT_187084	TGG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249399
73	NT_187084	CGC	2	6	4816	4821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249399
74	NT_187084	GGC	2	6	4832	4837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249399
75	NT_187084	CCG	2	6	4961	4966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249399
76	NT_187084	ATC	2	6	5028	5033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249399
77	NT_187084	CTG	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249399
78	NT_187084	TGG	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249399
79	NT_187084	AGC	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249399
80	NT_187084	TGC	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249400
81	NT_187084	GCC	2	6	5370	5375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249400
82	NT_187084	TGC	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249400
83	NT_187084	GTC	2	6	5415	5420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249400
84	NT_187084	CGC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249400
85	NT_187084	GAA	2	6	5634	5639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249400
86	NT_187084	TGG	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249400
87	NT_187084	CCG	2	6	5770	5775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249400
88	NT_187084	GTT	2	6	5787	5792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249400
89	NT_187084	GCG	2	6	5795	5800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249400
90	NT_187084	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249400
91	NT_187084	ATA	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249400
92	NT_187084	TAC	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249400
93	NT_187084	CAG	3	9	6006	6014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249400
94	NT_187084	ATT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249400
95	NT_187084	TCT	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249400
96	NT_187084	GCG	2	6	6213	6218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249400
97	NT_187084	TGC	2	6	6241	6246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249400
98	NT_187084	TAT	2	6	6250	6255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249400
99	NT_187084	GGA	2	6	6335	6340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249400
100	NT_187084	TGC	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249400
101	NT_187084	ATC	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249401
102	NT_187084	ATC	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249401
103	NT_187084	TGA	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249401
104	NT_187084	TCG	2	6	6735	6740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249402
105	NT_187084	TCA	2	6	6741	6746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249402
106	NT_187084	ATT	2	6	6860	6865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249402
107	NT_187084	GGC	2	6	6911	6916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249402
108	NT_187084	CGA	2	6	6994	6999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249402
109	NT_187084	GAT	2	6	7033	7038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249402
110	NT_187084	CGG	2	6	7041	7046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249402
111	NT_187084	TTA	2	6	7047	7052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249402
112	NT_187084	GAA	2	6	7127	7132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249402
113	NT_187084	CGA	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249402
114	NT_187084	CCG	2	6	7303	7308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249402
115	NT_187084	CCG	2	6	7434	7439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249402
116	NT_187084	TTG	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249403
117	NT_187084	GCA	2	6	7846	7851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249403
118	NT_187084	TGC	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249403
119	NT_187084	GAC	2	6	8152	8157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249403
120	NT_187084	GGC	2	6	8463	8468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249403
121	NT_187084	GGC	2	6	8545	8550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249403
122	NT_187084	GCG	2	6	8683	8688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249404
123	NT_187084	ATC	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249404
124	NT_187084	CTT	3	9	8830	8838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249404
125	NT_187084	TAA	2	6	8863	8868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249404
126	NT_187084	CCG	2	6	8917	8922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249404
127	NT_187084	CGC	2	6	8947	8952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249404
128	NT_187084	TGT	2	6	9022	9027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249404
129	NT_187084	GCC	3	9	9071	9079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249404
130	NT_187084	GCA	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249404
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378	NT_187084	CAG	2	6	29728	29733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249420
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381	NT_187084	CAG	2	6	29965	29970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249420
382	NT_187084	GTC	2	6	29971	29976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249420
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400	NT_187084	TGT	2	6	31702	31707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249422

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.