MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 392

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187081	CAGT	2	8	1372	1379	25 %	25 %	25 %	25 %	409249208
2	NT_187081	CTGC	2	8	1495	1502	0 %	25 %	25 %	50 %	409249208
3	NT_187081	CTGA	2	8	1728	1735	25 %	25 %	25 %	25 %	409249208
4	NT_187081	CCAG	2	8	1938	1945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NT_187081	TATT	2	8	1999	2006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187081	ATAA	2	8	2047	2054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187081	TGGT	2	8	5554	5561	0 %	50 %	50 %	0 %	409249212
8	NT_187081	CATA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	409249213
9	NT_187081	CAAT	2	8	6648	6655	50 %	25 %	0 %	25 %	409249213
10	NT_187081	GTGG	2	8	7157	7164	0 %	25 %	75 %	0 %	409249213
11	NT_187081	ACGG	2	8	7339	7346	25 %	0 %	50 %	25 %	409249214
12	NT_187081	GGAA	2	8	7446	7453	50 %	0 %	50 %	0 %	409249214
13	NT_187081	GCCA	2	8	7607	7614	25 %	0 %	25 %	50 %	409249214
14	NT_187081	TAAT	2	8	8439	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	409249215
15	NT_187081	TCGG	2	8	8622	8629	0 %	25 %	50 %	25 %	409249215
16	NT_187081	GCGA	2	8	8649	8656	25 %	0 %	50 %	25 %	409249215
17	NT_187081	CGCA	2	8	8957	8964	25 %	0 %	25 %	50 %	409249215
18	NT_187081	ACGG	2	8	9499	9506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NT_187081	AGCA	2	8	9620	9627	50 %	0 %	25 %	25 %	409249216
20	NT_187081	TTCA	2	8	9860	9867	25 %	50 %	0 %	25 %	409249216
21	NT_187081	GTAG	2	8	9932	9939	25 %	25 %	50 %	0 %	409249216
22	NT_187081	AAAT	2	8	10102	10109	75 %	25 %	0 %	0 %	409249216
23	NT_187081	CATT	2	8	10111	10118	25 %	50 %	0 %	25 %	409249216
24	NT_187081	CAGG	2	8	10670	10677	25 %	0 %	50 %	25 %	409249217
25	NT_187081	GGCG	2	8	11319	11326	0 %	0 %	75 %	25 %	409249217
26	NT_187081	CGCT	2	8	11366	11373	0 %	25 %	25 %	50 %	409249217
27	NT_187081	CGCC	2	8	11919	11926	0 %	0 %	25 %	75 %	409249217
28	NT_187081	ATGA	2	8	12096	12103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187081	CCTT	2	8	12198	12205	0 %	50 %	0 %	50 %	409249218
30	NT_187081	CAGA	2	8	13191	13198	50 %	0 %	25 %	25 %	409249219
31	NT_187081	AACG	2	8	13483	13490	50 %	0 %	25 %	25 %	409249220
32	NT_187081	ATGG	2	8	13627	13634	25 %	25 %	50 %	0 %	409249220
33	NT_187081	ACGG	2	8	14820	14827	25 %	0 %	50 %	25 %	409249221
34	NT_187081	GCCA	2	8	14900	14907	25 %	0 %	25 %	50 %	409249222
35	NT_187081	TAAA	2	8	15616	15623	75 %	25 %	0 %	0 %	409249222
36	NT_187081	GGTG	2	8	15905	15912	0 %	25 %	75 %	0 %	409249223
37	NT_187081	TAAA	2	8	15913	15920	75 %	25 %	0 %	0 %	409249223
38	NT_187081	TGCC	2	8	16010	16017	0 %	25 %	25 %	50 %	409249223
39	NT_187081	CCCT	2	8	16077	16084	0 %	25 %	0 %	75 %	409249223
40	NT_187081	ACAT	2	8	16393	16400	50 %	25 %	0 %	25 %	409249223
41	NT_187081	ATCA	2	8	16431	16438	50 %	25 %	0 %	25 %	409249223
42	NT_187081	AAAC	2	8	16882	16889	75 %	0 %	0 %	25 %	409249224
43	NT_187081	AATC	2	8	18445	18452	50 %	25 %	0 %	25 %	409249225
44	NT_187081	CCTA	2	8	20593	20600	25 %	25 %	0 %	50 %	409249228
45	NT_187081	GCGG	2	8	20696	20703	0 %	0 %	75 %	25 %	409249228
46	NT_187081	CTGG	2	8	21296	21303	0 %	25 %	50 %	25 %	409249228
47	NT_187081	CTTT	2	8	21352	21359	0 %	75 %	0 %	25 %	409249228
48	NT_187081	ACTA	2	8	21608	21615	50 %	25 %	0 %	25 %	409249228
49	NT_187081	GCCA	2	8	22363	22370	25 %	0 %	25 %	50 %	409249229
50	NT_187081	CCTG	2	8	22531	22538	0 %	25 %	25 %	50 %	409249229
51	NT_187081	GCTG	2	8	22573	22580	0 %	25 %	50 %	25 %	409249229
52	NT_187081	GCTG	2	8	22860	22867	0 %	25 %	50 %	25 %	409249229
53	NT_187081	GATG	2	8	23177	23184	25 %	25 %	50 %	0 %	409249229
54	NT_187081	TTAT	2	8	23341	23348	25 %	75 %	0 %	0 %	409249229
55	NT_187081	TAGT	2	8	24178	24185	25 %	50 %	25 %	0 %	409249230
56	NT_187081	AGCG	2	8	24355	24362	25 %	0 %	50 %	25 %	409249230
57	NT_187081	ATCG	2	8	24957	24964	25 %	25 %	25 %	25 %	409249230
58	NT_187081	AGAA	2	8	25580	25587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187081	GGGC	2	8	26677	26684	0 %	0 %	75 %	25 %	409249231
60	NT_187081	GCCA	2	8	27092	27099	25 %	0 %	25 %	50 %	409249232
61	NT_187081	GACC	2	8	27337	27344	25 %	0 %	25 %	50 %	409249232
62	NT_187081	GCCG	2	8	27601	27608	0 %	0 %	50 %	50 %	409249232
63	NT_187081	TGGC	2	8	27763	27770	0 %	25 %	50 %	25 %	409249232
64	NT_187081	AAGG	2	8	27822	27829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187081	TACT	2	8	28639	28646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NT_187081	GCTG	2	8	28827	28834	0 %	25 %	50 %	25 %	409249234
67	NT_187081	GCAG	2	8	29644	29651	25 %	0 %	50 %	25 %	409249234
68	NT_187081	CTGG	2	8	29932	29939	0 %	25 %	50 %	25 %	409249234
69	NT_187081	CATT	2	8	29956	29963	25 %	50 %	0 %	25 %	409249234
70	NT_187081	ACTC	2	8	30461	30468	25 %	25 %	0 %	50 %	409249235
71	NT_187081	GTTT	2	8	31069	31076	0 %	75 %	25 %	0 %	409249235
72	NT_187081	TGGC	2	8	31773	31780	0 %	25 %	50 %	25 %	409249235
73	NT_187081	GCGA	2	8	32083	32090	25 %	0 %	50 %	25 %	409249236
74	NT_187081	CCCG	2	8	33219	33226	0 %	0 %	25 %	75 %	409249237
75	NT_187081	CCAT	2	8	33325	33332	25 %	25 %	0 %	50 %	409249237
76	NT_187081	ACAA	2	8	33935	33942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NT_187081	CCAC	2	8	33970	33977	25 %	0 %	0 %	75 %	409249238
78	NT_187081	GGCG	2	8	34915	34922	0 %	0 %	75 %	25 %	409249238
79	NT_187081	GCTG	2	8	35093	35100	0 %	25 %	50 %	25 %	409249239
80	NT_187081	GTTG	2	8	35601	35608	0 %	50 %	50 %	0 %	409249239
81	NT_187081	GGCG	2	8	36672	36679	0 %	0 %	75 %	25 %	409249240
82	NT_187081	GCAG	2	8	37211	37218	25 %	0 %	50 %	25 %	409249241
83	NT_187081	GCGG	2	8	37239	37246	0 %	0 %	75 %	25 %	409249241
84	NT_187081	GGAT	2	8	37401	37408	25 %	25 %	50 %	0 %	409249241
85	NT_187081	AAGG	2	8	37959	37966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187081	CTAT	2	8	38949	38956	25 %	50 %	0 %	25 %	409249242
87	NT_187081	CTAT	2	8	39390	39397	25 %	50 %	0 %	25 %	409249242
88	NT_187081	CGAC	2	8	39464	39471	25 %	0 %	25 %	50 %	409249242
89	NT_187081	GCGT	2	8	39639	39646	0 %	25 %	50 %	25 %	409249242
90	NT_187081	AGTC	2	8	40321	40328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NT_187081	GAGG	2	8	41084	41091	25 %	0 %	75 %	0 %	409249243
92	NT_187081	AGTC	2	8	41097	41104	25 %	25 %	25 %	25 %	409249243
93	NT_187081	GTAA	2	8	41792	41799	50 %	25 %	25 %	0 %	409249243
94	NT_187081	GAAC	2	8	42020	42027	50 %	0 %	25 %	25 %	409249243
95	NT_187081	GGCG	2	8	42186	42193	0 %	0 %	75 %	25 %	409249243
96	NT_187081	GATG	2	8	42352	42359	25 %	25 %	50 %	0 %	409249243
97	NT_187081	TCGC	2	8	42512	42519	0 %	25 %	25 %	50 %	409249243
98	NT_187081	GATG	2	8	42904	42911	25 %	25 %	50 %	0 %	409249243
99	NT_187081	ATCA	2	8	42947	42954	50 %	25 %	0 %	25 %	409249243
100	NT_187081	GCTC	2	8	43005	43012	0 %	25 %	25 %	50 %	409249243
101	NT_187081	CAGC	2	8	44012	44019	25 %	0 %	25 %	50 %	409249244
102	NT_187081	AATT	2	8	44115	44122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187081	CTGC	2	8	44519	44526	0 %	25 %	25 %	50 %	409249245
104	NT_187081	CCTT	2	8	44956	44963	0 %	50 %	0 %	50 %	409249245
105	NT_187081	CGTC	2	8	45226	45233	0 %	25 %	25 %	50 %	409249245
106	NT_187081	GCGG	2	8	46039	46046	0 %	0 %	75 %	25 %	409249247
107	NT_187081	CGTC	2	8	46311	46318	0 %	25 %	25 %	50 %	409249247
108	NT_187081	CTGG	2	8	46740	46747	0 %	25 %	50 %	25 %	409249249
109	NT_187081	GTAA	2	8	48523	48530	50 %	25 %	25 %	0 %	409249251
110	NT_187081	GGAG	2	8	48626	48633	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187081	CTGG	2	8	49162	49169	0 %	25 %	50 %	25 %	409249252
112	NT_187081	CAGA	2	8	49412	49419	50 %	0 %	25 %	25 %	409249252
113	NT_187081	ATTT	2	8	49847	49854	25 %	75 %	0 %	0 %	409249252
114	NT_187081	TTAT	2	8	50355	50362	25 %	75 %	0 %	0 %	409249253
115	NT_187081	CATT	2	8	50894	50901	25 %	50 %	0 %	25 %	409249254
116	NT_187081	ATTT	2	8	51014	51021	25 %	75 %	0 %	0 %	409249254
117	NT_187081	GCCA	2	8	51441	51448	25 %	0 %	25 %	50 %	409249255
118	NT_187081	ATTT	2	8	51906	51913	25 %	75 %	0 %	0 %	409249255
119	NT_187081	CGCC	2	8	52063	52070	0 %	0 %	25 %	75 %	409249256
120	NT_187081	TGCC	2	8	52105	52112	0 %	25 %	25 %	50 %	409249256
121	NT_187081	CCAG	2	8	52462	52469	25 %	0 %	25 %	50 %	409249256
122	NT_187081	TGAG	2	8	52483	52490	25 %	25 %	50 %	0 %	409249256
123	NT_187081	ACGA	2	8	52599	52606	50 %	0 %	25 %	25 %	409249256
124	NT_187081	AGCC	2	8	52838	52845	25 %	0 %	25 %	50 %	409249256
125	NT_187081	CTGG	2	8	52923	52930	0 %	25 %	50 %	25 %	409249257
126	NT_187081	AGCC	2	8	52973	52980	25 %	0 %	25 %	50 %	409249257
127	NT_187081	CGGG	2	8	53815	53822	0 %	0 %	75 %	25 %	409249257
128	NT_187081	CGCC	2	8	53844	53851	0 %	0 %	25 %	75 %	409249257
129	NT_187081	CAGA	2	8	54726	54733	50 %	0 %	25 %	25 %	409249258
130	NT_187081	TGAA	2	8	54836	54843	50 %	25 %	25 %	0 %	409249258
131	NT_187081	GGCT	2	8	55315	55322	0 %	25 %	50 %	25 %	409249259
132	NT_187081	GTCC	2	8	56478	56485	0 %	25 %	25 %	50 %	409249260
133	NT_187081	CTGA	2	8	57187	57194	25 %	25 %	25 %	25 %	409249261
134	NT_187081	CCGC	2	8	57264	57271	0 %	0 %	25 %	75 %	409249261
135	NT_187081	AATT	2	8	57451	57458	50 %	50 %	0 %	0 %	409249261
136	NT_187081	CAGC	2	8	57637	57644	25 %	0 %	25 %	50 %	409249261
137	NT_187081	ACGC	3	12	57687	57698	25 %	0 %	25 %	50 %	409249261
138	NT_187081	TTCA	2	8	58817	58824	25 %	50 %	0 %	25 %	409249262
139	NT_187081	CGCC	2	8	58894	58901	0 %	0 %	25 %	75 %	409249262
140	NT_187081	GAAT	2	8	59358	59365	50 %	25 %	25 %	0 %	409249262
141	NT_187081	CTCA	2	8	59444	59451	25 %	25 %	0 %	50 %	409249262
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.