MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187078	AATG	2	8	1537	1544	50 %	25 %	25 %	0 %	409249100
2	NT_187078	TGAG	2	8	2938	2945	25 %	25 %	50 %	0 %	409249101
3	NT_187078	GGGC	2	8	3102	3109	0 %	0 %	75 %	25 %	409249101
4	NT_187078	TATT	2	8	3235	3242	25 %	75 %	0 %	0 %	409249101
5	NT_187078	GACG	2	8	3481	3488	25 %	0 %	50 %	25 %	409249102
6	NT_187078	GATA	2	8	4308	4315	50 %	25 %	25 %	0 %	409249103
7	NT_187078	AGCG	2	8	6854	6861	25 %	0 %	50 %	25 %	409249104
8	NT_187078	ATGG	2	8	7034	7041	25 %	25 %	50 %	0 %	409249104
9	NT_187078	GCGT	2	8	7332	7339	0 %	25 %	50 %	25 %	409249105
10	NT_187078	ATCA	2	8	7414	7421	50 %	25 %	0 %	25 %	409249105
11	NT_187078	GGCT	2	8	7781	7788	0 %	25 %	50 %	25 %	409249105
12	NT_187078	GGCC	2	8	7808	7815	0 %	0 %	50 %	50 %	409249105
13	NT_187078	TCAT	2	8	7874	7881	25 %	50 %	0 %	25 %	409249105
14	NT_187078	CAAT	2	8	9414	9421	50 %	25 %	0 %	25 %	409249106
15	NT_187078	TTCG	2	8	9727	9734	0 %	50 %	25 %	25 %	409249107
16	NT_187078	TGCC	2	8	11098	11105	0 %	25 %	25 %	50 %	409249109
17	NT_187078	AGCC	2	8	11622	11629	25 %	0 %	25 %	50 %	409249109
18	NT_187078	ACAT	2	8	11692	11699	50 %	25 %	0 %	25 %	409249109
19	NT_187078	CATC	2	8	12148	12155	25 %	25 %	0 %	50 %	409249110
20	NT_187078	AACG	2	8	13419	13426	50 %	0 %	25 %	25 %	409249111
21	NT_187078	GAAC	2	8	13684	13691	50 %	0 %	25 %	25 %	409249111
22	NT_187078	CGAA	2	8	13871	13878	50 %	0 %	25 %	25 %	409249111
23	NT_187078	GATT	2	8	13891	13898	25 %	50 %	25 %	0 %	409249111
24	NT_187078	CAGC	2	8	14131	14138	25 %	0 %	25 %	50 %	409249111
25	NT_187078	GCGG	2	8	14560	14567	0 %	0 %	75 %	25 %	409249111
26	NT_187078	GCTG	2	8	15542	15549	0 %	25 %	50 %	25 %	409249112
27	NT_187078	AGCA	2	8	15820	15827	50 %	0 %	25 %	25 %	409249113
28	NT_187078	CCAG	2	8	16164	16171	25 %	0 %	25 %	50 %	409249113
29	NT_187078	CACG	2	8	18338	18345	25 %	0 %	25 %	50 %	409249115
30	NT_187078	AGTA	2	8	18431	18438	50 %	25 %	25 %	0 %	409249115
31	NT_187078	CACG	2	8	18563	18570	25 %	0 %	25 %	50 %	409249115
32	NT_187078	GTGG	2	8	18831	18838	0 %	25 %	75 %	0 %	409249115
33	NT_187078	CAAC	2	8	19073	19080	50 %	0 %	0 %	50 %	409249116
34	NT_187078	CAGC	2	8	19198	19205	25 %	0 %	25 %	50 %	409249116
35	NT_187078	TTGA	2	8	19994	20001	25 %	50 %	25 %	0 %	409249116
36	NT_187078	GCCA	2	8	20039	20046	25 %	0 %	25 %	50 %	409249116
37	NT_187078	CATC	2	8	20956	20963	25 %	25 %	0 %	50 %	409249117
38	NT_187078	ACGG	2	8	21012	21019	25 %	0 %	50 %	25 %	409249117
39	NT_187078	GCGG	2	8	21128	21135	0 %	0 %	75 %	25 %	409249117
40	NT_187078	CATA	2	8	21421	21428	50 %	25 %	0 %	25 %	409249117
41	NT_187078	GACC	2	8	21751	21758	25 %	0 %	25 %	50 %	409249117
42	NT_187078	ATTG	2	8	22932	22939	25 %	50 %	25 %	0 %	409249118
43	NT_187078	CCGG	2	8	23109	23116	0 %	0 %	50 %	50 %	409249118
44	NT_187078	AATA	2	8	25316	25323	75 %	25 %	0 %	0 %	409249120
45	NT_187078	TACG	2	8	25595	25602	25 %	25 %	25 %	25 %	409249120
46	NT_187078	GCAG	2	8	26215	26222	25 %	0 %	50 %	25 %	409249121
47	NT_187078	GCGG	2	8	27358	27365	0 %	0 %	75 %	25 %	409249122
48	NT_187078	TCTG	2	8	27647	27654	0 %	50 %	25 %	25 %	409249122
49	NT_187078	GCGG	2	8	27709	27716	0 %	0 %	75 %	25 %	409249122
50	NT_187078	TGTC	2	8	28022	28029	0 %	50 %	25 %	25 %	409249122
51	NT_187078	CGAT	2	8	28451	28458	25 %	25 %	25 %	25 %	409249122
52	NT_187078	AACA	2	8	28555	28562	75 %	0 %	0 %	25 %	409249122
53	NT_187078	TCTG	2	8	28898	28905	0 %	50 %	25 %	25 %	409249122
54	NT_187078	TGAG	2	8	29392	29399	25 %	25 %	50 %	0 %	409249123
55	NT_187078	GCCC	2	8	29406	29413	0 %	0 %	25 %	75 %	409249123
56	NT_187078	ATCT	2	8	29528	29535	25 %	50 %	0 %	25 %	409249123
57	NT_187078	GATC	2	8	30554	30561	25 %	25 %	25 %	25 %	409249123
58	NT_187078	CTGT	2	8	30858	30865	0 %	50 %	25 %	25 %	409249123
59	NT_187078	AATT	2	8	31162	31169	50 %	50 %	0 %	0 %	409249124
60	NT_187078	AAGA	2	8	34810	34817	75 %	0 %	25 %	0 %	409249128
61	NT_187078	CTGC	2	8	34874	34881	0 %	25 %	25 %	50 %	409249128
62	NT_187078	CGCC	2	8	35319	35326	0 %	0 %	25 %	75 %	409249128
63	NT_187078	CCCG	2	8	35504	35511	0 %	0 %	25 %	75 %	409249128
64	NT_187078	GCAG	2	8	35634	35641	25 %	0 %	50 %	25 %	409249128
65	NT_187078	AGGT	2	8	36039	36046	25 %	25 %	50 %	0 %	409249129
66	NT_187078	CAGC	2	8	36253	36260	25 %	0 %	25 %	50 %	409249129
67	NT_187078	CATC	2	8	36556	36563	25 %	25 %	0 %	50 %	409249129
68	NT_187078	TGCC	2	8	37694	37701	0 %	25 %	25 %	50 %	409249130
69	NT_187078	AATC	2	8	37835	37842	50 %	25 %	0 %	25 %	409249130
70	NT_187078	GTTG	2	8	38079	38086	0 %	50 %	50 %	0 %	409249130
71	NT_187078	CGAT	2	8	40660	40667	25 %	25 %	25 %	25 %	409249134
72	NT_187078	GCCA	2	8	41209	41216	25 %	0 %	25 %	50 %	409249135
73	NT_187078	ATTG	2	8	41679	41686	25 %	50 %	25 %	0 %	409249135
74	NT_187078	GCTG	2	8	42141	42148	0 %	25 %	50 %	25 %	409249136
75	NT_187078	GTTA	2	8	42501	42508	25 %	50 %	25 %	0 %	409249136
76	NT_187078	GTGC	2	8	43799	43806	0 %	25 %	50 %	25 %	409249138
77	NT_187078	TACC	2	8	44536	44543	25 %	25 %	0 %	50 %	409249139
78	NT_187078	CCAG	2	8	45220	45227	25 %	0 %	25 %	50 %	409249139
79	NT_187078	ATCA	2	8	46201	46208	50 %	25 %	0 %	25 %	409249140
80	NT_187078	ACGG	2	8	46221	46228	25 %	0 %	50 %	25 %	409249140
81	NT_187078	ATCC	2	8	46285	46292	25 %	25 %	0 %	50 %	409249140
82	NT_187078	GCGG	2	8	48750	48757	0 %	0 %	75 %	25 %	409249142
83	NT_187078	CGCT	2	8	49695	49702	0 %	25 %	25 %	50 %	409249143
84	NT_187078	AGGG	2	8	49895	49902	25 %	0 %	75 %	0 %	409249143
85	NT_187078	CGCT	2	8	50064	50071	0 %	25 %	25 %	50 %	409249143
86	NT_187078	GGCC	2	8	52049	52056	0 %	0 %	50 %	50 %	409249144
87	NT_187078	ATCA	2	8	52293	52300	50 %	25 %	0 %	25 %	409249145
88	NT_187078	TCAA	2	8	52633	52640	50 %	25 %	0 %	25 %	409249145
89	NT_187078	CAGC	2	8	53309	53316	25 %	0 %	25 %	50 %	409249145
90	NT_187078	CGGG	2	8	53335	53342	0 %	0 %	75 %	25 %	409249145
91	NT_187078	CCAG	2	8	53750	53757	25 %	0 %	25 %	50 %	409249145
92	NT_187078	TTGC	2	8	54297	54304	0 %	50 %	25 %	25 %	409249145
93	NT_187078	AATA	2	8	54428	54435	75 %	25 %	0 %	0 %	409249146
94	NT_187078	ATGA	2	8	55143	55150	50 %	25 %	25 %	0 %	409249146
95	NT_187078	CGCC	2	8	55186	55193	0 %	0 %	25 %	75 %	409249146
96	NT_187078	GCCA	2	8	55889	55896	25 %	0 %	25 %	50 %	409249146
97	NT_187078	ATGG	2	8	56601	56608	25 %	25 %	50 %	0 %	409249148
98	NT_187078	CCCA	2	8	56757	56764	25 %	0 %	0 %	75 %	409249149
99	NT_187078	TTGA	2	8	57825	57832	25 %	50 %	25 %	0 %	409249149
100	NT_187078	CCAG	2	8	58702	58709	25 %	0 %	25 %	50 %	409249150
101	NT_187078	AGAC	2	8	58984	58991	50 %	0 %	25 %	25 %	409249150
102	NT_187078	CAGC	2	8	59048	59055	25 %	0 %	25 %	50 %	409249150
103	NT_187078	CTTT	2	8	59750	59757	0 %	75 %	0 %	25 %	409249150
104	NT_187078	CATT	2	8	60620	60627	25 %	50 %	0 %	25 %	409249151
105	NT_187078	AGCG	2	8	60787	60794	25 %	0 %	50 %	25 %	409249152
106	NT_187078	CCGG	2	8	61257	61264	0 %	0 %	50 %	50 %	409249152
107	NT_187078	AATG	2	8	62167	62174	50 %	25 %	25 %	0 %	409249153
108	NT_187078	TGCG	2	8	62481	62488	0 %	25 %	50 %	25 %	409249154
109	NT_187078	GGAC	2	8	62553	62560	25 %	0 %	50 %	25 %	409249154
110	NT_187078	TCGC	2	8	63034	63041	0 %	25 %	25 %	50 %	409249154
111	NT_187078	GATT	2	8	63441	63448	25 %	50 %	25 %	0 %	409249155
112	NT_187078	GAAA	2	8	63675	63682	75 %	0 %	25 %	0 %	409249156
113	NT_187078	ATTA	2	8	64419	64426	50 %	50 %	0 %	0 %	409249157
114	NT_187078	TAAA	2	8	66209	66216	75 %	25 %	0 %	0 %	409249159
115	NT_187078	ATCA	2	8	66301	66308	50 %	25 %	0 %	25 %	409249159
116	NT_187078	AATA	2	8	66967	66974	75 %	25 %	0 %	0 %	409249159
117	NT_187078	GTAG	2	8	67353	67360	25 %	25 %	50 %	0 %	409249160
118	NT_187078	TATT	2	8	67565	67572	25 %	75 %	0 %	0 %	409249160
119	NT_187078	TTCT	2	8	67903	67910	0 %	75 %	0 %	25 %	409249160
120	NT_187078	TGTT	2	8	68245	68252	0 %	75 %	25 %	0 %	409249161
121	NT_187078	TGCG	2	8	68440	68447	0 %	25 %	50 %	25 %	409249161
122	NT_187078	TCAT	2	8	68788	68795	25 %	50 %	0 %	25 %	409249161
123	NT_187078	CTGG	2	8	68822	68829	0 %	25 %	50 %	25 %	409249161
124	NT_187078	AATG	2	8	69310	69317	50 %	25 %	25 %	0 %	409249162
125	NT_187078	CATC	2	8	69753	69760	25 %	25 %	0 %	50 %	409249162
126	NT_187078	TAAT	2	8	70079	70086	50 %	50 %	0 %	0 %	409249162
127	NT_187078	ATGG	2	8	70397	70404	25 %	25 %	50 %	0 %	409249163
128	NT_187078	GATG	2	8	70609	70616	25 %	25 %	50 %	0 %	409249163
129	NT_187078	TGTA	2	8	70735	70742	25 %	50 %	25 %	0 %	409249163
130	NT_187078	ACTT	2	8	70995	71002	25 %	50 %	0 %	25 %	409249164
131	NT_187078	AAAT	2	8	71229	71236	75 %	25 %	0 %	0 %	409249164
132	NT_187078	CAAT	2	8	71379	71386	50 %	25 %	0 %	25 %	409249164
133	NT_187078	ATTG	2	8	71437	71444	25 %	50 %	25 %	0 %	409249164
134	NT_187078	GAAA	2	8	71813	71820	75 %	0 %	25 %	0 %	409249164
135	NT_187078	CTTT	2	8	71886	71893	0 %	75 %	0 %	25 %	409249164
136	NT_187078	GAAA	2	8	71984	71991	75 %	0 %	25 %	0 %	409249164
137	NT_187078	ATTA	2	8	72043	72050	50 %	50 %	0 %	0 %	409249164
138	NT_187078	TCTT	2	8	72102	72109	0 %	75 %	0 %	25 %	409249164
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.