MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187080	CCA	2	6	23	28	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187080	CCA	2	6	180	185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187080	GGC	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187080	CGC	2	6	329	334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187080	ATT	2	6	355	360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187080	TTA	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187080	CCG	2	6	521	526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
8	NT_187080	ACG	3	9	543	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249196
9	NT_187080	TGG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249196
10	NT_187080	ACT	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249196
11	NT_187080	AGA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249196
12	NT_187080	CGG	2	6	661	666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
13	NT_187080	CGC	2	6	712	717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
14	NT_187080	GGC	2	6	805	810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
15	NT_187080	GCT	2	6	908	913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249196
16	NT_187080	CGC	2	6	1164	1169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
17	NT_187080	CCA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249196
18	NT_187080	TTA	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249196
19	NT_187080	GGC	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
20	NT_187080	TCT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249196
21	NT_187080	GCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249196
22	NT_187080	GCT	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249196
23	NT_187080	GCG	2	6	1451	1456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
24	NT_187080	ACT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187080	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187080	TGC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187080	GCC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NT_187080	TGA	2	6	1912	1917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187080	ATG	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187080	GAT	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187080	TGA	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187080	GTG	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187080	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249197
34	NT_187080	CAG	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
35	NT_187080	CAT	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249197
36	NT_187080	CAG	2	6	2804	2809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
37	NT_187080	CAT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249197
38	NT_187080	ACC	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249197
39	NT_187080	GCC	2	6	2931	2936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249197
40	NT_187080	GTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249197
41	NT_187080	GAC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
42	NT_187080	CAG	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
43	NT_187080	GCC	2	6	3024	3029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249197
44	NT_187080	CAA	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249197
45	NT_187080	CAC	2	6	3092	3097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249197
46	NT_187080	CGA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
47	NT_187080	ATT	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249197
48	NT_187080	TCA	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187080	CAT	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187080	ATT	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249198
51	NT_187080	TGC	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249198
52	NT_187080	GTT	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249198
53	NT_187080	CAT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249198
54	NT_187080	GCC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249198
55	NT_187080	CAG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249198
56	NT_187080	TGG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187080	CGC	3	9	3790	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NT_187080	GCA	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187080	AAT	2	6	3824	3829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187080	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187080	ACG	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
62	NT_187080	TTA	2	6	4064	4069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249199
63	NT_187080	GCT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
64	NT_187080	GCA	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
65	NT_187080	CTG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
66	NT_187080	GTG	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249199
67	NT_187080	GCG	2	6	4220	4225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249199
68	NT_187080	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
69	NT_187080	ACC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249199
70	NT_187080	ACG	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
71	NT_187080	CTG	3	9	4403	4411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
72	NT_187080	GCC	2	6	4436	4441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
73	NT_187080	CGC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
74	NT_187080	TGA	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249199
75	NT_187080	ACT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249199
76	NT_187080	CGC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
77	NT_187080	GCG	2	6	4719	4724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249199
78	NT_187080	AAG	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249199
79	NT_187080	TCA	2	6	4776	4781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249199
80	NT_187080	CGC	2	6	4794	4799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
81	NT_187080	ATT	2	6	4904	4909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249199
82	NT_187080	TGG	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249199
83	NT_187080	GCT	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
84	NT_187080	TAT	2	6	5160	5165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249200
85	NT_187080	CTT	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249200
86	NT_187080	TTC	2	6	5279	5284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249200
87	NT_187080	CAA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249200
88	NT_187080	CTC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249200
89	NT_187080	TTG	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249200
90	NT_187080	CAT	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249200
91	NT_187080	GCG	2	6	5607	5612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249200
92	NT_187080	ATA	2	6	5644	5649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249200
93	NT_187080	CAT	2	6	5705	5710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249200
94	NT_187080	GGC	2	6	5745	5750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249201
95	NT_187080	TAT	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249201
96	NT_187080	TAA	2	6	5884	5889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249201
97	NT_187080	TAA	2	6	5944	5949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249201
98	NT_187080	TTC	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249201
99	NT_187080	AAT	2	6	6004	6009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249201
100	NT_187080	AGG	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249201
101	NT_187080	CCT	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249201
102	NT_187080	ACG	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249201
103	NT_187080	CCG	2	6	6125	6130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249201
104	NT_187080	CAA	2	6	6168	6173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249201
105	NT_187080	TAT	2	6	6198	6203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249201
106	NT_187080	TGT	2	6	6326	6331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249201
107	NT_187080	GCA	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249201
108	NT_187080	GTT	2	6	6381	6386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249201
109	NT_187080	CTT	2	6	6450	6455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249201
110	NT_187080	ATC	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249201
111	NT_187080	TTA	2	6	6660	6665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187080	TAG	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187080	CTT	2	6	6734	6739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249202
114	NT_187080	AAG	2	6	6808	6813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249202
115	NT_187080	ATT	2	6	6837	6842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249202
116	NT_187080	GAG	2	6	6874	6879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249202
117	NT_187080	TGG	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249202
118	NT_187080	GAT	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249202
119	NT_187080	CTG	2	6	7109	7114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249202
120	NT_187080	TTA	3	9	7136	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249202
121	NT_187080	CAG	2	6	7186	7191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249202
122	NT_187080	ATT	2	6	7309	7314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249202
123	NT_187080	GAA	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249202
124	NT_187080	ATC	2	6	7356	7361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249202
125	NT_187080	TAA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249202
126	NT_187080	GAA	2	6	7503	7508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249202
127	NT_187080	AAT	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249202
128	NT_187080	TTC	2	6	7600	7605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249203
129	NT_187080	TGC	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249203
130	NT_187080	TAT	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249203
131	NT_187080	TAT	2	6	7873	7878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249203
132	NT_187080	TGA	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249203
133	NT_187080	TTA	2	6	7928	7933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249203
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.