MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187081	GCA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187081	CTG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187081	GGA	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187081	AAT	2	6	2066	2071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187081	TAA	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187081	ATA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187081	GGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187081	GTG	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187081	AAC	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187081	TAA	2	6	9364	9369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187081	ATC	2	6	9431	9436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187081	CAT	2	6	10453	10458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187081	ATT	2	6	10475	10480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187081	TTA	3	9	10530	10538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187081	TAA	2	6	10543	10548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187081	ATA	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187081	GGC	2	6	17892	17897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187081	GGC	2	6	17921	17926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187081	CCA	2	6	17953	17958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187081	CCG	2	6	17981	17986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187081	AAT	2	6	18939	18944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187081	GAT	3	9	19096	19104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187081	ATT	2	6	21733	21738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187081	GGC	2	6	21742	21747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187081	GCC	2	6	24059	24064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NT_187081	CTG	2	6	24069	24074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187081	CGG	2	6	24075	24080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187081	CAA	2	6	25544	25549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187081	GCG	2	6	28687	28692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187081	ATA	2	6	28738	28743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187081	GAG	2	6	28746	28751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187081	TGC	2	6	31969	31974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187081	CGC	2	6	32031	32036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NT_187081	AGC	2	6	32565	32570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187081	CTT	2	6	37592	37597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187081	CTG	2	6	37614	37619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187081	CCT	2	6	37634	37639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NT_187081	AAT	2	6	37708	37713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187081	GGC	2	6	37778	37783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187081	TCA	2	6	37989	37994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187081	CTG	2	6	38046	38051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187081	GAA	2	6	40415	40420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187081	TAT	2	6	40489	40494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187081	CAT	2	6	40569	40574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187081	GAC	2	6	40656	40661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187081	CGT	2	6	43107	43112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187081	AGC	2	6	44055	44060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187081	CCA	2	6	44377	44382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187081	GAA	2	6	44391	44396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187081	TAA	2	6	45424	45429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187081	TTA	2	6	47988	47993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187081	CAA	2	6	48046	48051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187081	TGA	2	6	50733	50738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187081	GTC	3	9	54908	54916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187081	AAT	2	6	54965	54970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187081	GGC	2	6	56541	56546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187081	ACG	2	6	56567	56572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187081	AGT	2	6	61337	61342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187081	GCC	2	6	62827	62832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NT_187081	ACA	2	6	66178	66183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187081	ATT	2	6	66619	66624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187081	GAT	2	6	66735	66740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187081	GGT	2	6	67173	67178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187081	CGC	2	6	67212	67217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187081	ATG	2	6	70461	70466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187081	GTG	2	6	71896	71901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187081	TTG	2	6	72985	72990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187081	ATT	2	6	73026	73031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187081	AAT	2	6	73035	73040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187081	TGG	2	6	73915	73920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187081	TAA	2	6	73922	73927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187081	CGG	2	6	75002	75007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187081	AAT	2	6	75088	75093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187081	CGC	2	6	75110	75115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NT_187081	ATT	2	6	75122	75127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187081	GGT	2	6	75287	75292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187081	AGA	2	6	77573	77578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187081	AAG	2	6	77593	77598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187081	CCG	2	6	77604	77609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187081	GCG	2	6	77696	77701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187081	CCT	2	6	77851	77856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NT_187081	TAG	2	6	80606	80611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187081	ATA	2	6	80757	80762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187081	TCA	2	6	83787	83792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187081	TTA	2	6	83997	84002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187081	ACA	2	6	88374	88379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187081	GTA	2	6	88395	88400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187081	GAT	2	6	88411	88416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187081	GCT	2	6	88422	88427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187081	TGA	2	6	88472	88477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187081	TAT	2	6	90562	90567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187081	CAA	2	6	90675	90680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187081	CAA	2	6	91391	91396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187081	CGC	2	6	91466	91471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NT_187081	GTG	2	6	91518	91523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187081	GGC	2	6	91545	91550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187081	AAC	2	6	93582	93587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187081	AGG	2	6	98653	98658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187081	ATC	2	6	99144	99149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187081	CCG	2	6	99215	99220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NT_187081	AAT	2	6	99590	99595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187081	ATT	2	6	99707	99712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187081	ATG	2	6	99930	99935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187081	TAA	2	6	99969	99974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187081	CCT	2	6	102028	102033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NT_187081	ATT	2	6	103581	103586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187081	ATG	2	6	103641	103646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187081	TCA	3	9	103722	103730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187081	ATA	2	6	103875	103880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187081	TAA	2	6	103915	103920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187081	TGC	2	6	106535	106540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187081	TCA	2	6	106749	106754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187081	GAA	2	6	107311	107316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187081	CGG	2	6	107340	107345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187081	TAA	2	6	107368	107373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187081	CAT	2	6	107446	107451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187081	ATG	2	6	107535	107540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187081	GAT	2	6	108865	108870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187081	CGT	2	6	109003	109008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187081	TTA	2	6	109016	109021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187081	TTA	2	6	109032	109037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187081	GGT	2	6	109041	109046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187081	GGT	2	6	109076	109081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187081	GGC	2	6	111880	111885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187081	AAT	2	6	111916	111921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187081	GAT	2	6	111925	111930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187081	TCG	2	6	115458	115463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187081	CTA	2	6	115521	115526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187081	TCA	2	6	115556	115561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187081	CTT	2	6	117993	117998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187081	ACA	2	6	118096	118101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187081	CAA	2	6	118102	118107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187081	CGG	2	6	118213	118218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187081	AGG	2	6	118243	118248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187081	CCG	2	6	121068	121073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NT_187081	ATT	2	6	121143	121148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187081	GCT	2	6	121661	121666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187081	TGC	2	6	121682	121687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187081	ATT	2	6	121708	121713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187081	CCT	2	6	121716	121721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NT_187081	GAT	2	6	121970	121975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187081	CAT	2	6	126162	126167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NT_187081	TCG	2	6	126669	126674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187081	ATA	2	6	126681	126686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187081	TAA	3	9	127884	127892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187081	AAT	2	6	127965	127970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187081	ATT	2	6	128000	128005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187081	GGT	2	6	128034	128039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187081	TAT	2	6	129493	129498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187081	TGT	2	6	131326	131331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NT_187081	TGA	2	6	131403	131408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NT_187081	GGC	2	6	131464	131469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NT_187081	CGG	2	6	132472	132477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NT_187081	TTC	2	6	135475	135480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NT_187081	AGG	2	6	135503	135508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NT_187081	TAG	2	6	135511	135516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NT_187081	AAG	2	6	135519	135524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NT_187081	TAA	2	6	138419	138424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NT_187081	TTC	2	6	138438	138443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NT_187081	ATG	2	6	142839	142844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NT_187081	GGC	2	6	145605	145610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NT_187081	ACC	2	6	145619	145624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NT_187081	TGA	2	6	146711	146716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NT_187081	GGA	2	6	146726	146731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NT_187081	CCT	2	6	152646	152651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NT_187081	GAC	2	6	153211	153216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NT_187081	TTC	2	6	156107	156112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NT_187081	ATA	2	6	156297	156302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NT_187081	ATT	2	6	156330	156335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NT_187081	GTT	2	6	156384	156389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NT_187081	CAG	2	6	156739	156744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NT_187081	TAC	2	6	156772	156777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NT_187081	AAG	2	6	156916	156921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NT_187081	CTT	2	6	156953	156958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NT_187081	GCA	2	6	156962	156967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.