MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187083	AGCGC	2	10	3050	3059	20 %	0 %	40 %	40 %	409249371
2	NT_187083	CCGTA	2	10	4888	4897	20 %	20 %	20 %	40 %	409249372
3	NT_187083	TCTGG	2	10	5095	5104	0 %	40 %	40 %	20 %	409249372
4	NT_187083	CCCTA	2	10	5290	5299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NT_187083	AAATC	2	10	9627	9636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NT_187083	CCCGT	2	10	9753	9762	0 %	20 %	20 %	60 %	409249376
7	NT_187083	AAAAT	2	10	10986	10995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187083	CATTG	2	10	11429	11438	20 %	40 %	20 %	20 %	409249377
9	NT_187083	GGATT	2	10	14159	14168	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187083	GAATG	2	10	14805	14814	40 %	20 %	40 %	0 %	409249381
11	NT_187083	GCCAT	2	10	18237	18246	20 %	20 %	20 %	40 %	409249383
12	NT_187083	AAGCA	2	10	19785	19794	60 %	0 %	20 %	20 %	409249384
13	NT_187083	ATTTG	2	10	20746	20755	20 %	60 %	20 %	0 %	409249385
14	NT_187083	TTTCT	2	10	20837	20846	0 %	80 %	0 %	20 %	409249385
15	NT_187083	AGTGA	2	10	21332	21341	40 %	20 %	40 %	0 %	409249385
16	NT_187083	CGTTC	2	10	22512	22521	0 %	40 %	20 %	40 %	409249386
17	NT_187083	GAGTT	2	10	22763	22772	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187083	GGGCG	2	10	23179	23188	0 %	0 %	80 %	20 %	409249387
19	NT_187083	CGCAG	2	10	24696	24705	20 %	0 %	40 %	40 %	409249389
20	NT_187083	TGGAC	2	10	26858	26867	20 %	20 %	40 %	20 %	409249392
21	NT_187083	TACAA	2	10	28614	28623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.