MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187081	CCAG	2	8	1938	1945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187081	TATT	2	8	1999	2006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187081	ATAA	2	8	2047	2054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187081	ACGG	2	8	9499	9506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187081	ATGA	2	8	12096	12103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187081	AGAA	2	8	25580	25587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187081	AAGG	2	8	27822	27829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187081	TACT	2	8	28639	28646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NT_187081	ACAA	2	8	33935	33942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187081	AAGG	2	8	37959	37966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187081	AGTC	2	8	40321	40328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NT_187081	AATT	2	8	44115	44122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187081	GGAG	2	8	48626	48633	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187081	AATC	2	8	61132	61139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NT_187081	GATT	2	8	61140	61147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187081	GACG	2	8	66081	66088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NT_187081	AACA	2	8	66102	66109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187081	AATT	2	8	66625	66632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187081	CGAG	2	8	67152	67159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NT_187081	GGGA	2	8	70433	70440	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187081	TTAA	2	8	73003	73010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187081	CAGG	2	8	73101	73108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NT_187081	AGAT	2	8	73239	73246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187081	ATTT	2	8	73871	73878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187081	ACTT	2	8	75266	75273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NT_187081	CCTG	2	8	77505	77512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NT_187081	GAAA	2	8	77610	77617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187081	TACA	2	8	77896	77903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187081	TATC	2	8	79628	79635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NT_187081	GCAG	2	8	79643	79650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NT_187081	TTCG	2	8	83796	83803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NT_187081	AAAT	2	8	83969	83976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187081	GAAT	2	8	90661	90668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187081	CAGG	2	8	93564	93571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NT_187081	ATTG	2	8	99117	99124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187081	ATCG	2	8	99334	99341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187081	TTAT	2	8	99578	99585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187081	TTTC	2	8	99640	99647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NT_187081	CTGG	2	8	99983	99990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NT_187081	GTAT	2	8	100091	100098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187081	ATTT	2	8	103834	103841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187081	TCAG	2	8	106553	106560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187081	GAAG	2	8	108937	108944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187081	CTGT	2	8	115492	115499	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NT_187081	GAAA	2	8	118017	118024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187081	TTTA	2	8	121696	121703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187081	AGGG	2	8	121856	121863	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187081	CATT	2	8	126180	126187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187081	ATAA	2	8	127879	127886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187081	GATC	2	8	127897	127904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NT_187081	CGAT	2	8	127917	127924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NT_187081	CCTG	2	8	132492	132499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187081	CTGT	2	8	135592	135599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187081	AGCG	2	8	142795	142802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NT_187081	GATT	2	8	145585	145592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187081	GTTT	2	8	149433	149440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187081	TAAA	2	8	152610	152617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187081	CAGG	2	8	153026	153033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187081	GTTA	2	8	153122	153129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187081	GATT	2	8	153146	153153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187081	GCCC	2	8	156004	156011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NT_187081	TTGG	2	8	156217	156224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187081	CAGA	2	8	156748	156755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NT_187081	TAGG	2	8	156813	156820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187081	GATT	2	8	157004	157011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.