MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187078	AG	3	6	867	872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187078	TA	3	6	908	913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187078	AT	4	8	923	930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187078	AT	3	6	1124	1129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187078	CA	3	6	1341	1346	50 %	0 %	0 %	50 %	409249100
6	NT_187078	GA	3	6	2068	2073	50 %	0 %	50 %	0 %	409249101
7	NT_187078	GC	3	6	2178	2183	0 %	0 %	50 %	50 %	409249101
8	NT_187078	CT	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	409249101
9	NT_187078	AC	3	6	3410	3415	50 %	0 %	0 %	50 %	409249102
10	NT_187078	TC	3	6	3421	3426	0 %	50 %	0 %	50 %	409249102
11	NT_187078	GC	3	6	3876	3881	0 %	0 %	50 %	50 %	409249102
12	NT_187078	AG	3	6	3910	3915	50 %	0 %	50 %	0 %	409249102
13	NT_187078	GC	3	6	4918	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	409249103
14	NT_187078	GC	4	8	4958	4965	0 %	0 %	50 %	50 %	409249103
15	NT_187078	CG	3	6	5620	5625	0 %	0 %	50 %	50 %	409249104
16	NT_187078	GC	4	8	6384	6391	0 %	0 %	50 %	50 %	409249104
17	NT_187078	AG	3	6	7179	7184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187078	GC	3	6	7446	7451	0 %	0 %	50 %	50 %	409249105
19	NT_187078	GC	4	8	7720	7727	0 %	0 %	50 %	50 %	409249105
20	NT_187078	CT	3	6	7901	7906	0 %	50 %	0 %	50 %	409249105
21	NT_187078	GC	3	6	9526	9531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187078	GC	3	6	9542	9547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NT_187078	GC	3	6	12123	12128	0 %	0 %	50 %	50 %	409249110
24	NT_187078	GC	3	6	12685	12690	0 %	0 %	50 %	50 %	409249110
25	NT_187078	GC	3	6	13213	13218	0 %	0 %	50 %	50 %	409249111
26	NT_187078	GA	3	6	14415	14420	50 %	0 %	50 %	0 %	409249111
27	NT_187078	GA	3	6	14632	14637	50 %	0 %	50 %	0 %	409249111
28	NT_187078	GC	3	6	14969	14974	0 %	0 %	50 %	50 %	409249112
29	NT_187078	CG	3	6	15452	15457	0 %	0 %	50 %	50 %	409249112
30	NT_187078	GA	3	6	15841	15846	50 %	0 %	50 %	0 %	409249113
31	NT_187078	GA	3	6	16043	16048	50 %	0 %	50 %	0 %	409249113
32	NT_187078	AG	3	6	17402	17407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187078	GC	3	6	18037	18042	0 %	0 %	50 %	50 %	409249115
34	NT_187078	GC	3	6	18490	18495	0 %	0 %	50 %	50 %	409249115
35	NT_187078	CG	3	6	19698	19703	0 %	0 %	50 %	50 %	409249116
36	NT_187078	GC	3	6	20188	20193	0 %	0 %	50 %	50 %	409249116
37	NT_187078	CG	3	6	20939	20944	0 %	0 %	50 %	50 %	409249117
38	NT_187078	CG	3	6	21370	21375	0 %	0 %	50 %	50 %	409249117
39	NT_187078	CG	3	6	22316	22321	0 %	0 %	50 %	50 %	409249117
40	NT_187078	CG	3	6	23064	23069	0 %	0 %	50 %	50 %	409249118
41	NT_187078	GC	3	6	23141	23146	0 %	0 %	50 %	50 %	409249118
42	NT_187078	GC	4	8	23199	23206	0 %	0 %	50 %	50 %	409249118
43	NT_187078	GC	3	6	23333	23338	0 %	0 %	50 %	50 %	409249118
44	NT_187078	CA	4	8	25143	25150	50 %	0 %	0 %	50 %	409249120
45	NT_187078	GA	3	6	25888	25893	50 %	0 %	50 %	0 %	409249120
46	NT_187078	CA	3	6	27109	27114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187078	GC	3	6	27737	27742	0 %	0 %	50 %	50 %	409249122
48	NT_187078	TC	3	6	28736	28741	0 %	50 %	0 %	50 %	409249122
49	NT_187078	GC	3	6	29059	29064	0 %	0 %	50 %	50 %	409249122
50	NT_187078	GC	3	6	29909	29914	0 %	0 %	50 %	50 %	409249123
51	NT_187078	GC	4	8	31948	31955	0 %	0 %	50 %	50 %	409249125
52	NT_187078	GC	4	8	32327	32334	0 %	0 %	50 %	50 %	409249125
53	NT_187078	CG	3	6	33831	33836	0 %	0 %	50 %	50 %	409249127
54	NT_187078	GC	3	6	34620	34625	0 %	0 %	50 %	50 %	409249127
55	NT_187078	GT	4	8	34636	34643	0 %	50 %	50 %	0 %	409249127
56	NT_187078	GC	3	6	34951	34956	0 %	0 %	50 %	50 %	409249128
57	NT_187078	AC	3	6	35758	35763	50 %	0 %	0 %	50 %	409249128
58	NT_187078	CG	3	6	35861	35866	0 %	0 %	50 %	50 %	409249129
59	NT_187078	GC	3	6	36101	36106	0 %	0 %	50 %	50 %	409249129
60	NT_187078	GC	3	6	36271	36276	0 %	0 %	50 %	50 %	409249129
61	NT_187078	GC	3	6	36878	36883	0 %	0 %	50 %	50 %	409249129
62	NT_187078	GT	3	6	37096	37101	0 %	50 %	50 %	0 %	409249129
63	NT_187078	GC	3	6	37570	37575	0 %	0 %	50 %	50 %	409249130
64	NT_187078	GC	3	6	37998	38003	0 %	0 %	50 %	50 %	409249130
65	NT_187078	GC	3	6	38493	38498	0 %	0 %	50 %	50 %	409249131
66	NT_187078	TC	3	6	38935	38940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187078	CG	3	6	39298	39303	0 %	0 %	50 %	50 %	409249132
68	NT_187078	GC	3	6	39863	39868	0 %	0 %	50 %	50 %	409249133
69	NT_187078	CG	3	6	39988	39993	0 %	0 %	50 %	50 %	409249133
70	NT_187078	GC	3	6	40132	40137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187078	CG	4	8	40172	40179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NT_187078	GC	3	6	40243	40248	0 %	0 %	50 %	50 %	409249134
73	NT_187078	GC	5	10	40304	40313	0 %	0 %	50 %	50 %	409249134
74	NT_187078	CG	3	6	40808	40813	0 %	0 %	50 %	50 %	409249134
75	NT_187078	CG	3	6	40871	40876	0 %	0 %	50 %	50 %	409249134
76	NT_187078	CG	3	6	41371	41376	0 %	0 %	50 %	50 %	409249135
77	NT_187078	CG	3	6	41513	41518	0 %	0 %	50 %	50 %	409249135
78	NT_187078	TC	3	6	42305	42310	0 %	50 %	0 %	50 %	409249136
79	NT_187078	AG	3	6	42903	42908	50 %	0 %	50 %	0 %	409249136
80	NT_187078	GC	3	6	43055	43060	0 %	0 %	50 %	50 %	409249136
81	NT_187078	CG	3	6	43170	43175	0 %	0 %	50 %	50 %	409249136
82	NT_187078	AC	3	6	43903	43908	50 %	0 %	0 %	50 %	409249138
83	NT_187078	GC	3	6	44031	44036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NT_187078	GA	3	6	44416	44421	50 %	0 %	50 %	0 %	409249139
85	NT_187078	CG	3	6	44928	44933	0 %	0 %	50 %	50 %	409249139
86	NT_187078	AC	3	6	45554	45559	50 %	0 %	0 %	50 %	409249140
87	NT_187078	GC	3	6	47028	47033	0 %	0 %	50 %	50 %	409249140
88	NT_187078	GC	3	6	47211	47216	0 %	0 %	50 %	50 %	409249140
89	NT_187078	GT	3	6	47497	47502	0 %	50 %	50 %	0 %	409249140
90	NT_187078	CG	3	6	49569	49574	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
91	NT_187078	GC	3	6	49946	49951	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
92	NT_187078	GC	3	6	50036	50041	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
93	NT_187078	CG	3	6	50164	50169	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
94	NT_187078	CG	3	6	50531	50536	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
95	NT_187078	GC	4	8	50581	50588	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
96	NT_187078	GC	3	6	50758	50763	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
97	NT_187078	GC	4	8	50956	50963	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
98	NT_187078	GC	3	6	50967	50972	0 %	0 %	50 %	50 %	409249143
99	NT_187078	GC	3	6	51748	51753	0 %	0 %	50 %	50 %	409249144
100	NT_187078	CG	3	6	52595	52600	0 %	0 %	50 %	50 %	409249145
101	NT_187078	CG	4	8	52997	53004	0 %	0 %	50 %	50 %	409249145
102	NT_187078	GC	3	6	53681	53686	0 %	0 %	50 %	50 %	409249145
103	NT_187078	GC	3	6	53980	53985	0 %	0 %	50 %	50 %	409249145
104	NT_187078	GC	3	6	54391	54396	0 %	0 %	50 %	50 %	409249146
105	NT_187078	GC	3	6	54436	54441	0 %	0 %	50 %	50 %	409249146
106	NT_187078	CG	4	8	56542	56549	0 %	0 %	50 %	50 %	409249148
107	NT_187078	CG	3	6	56837	56842	0 %	0 %	50 %	50 %	409249149
108	NT_187078	GC	3	6	56920	56925	0 %	0 %	50 %	50 %	409249149
109	NT_187078	GC	3	6	57403	57408	0 %	0 %	50 %	50 %	409249149
110	NT_187078	GA	3	6	57973	57978	50 %	0 %	50 %	0 %	409249149
111	NT_187078	GC	3	6	58231	58236	0 %	0 %	50 %	50 %	409249150
112	NT_187078	GC	3	6	58297	58302	0 %	0 %	50 %	50 %	409249150
113	NT_187078	CT	3	6	58692	58697	0 %	50 %	0 %	50 %	409249150
114	NT_187078	CA	3	6	58723	58728	50 %	0 %	0 %	50 %	409249150
115	NT_187078	CA	3	6	59134	59139	50 %	0 %	0 %	50 %	409249150
116	NT_187078	GC	3	6	59607	59612	0 %	0 %	50 %	50 %	409249150
117	NT_187078	CG	4	8	60629	60636	0 %	0 %	50 %	50 %	409249151
118	NT_187078	AG	3	6	61010	61015	50 %	0 %	50 %	0 %	409249152
119	NT_187078	CG	3	6	61233	61238	0 %	0 %	50 %	50 %	409249152
120	NT_187078	CG	3	6	61448	61453	0 %	0 %	50 %	50 %	409249153
121	NT_187078	CG	3	6	62302	62307	0 %	0 %	50 %	50 %	409249153
122	NT_187078	GC	3	6	62518	62523	0 %	0 %	50 %	50 %	409249154
123	NT_187078	GC	3	6	62614	62619	0 %	0 %	50 %	50 %	409249154
124	NT_187078	GC	3	6	62887	62892	0 %	0 %	50 %	50 %	409249154
125	NT_187078	TA	3	6	63180	63185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187078	AT	3	6	63198	63203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187078	CA	3	6	64238	64243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NT_187078	CG	3	6	65726	65731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NT_187078	GA	3	6	67204	67209	50 %	0 %	50 %	0 %	409249160
130	NT_187078	AT	4	8	67364	67371	50 %	50 %	0 %	0 %	409249160
131	NT_187078	AG	3	6	67586	67591	50 %	0 %	50 %	0 %	409249160
132	NT_187078	CT	3	6	67923	67928	0 %	50 %	0 %	50 %	409249160
133	NT_187078	TA	3	6	68413	68418	50 %	50 %	0 %	0 %	409249161
134	NT_187078	AT	3	6	68468	68473	50 %	50 %	0 %	0 %	409249161
135	NT_187078	TA	4	8	69618	69625	50 %	50 %	0 %	0 %	409249162
136	NT_187078	AT	3	6	71220	71225	50 %	50 %	0 %	0 %	409249164
137	NT_187078	AT	3	6	71242	71247	50 %	50 %	0 %	0 %	409249164
138	NT_187078	AT	3	6	71920	71925	50 %	50 %	0 %	0 %	409249164
139	NT_187078	TA	4	8	72830	72837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187078	AT	4	8	73038	73045	50 %	50 %	0 %	0 %	409249165
141	NT_187078	AG	3	6	73898	73903	50 %	0 %	50 %	0 %	409249166
142	NT_187078	TA	3	6	74046	74051	50 %	50 %	0 %	0 %	409249166
143	NT_187078	TA	4	8	74656	74663	50 %	50 %	0 %	0 %	409249167
144	NT_187078	AT	3	6	74894	74899	50 %	50 %	0 %	0 %	409249167
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.