MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187081	CGGCG	2	10	127	136	0 %	0 %	60 %	40 %	409249207
2	NT_187081	TGGCA	2	10	1387	1396	20 %	20 %	40 %	20 %	409249208
3	NT_187081	GCGCT	2	10	2491	2500	0 %	20 %	40 %	40 %	409249209
4	NT_187081	GTACG	2	10	7027	7036	20 %	20 %	40 %	20 %	409249213
5	NT_187081	ACTCC	2	10	8783	8792	20 %	20 %	0 %	60 %	409249215
6	NT_187081	AGCGT	2	10	9710	9719	20 %	20 %	40 %	20 %	409249216
7	NT_187081	CCGCG	2	10	12286	12295	0 %	0 %	40 %	60 %	409249218
8	NT_187081	GCGCG	2	10	13900	13909	0 %	0 %	60 %	40 %	409249220
9	NT_187081	GGCGC	2	10	14420	14429	0 %	0 %	60 %	40 %	409249221
10	NT_187081	GCCTG	2	10	15845	15854	0 %	20 %	40 %	40 %	409249222
11	NT_187081	CGTAT	2	10	17063	17072	20 %	40 %	20 %	20 %	409249224
12	NT_187081	TGAAC	2	10	17460	17469	40 %	20 %	20 %	20 %	409249224
13	NT_187081	ACCGC	2	10	17618	17627	20 %	0 %	20 %	60 %	409249224
14	NT_187081	ATCAC	2	10	19031	19040	40 %	20 %	0 %	40 %	409249226
15	NT_187081	GTTAC	2	10	20638	20647	20 %	40 %	20 %	20 %	409249228
16	NT_187081	CCTCG	2	10	21911	21920	0 %	20 %	20 %	60 %	409249229
17	NT_187081	TGATG	2	10	22508	22517	20 %	40 %	40 %	0 %	409249229
18	NT_187081	TCGCG	2	10	23517	23526	0 %	20 %	40 %	40 %	409249229
19	NT_187081	CGGCG	2	10	24999	25008	0 %	0 %	60 %	40 %	409249230
20	NT_187081	TGTGG	2	10	26762	26771	0 %	40 %	60 %	0 %	409249231
21	NT_187081	CCGAA	2	10	28067	28076	40 %	0 %	20 %	40 %	409249233
22	NT_187081	TCCAT	2	10	28229	28238	20 %	40 %	0 %	40 %	409249233
23	NT_187081	CGCGC	2	10	28925	28934	0 %	0 %	40 %	60 %	409249234
24	NT_187081	ATCAC	2	10	31253	31262	40 %	20 %	0 %	40 %	409249235
25	NT_187081	GCCGC	2	10	32209	32218	0 %	0 %	40 %	60 %	409249236
26	NT_187081	ACATG	2	10	33638	33647	40 %	20 %	20 %	20 %	409249237
27	NT_187081	GAGGG	2	10	35641	35650	20 %	0 %	80 %	0 %	409249239
28	NT_187081	TGCTC	2	10	35732	35741	0 %	40 %	20 %	40 %	409249239
29	NT_187081	GGCCG	2	10	36179	36188	0 %	0 %	60 %	40 %	409249240
30	NT_187081	CCTGG	2	10	36454	36463	0 %	20 %	40 %	40 %	409249240
31	NT_187081	GACAG	2	10	37532	37541	40 %	0 %	40 %	20 %	409249241
32	NT_187081	CGGGC	2	10	39172	39181	0 %	0 %	60 %	40 %	409249242
33	NT_187081	AATAA	2	10	40829	40838	80 %	20 %	0 %	0 %	409249243
34	NT_187081	AATTA	2	10	43680	43689	60 %	40 %	0 %	0 %	409249244
35	NT_187081	GTCAG	2	10	45445	45454	20 %	20 %	40 %	20 %	409249246
36	NT_187081	TGGCG	2	10	45815	45824	0 %	20 %	60 %	20 %	409249246
37	NT_187081	AATCG	2	10	49684	49693	40 %	20 %	20 %	20 %	409249252
38	NT_187081	TCATT	2	10	50866	50875	20 %	60 %	0 %	20 %	409249254
39	NT_187081	CTCAC	2	10	51314	51323	20 %	20 %	0 %	60 %	409249254
40	NT_187081	CGCGG	2	10	58569	58578	0 %	0 %	60 %	40 %	409249262
41	NT_187081	CGAAA	2	10	59601	59610	60 %	0 %	20 %	20 %	409249263
42	NT_187081	CGGTA	2	10	59921	59930	20 %	20 %	40 %	20 %	409249263
43	NT_187081	CGCTG	2	10	62927	62936	0 %	20 %	40 %	40 %	409249266
44	NT_187081	CGCAG	2	10	63896	63905	20 %	0 %	40 %	40 %	409249266
45	NT_187081	TAATT	2	10	64859	64868	40 %	60 %	0 %	0 %	409249266
46	NT_187081	AAAGC	2	10	68087	68096	60 %	0 %	20 %	20 %	409249271
47	NT_187081	GTAAA	2	10	68341	68350	60 %	20 %	20 %	0 %	409249272
48	NT_187081	CGCTG	2	10	71600	71609	0 %	20 %	40 %	40 %	409249274
49	NT_187081	ATAGA	2	10	74674	74683	60 %	20 %	20 %	0 %	409249278
50	NT_187081	CCGGC	2	10	75562	75571	0 %	0 %	40 %	60 %	409249279
51	NT_187081	GCGAA	2	10	76914	76923	40 %	0 %	40 %	20 %	409249280
52	NT_187081	GTCAG	2	10	78110	78119	20 %	20 %	40 %	20 %	409249282
53	NT_187081	GCCTG	2	10	78603	78612	0 %	20 %	40 %	40 %	409249283
54	NT_187081	TGAGC	2	10	78674	78683	20 %	20 %	40 %	20 %	409249283
55	NT_187081	GTTTT	2	10	79037	79046	0 %	80 %	20 %	0 %	409249283
56	NT_187081	TGGAC	2	10	79231	79240	20 %	20 %	40 %	20 %	409249283
57	NT_187081	CCCGG	2	10	82852	82861	0 %	0 %	40 %	60 %	409249286
58	NT_187081	GCCGG	2	10	87040	87049	0 %	0 %	60 %	40 %	409249288
59	NT_187081	CGGCG	2	10	87106	87115	0 %	0 %	60 %	40 %	409249288
60	NT_187081	CATCG	2	10	88606	88615	20 %	20 %	20 %	40 %	409249290
61	NT_187081	ACGAA	2	10	91245	91254	60 %	0 %	20 %	20 %	409249292
62	NT_187081	GCGCG	2	10	91986	91995	0 %	0 %	60 %	40 %	409249293
63	NT_187081	ACGCC	2	10	94504	94513	20 %	0 %	20 %	60 %	409249295
64	NT_187081	CCGGA	2	10	95302	95311	20 %	0 %	40 %	40 %	409249296
65	NT_187081	GCAAT	2	10	95860	95869	40 %	20 %	20 %	20 %	409249296
66	NT_187081	CGGTG	2	10	97816	97825	0 %	20 %	60 %	20 %	409249298
67	NT_187081	TCGCT	2	10	97903	97912	0 %	40 %	20 %	40 %	409249298
68	NT_187081	GATCT	2	10	98168	98177	20 %	40 %	20 %	20 %	409249298
69	NT_187081	TTACC	2	10	98206	98215	20 %	40 %	0 %	40 %	409249298
70	NT_187081	CAGGG	2	10	98469	98478	20 %	0 %	60 %	20 %	409249299
71	NT_187081	ATATT	2	10	100633	100642	40 %	60 %	0 %	0 %	409249301
72	NT_187081	GGTTC	2	10	109124	109133	0 %	40 %	40 %	20 %	409249310
73	NT_187081	TTCGC	2	10	109145	109154	0 %	40 %	20 %	40 %	409249310
74	NT_187081	ACCGT	2	10	111437	111446	20 %	20 %	20 %	40 %	409249312
75	NT_187081	GGCGT	2	10	111722	111731	0 %	20 %	60 %	20 %	409249312
76	NT_187081	TTTAT	2	10	112603	112612	20 %	80 %	0 %	0 %	409249313
77	NT_187081	TGAGC	2	10	117017	117026	20 %	20 %	40 %	20 %	409249317
78	NT_187081	ACGCG	2	10	119988	119997	20 %	0 %	40 %	40 %	409249321
79	NT_187081	CGCGC	2	10	120900	120909	0 %	0 %	40 %	60 %	409249322
80	NT_187081	CCGGC	2	10	122593	122602	0 %	0 %	40 %	60 %	409249324
81	NT_187081	ATCGG	2	10	123921	123930	20 %	20 %	40 %	20 %	409249325
82	NT_187081	TGGTT	2	10	123992	124001	0 %	60 %	40 %	0 %	409249325
83	NT_187081	CACGT	2	10	125705	125714	20 %	20 %	20 %	40 %	409249327
84	NT_187081	GGCGC	2	10	125798	125807	0 %	0 %	60 %	40 %	409249327
85	NT_187081	CGGTA	2	10	129317	129326	20 %	20 %	40 %	20 %	409249330
86	NT_187081	TACGG	2	10	134166	134175	20 %	20 %	40 %	20 %	409249336
87	NT_187081	CCCGC	2	10	135251	135260	0 %	0 %	20 %	80 %	409249337
88	NT_187081	GCCTG	2	10	137138	137147	0 %	20 %	40 %	40 %	409249340
89	NT_187081	GCGCA	2	10	139635	139644	20 %	0 %	40 %	40 %	409249342
90	NT_187081	CGCGC	2	10	139826	139835	0 %	0 %	40 %	60 %	409249342
91	NT_187081	CGGCG	2	10	140029	140038	0 %	0 %	60 %	40 %	409249343
92	NT_187081	TTCGT	2	10	140117	140126	0 %	60 %	20 %	20 %	409249343
93	NT_187081	GGTCG	2	10	144525	144534	0 %	20 %	60 %	20 %	409249346
94	NT_187081	AATAA	2	10	146313	146322	80 %	20 %	0 %	0 %	409249347
95	NT_187081	ACGGT	2	10	147243	147252	20 %	20 %	40 %	20 %	409249348
96	NT_187081	CGCTT	2	10	148483	148492	0 %	40 %	20 %	40 %	409249349
97	NT_187081	GGCGG	2	10	150801	150810	0 %	0 %	80 %	20 %	409249351
98	NT_187081	GCGGA	2	10	151228	151237	20 %	0 %	60 %	20 %	409249351
99	NT_187081	AAACC	2	10	152849	152858	60 %	0 %	0 %	40 %	409249352
100	NT_187081	TTCTT	2	10	153369	153378	0 %	80 %	0 %	20 %	409249353
101	NT_187081	AGTGA	2	10	153873	153882	40 %	20 %	40 %	0 %	409249354
102	NT_187081	CTGGC	2	10	154251	154260	0 %	20 %	40 %	40 %	409249354
103	NT_187081	CGATG	2	10	155450	155459	20 %	20 %	40 %	20 %	409249354
104	NT_187081	TAGCT	2	10	156415	156424	20 %	40 %	20 %	20 %	409249356

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.