MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187080	CCG	2	6	521	526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
2	NT_187080	ACG	3	9	543	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249196
3	NT_187080	TGG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249196
4	NT_187080	ACT	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249196
5	NT_187080	AGA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249196
6	NT_187080	CGG	2	6	661	666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
7	NT_187080	CGC	2	6	712	717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
8	NT_187080	GGC	2	6	805	810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
9	NT_187080	GCT	2	6	908	913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249196
10	NT_187080	CGC	2	6	1164	1169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
11	NT_187080	CCA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249196
12	NT_187080	TTA	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249196
13	NT_187080	GGC	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
14	NT_187080	TCT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249196
15	NT_187080	GCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249196
16	NT_187080	GCT	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249196
17	NT_187080	GCG	2	6	1451	1456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
18	NT_187080	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249197
19	NT_187080	CAG	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
20	NT_187080	CAT	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249197
21	NT_187080	CAG	2	6	2804	2809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
22	NT_187080	CAT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249197
23	NT_187080	ACC	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249197
24	NT_187080	GCC	2	6	2931	2936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249197
25	NT_187080	GTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249197
26	NT_187080	GAC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
27	NT_187080	CAG	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
28	NT_187080	GCC	2	6	3024	3029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249197
29	NT_187080	CAA	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249197
30	NT_187080	CAC	2	6	3092	3097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249197
31	NT_187080	CGA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
32	NT_187080	ATT	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249197
33	NT_187080	ATT	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249198
34	NT_187080	TGC	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249198
35	NT_187080	GTT	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249198
36	NT_187080	CAT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249198
37	NT_187080	GCC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249198
38	NT_187080	CAG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249198
39	NT_187080	ACG	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
40	NT_187080	TTA	2	6	4064	4069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249199
41	NT_187080	GCT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
42	NT_187080	GCA	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
43	NT_187080	CTG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
44	NT_187080	GTG	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249199
45	NT_187080	GCG	2	6	4220	4225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249199
46	NT_187080	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
47	NT_187080	ACC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249199
48	NT_187080	ACG	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
49	NT_187080	CTG	3	9	4403	4411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
50	NT_187080	GCC	2	6	4436	4441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
51	NT_187080	CGC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
52	NT_187080	TGA	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249199
53	NT_187080	ACT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249199
54	NT_187080	CGC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
55	NT_187080	GCG	2	6	4719	4724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249199
56	NT_187080	AAG	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249199
57	NT_187080	TCA	2	6	4776	4781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249199
58	NT_187080	CGC	2	6	4794	4799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
59	NT_187080	ATT	2	6	4904	4909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249199
60	NT_187080	TGG	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249199
61	NT_187080	GCT	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
62	NT_187080	TAT	2	6	5160	5165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249200
63	NT_187080	CTT	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249200
64	NT_187080	TTC	2	6	5279	5284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249200
65	NT_187080	CAA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249200
66	NT_187080	CTC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249200
67	NT_187080	TTG	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249200
68	NT_187080	CAT	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249200
69	NT_187080	GCG	2	6	5607	5612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249200
70	NT_187080	ATA	2	6	5644	5649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249200
71	NT_187080	CAT	2	6	5705	5710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249200
72	NT_187080	GGC	2	6	5745	5750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249201
73	NT_187080	TAT	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249201
74	NT_187080	TAA	2	6	5884	5889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249201
75	NT_187080	TAA	2	6	5944	5949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249201
76	NT_187080	TTC	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249201
77	NT_187080	AAT	2	6	6004	6009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249201
78	NT_187080	AGG	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249201
79	NT_187080	CCT	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249201
80	NT_187080	ACG	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249201
81	NT_187080	CCG	2	6	6125	6130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249201
82	NT_187080	CAA	2	6	6168	6173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249201
83	NT_187080	TAT	2	6	6198	6203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249201
84	NT_187080	TGT	2	6	6326	6331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249201
85	NT_187080	GCA	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249201
86	NT_187080	GTT	2	6	6381	6386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249201
87	NT_187080	CTT	2	6	6450	6455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249201
88	NT_187080	ATC	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249201
89	NT_187080	CTT	2	6	6734	6739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249202
90	NT_187080	AAG	2	6	6808	6813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249202
91	NT_187080	ATT	2	6	6837	6842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249202
92	NT_187080	GAG	2	6	6874	6879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249202
93	NT_187080	TGG	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249202
94	NT_187080	GAT	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249202
95	NT_187080	CTG	2	6	7109	7114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249202
96	NT_187080	TTA	3	9	7136	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249202
97	NT_187080	CAG	2	6	7186	7191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249202
98	NT_187080	ATT	2	6	7309	7314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249202
99	NT_187080	GAA	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249202
100	NT_187080	ATC	2	6	7356	7361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249202
101	NT_187080	TAA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249202
102	NT_187080	GAA	2	6	7503	7508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249202
103	NT_187080	AAT	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249202
104	NT_187080	TTC	2	6	7600	7605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249203
105	NT_187080	TGC	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249203
106	NT_187080	TAT	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249203
107	NT_187080	TAT	2	6	7873	7878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249203
108	NT_187080	TGA	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249203
109	NT_187080	TTA	2	6	7928	7933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249203
110	NT_187080	CAT	2	6	8092	8097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249203
111	NT_187080	GTT	2	6	8229	8234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249203
112	NT_187080	CTT	2	6	8348	8353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249203
113	NT_187080	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249203
114	NT_187080	CGA	2	6	8396	8401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249203
115	NT_187080	ATT	2	6	8809	8814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249204
116	NT_187080	TTG	2	6	8818	8823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249204
117	NT_187080	AAT	2	6	8838	8843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249204
118	NT_187080	TCG	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249204
119	NT_187080	TGG	2	6	9093	9098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249204
120	NT_187080	GCC	2	6	9166	9171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249204
121	NT_187080	AGT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249204
122	NT_187080	CTT	2	6	9196	9201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249204
123	NT_187080	CAA	2	6	9221	9226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249204
124	NT_187080	TAT	2	6	9243	9248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249204
125	NT_187080	TTC	2	6	9379	9384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249204
126	NT_187080	TGG	2	6	9509	9514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249204
127	NT_187080	TTG	2	6	9551	9556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249204
128	NT_187080	TGT	2	6	9559	9564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249204
129	NT_187080	ATG	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249204
130	NT_187080	ATT	2	6	9748	9753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249204
131	NT_187080	GCA	2	6	9808	9813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249204
132	NT_187080	GTT	2	6	9819	9824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249204
133	NT_187080	GTT	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249204
134	NT_187080	AGT	2	6	9901	9906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249204
135	NT_187080	ATT	2	6	9949	9954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249204
136	NT_187080	TAC	2	6	10037	10042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249204
137	NT_187080	CTG	2	6	10193	10198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249205
138	NT_187080	CCG	2	6	10221	10226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249205
139	NT_187080	CTT	2	6	10237	10242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249205
140	NT_187080	CGC	2	6	10255	10260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249205
141	NT_187080	CGT	2	6	10282	10287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249205
142	NT_187080	GAC	2	6	10289	10294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249205
143	NT_187080	GCC	3	9	10319	10327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249205
144	NT_187080	CCA	2	6	10342	10347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.