MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187078	GGCGAG	2	12	9368	9379	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	409249106
2	NT_187078	TTTAGT	2	12	11844	11855	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409249110
3	NT_187078	TCAATG	2	12	14839	14850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409249112
4	NT_187078	TACGGG	2	12	17534	17545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249115
5	NT_187078	CGCTGG	2	12	19119	19130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409249116
6	NT_187078	GGCGAA	2	12	22199	22210	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409249117
7	NT_187078	CGCCAG	2	12	24278	24289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249119
8	NT_187078	GCCTAC	2	12	26330	26341	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409249121
9	NT_187078	TACGGG	2	12	26428	26439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249121
10	NT_187078	GCGCGG	2	12	27431	27442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249122
11	NT_187078	CTGGAT	2	12	29032	29043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409249122
12	NT_187078	CTGGCT	2	12	31540	31551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249125
13	NT_187078	CAGCGC	2	12	35482	35493	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249128
14	NT_187078	GAACGA	2	12	40916	40927	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409249134
15	NT_187078	CACCAA	2	12	41607	41618	50 %	0 %	0 %	50 %	409249135
16	NT_187078	GGCAAT	2	12	41730	41741	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409249136
17	NT_187078	CTTCCG	2	12	45606	45617	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409249140
18	NT_187078	CCAGCC	2	12	49126	49137	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409249143
19	NT_187078	GGGGCG	2	12	51613	51624	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	409249143
20	NT_187078	TCATTT	2	12	54763	54774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409249146
21	NT_187078	TTTGAA	2	12	58241	58252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409249150
22	NT_187078	CAGGGT	2	12	58871	58882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249150
23	NT_187078	TGCCGG	2	12	60427	60438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409249151
24	NT_187078	TGGCGG	2	12	61770	61781	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409249153
25	NT_187078	CAGCGA	2	12	62396	62407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249154
26	NT_187078	TTTCTA	2	12	70572	70583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409249163
27	NT_187078	AAAATG	2	12	74256	74267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409249166
28	NT_187078	TAAGAA	2	12	74735	74746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409249167
29	NT_187078	AAACTG	2	12	81631	81642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409249174
30	NT_187078	CTGGCG	2	12	84662	84673	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409249176
31	NT_187078	ATCACC	2	12	89335	89346	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409249180
32	NT_187078	TTGATT	2	12	95345	95356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409249188
33	NT_187078	ATGGTA	2	12	98808	98819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249191
34	NT_187078	AACGGC	2	12	99241	99252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249192
35	NT_187078	AAAGCG	2	12	100333	100344	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409249193

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.