MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	GTTCA	2	10	672	681	20 %	40 %	20 %	20 %	409248905
2	NT_187076	TGCTT	2	10	1238	1247	0 %	60 %	20 %	20 %	409248906
3	NT_187076	CGCGG	2	10	5609	5618	0 %	0 %	60 %	40 %	409248910
4	NT_187076	AGCGG	2	10	10371	10380	20 %	0 %	60 %	20 %	409248915
5	NT_187076	AAATG	2	10	11557	11566	60 %	20 %	20 %	0 %	409248916
6	NT_187076	CAGGG	2	10	14716	14725	20 %	0 %	60 %	20 %	409248921
7	NT_187076	CGCAT	2	10	16790	16799	20 %	20 %	20 %	40 %	409248921
8	NT_187076	TTAAG	2	10	17361	17370	40 %	40 %	20 %	0 %	409248922
9	NT_187076	GGTGA	2	10	18024	18033	20 %	20 %	60 %	0 %	409248922
10	NT_187076	TGAAC	2	10	22679	22688	40 %	20 %	20 %	20 %	409248924
11	NT_187076	TGAAG	2	10	22784	22793	40 %	20 %	40 %	0 %	409248924
12	NT_187076	TGGGC	2	10	25416	25425	0 %	20 %	60 %	20 %	409248930
13	NT_187076	CAAAA	2	10	27128	27137	80 %	0 %	0 %	20 %	409248931
14	NT_187076	ATTTT	2	10	33947	33956	20 %	80 %	0 %	0 %	409248938
15	NT_187076	ACTGG	2	10	34940	34949	20 %	20 %	40 %	20 %	409248939
16	NT_187076	CTTCT	2	10	35919	35928	0 %	60 %	0 %	40 %	409248940
17	NT_187076	GTGAG	2	10	40389	40398	20 %	20 %	60 %	0 %	409248942
18	NT_187076	TAACT	2	10	40984	40993	40 %	40 %	0 %	20 %	409248943
19	NT_187076	ATAGA	2	10	42539	42548	60 %	20 %	20 %	0 %	409248945
20	NT_187076	ACGCG	2	10	46313	46322	20 %	0 %	40 %	40 %	409248948
21	NT_187076	GCCGA	2	10	46657	46666	20 %	0 %	40 %	40 %	409248949
22	NT_187076	GTTGC	2	10	49329	49338	0 %	40 %	40 %	20 %	409248952
23	NT_187076	CCGGC	2	10	50079	50088	0 %	0 %	40 %	60 %	409248953
24	NT_187076	GCGCC	2	10	50389	50398	0 %	0 %	40 %	60 %	409248953
25	NT_187076	GTTTT	2	10	51413	51422	0 %	80 %	20 %	0 %	409248954
26	NT_187076	CGGGC	2	10	53089	53098	0 %	0 %	60 %	40 %	409248955
27	NT_187076	AACAG	2	10	55263	55272	60 %	0 %	20 %	20 %	409248957
28	NT_187076	ATGAA	2	10	57700	57709	60 %	20 %	20 %	0 %	409248959
29	NT_187076	GCCAT	2	10	58931	58940	20 %	20 %	20 %	40 %	409248961
30	NT_187076	CTGGC	2	10	59332	59341	0 %	20 %	40 %	40 %	409248961
31	NT_187076	CCGGC	2	10	62816	62825	0 %	0 %	40 %	60 %	409248965
32	NT_187076	CGCAA	2	10	63896	63905	40 %	0 %	20 %	40 %	409248965
33	NT_187076	TTGCA	2	10	65981	65990	20 %	40 %	20 %	20 %	409248967
34	NT_187076	CTGGG	2	10	66264	66273	0 %	20 %	60 %	20 %	409248968
35	NT_187076	GCAAC	2	10	67425	67434	40 %	0 %	20 %	40 %	409248968
36	NT_187076	TATGG	2	10	68414	68423	20 %	40 %	40 %	0 %	409248969
37	NT_187076	GGTTT	2	10	69452	69461	0 %	60 %	40 %	0 %	409248970
38	NT_187076	CTTTA	2	10	71569	71578	20 %	60 %	0 %	20 %	409248971
39	NT_187076	GGTTT	2	10	71583	71592	0 %	60 %	40 %	0 %	409248971
40	NT_187076	CGCGG	2	10	72424	72433	0 %	0 %	60 %	40 %	409248972
41	NT_187076	GAAGA	2	10	75328	75337	60 %	0 %	40 %	0 %	409248975
42	NT_187076	CCGCC	2	10	75701	75710	0 %	0 %	20 %	80 %	409248975
43	NT_187076	CGGAA	2	10	77828	77837	40 %	0 %	40 %	20 %	409248976
44	NT_187076	GACGT	2	10	81245	81254	20 %	20 %	40 %	20 %	409248980
45	NT_187076	AGCGC	2	10	82440	82449	20 %	0 %	40 %	40 %	409248981
46	NT_187076	GCGCC	2	10	82510	82519	0 %	0 %	40 %	60 %	409248981
47	NT_187076	GATGT	2	10	84662	84671	20 %	40 %	40 %	0 %	409248984
48	NT_187076	CGAGC	2	10	84811	84820	20 %	0 %	40 %	40 %	409248984
49	NT_187076	TACCG	2	10	88204	88213	20 %	20 %	20 %	40 %	409248988
50	NT_187076	CCAGG	2	10	88531	88540	20 %	0 %	40 %	40 %	409248988
51	NT_187076	CCGTG	2	10	91179	91188	0 %	20 %	40 %	40 %	409248991
52	NT_187076	CGGGG	2	10	91194	91203	0 %	0 %	80 %	20 %	409248991
53	NT_187076	TCCGT	2	10	91717	91726	0 %	40 %	20 %	40 %	409248991
54	NT_187076	CGCGT	2	10	92185	92194	0 %	20 %	40 %	40 %	409248991
55	NT_187076	TTAAA	2	10	93022	93031	60 %	40 %	0 %	0 %	409248992
56	NT_187076	CGGCA	2	10	93884	93893	20 %	0 %	40 %	40 %	409248993
57	NT_187076	TCTCT	2	10	100441	100450	0 %	60 %	0 %	40 %	409249002
58	NT_187076	GTCGC	2	10	103931	103940	0 %	20 %	40 %	40 %	409249006
59	NT_187076	GCAGG	2	10	106745	106754	20 %	0 %	60 %	20 %	409249008
60	NT_187076	GACCG	2	10	107569	107578	20 %	0 %	40 %	40 %	409249008
61	NT_187076	TTACC	2	10	109571	109580	20 %	40 %	0 %	40 %	409249009
62	NT_187076	TGTTT	2	10	111930	111939	0 %	80 %	20 %	0 %	409249010
63	NT_187076	AAATT	2	10	112054	112063	60 %	40 %	0 %	0 %	409249011
64	NT_187076	GCCGG	2	10	112463	112472	0 %	0 %	60 %	40 %	409249011
65	NT_187076	TCACT	2	10	113975	113984	20 %	40 %	0 %	40 %	409249012
66	NT_187076	AGCCC	2	10	114100	114109	20 %	0 %	20 %	60 %	409249013
67	NT_187076	CAGAC	2	10	114612	114621	40 %	0 %	20 %	40 %	409249013
68	NT_187076	AAACA	2	10	118259	118268	80 %	0 %	0 %	20 %	409249020
69	NT_187076	AAGGG	2	10	120301	120310	40 %	0 %	60 %	0 %	409249022
70	NT_187076	AGCGC	2	10	122531	122540	20 %	0 %	40 %	40 %	409249023
71	NT_187076	GAAAC	2	10	122938	122947	60 %	0 %	20 %	20 %	409249024
72	NT_187076	CTCGC	2	10	123477	123486	0 %	20 %	20 %	60 %	409249024
73	NT_187076	GCGCT	2	10	125552	125561	0 %	20 %	40 %	40 %	409249026
74	NT_187076	GTACC	2	10	126784	126793	20 %	20 %	20 %	40 %	409249026
75	NT_187076	GTTGT	2	10	127088	127097	0 %	60 %	40 %	0 %	409249026
76	NT_187076	GCGCC	2	10	130151	130160	0 %	0 %	40 %	60 %	409249028
77	NT_187076	CATCA	2	10	131104	131113	40 %	20 %	0 %	40 %	409249029
78	NT_187076	AGCGC	2	10	131168	131177	20 %	0 %	40 %	40 %	409249029
79	NT_187076	GAAGC	2	10	131844	131853	40 %	0 %	40 %	20 %	409249030
80	NT_187076	GCGAT	2	10	131993	132002	20 %	20 %	40 %	20 %	409249030
81	NT_187076	GCGCC	2	10	132059	132068	0 %	0 %	40 %	60 %	409249030
82	NT_187076	TGGCG	2	10	132607	132616	0 %	20 %	60 %	20 %	409249031
83	NT_187076	CGGCG	2	10	133585	133594	0 %	0 %	60 %	40 %	409249031
84	NT_187076	CGCCA	2	10	135491	135500	20 %	0 %	20 %	60 %	409249033
85	NT_187076	CGCCA	2	10	136781	136790	20 %	0 %	20 %	60 %	409249034
86	NT_187076	GATCT	2	10	137499	137508	20 %	40 %	20 %	20 %	409249034
87	NT_187076	AGATC	2	10	137552	137561	40 %	20 %	20 %	20 %	409249034
88	NT_187076	TGCGT	2	10	137781	137790	0 %	40 %	40 %	20 %	409249034
89	NT_187076	CGGGG	2	10	138779	138788	0 %	0 %	80 %	20 %	409249036
90	NT_187076	ACCGG	2	10	141039	141048	20 %	0 %	40 %	40 %	409249038
91	NT_187076	AGGCC	2	10	141161	141170	20 %	0 %	40 %	40 %	409249038
92	NT_187076	GCCGG	2	10	142651	142660	0 %	0 %	60 %	40 %	409249040
93	NT_187076	GCCGG	2	10	143544	143553	0 %	0 %	60 %	40 %	409249040
94	NT_187076	GCGCC	2	10	144553	144562	0 %	0 %	40 %	60 %	409249042
95	NT_187076	TCCTC	2	10	145424	145433	0 %	40 %	0 %	60 %	409249043
96	NT_187076	ATCTT	2	10	148143	148152	20 %	60 %	0 %	20 %	409249046
97	NT_187076	AACGT	2	10	150564	150573	40 %	20 %	20 %	20 %	409249048
98	NT_187076	CCGGC	2	10	150729	150738	0 %	0 %	40 %	60 %	409249048
99	NT_187076	TTATT	2	10	152482	152491	20 %	80 %	0 %	0 %	409249049
100	NT_187076	CTGGA	2	10	154472	154481	20 %	20 %	40 %	20 %	409249050
101	NT_187076	TGCAG	2	10	155256	155265	20 %	20 %	40 %	20 %	409249051
102	NT_187076	CGGCG	2	10	157173	157182	0 %	0 %	60 %	40 %	409249055
103	NT_187076	CTAAG	2	10	160292	160301	40 %	20 %	20 %	20 %	409249058
104	NT_187076	CCGCC	2	10	161415	161424	0 %	0 %	20 %	80 %	409249059
105	NT_187076	GCGAC	2	10	161427	161436	20 %	0 %	40 %	40 %	409249059
106	NT_187076	AGTGG	2	10	162525	162534	20 %	20 %	60 %	0 %	409249060
107	NT_187076	GATCA	2	10	163502	163511	40 %	20 %	20 %	20 %	409249061
108	NT_187076	GCTCT	2	10	165771	165780	0 %	40 %	20 %	40 %	409249064
109	NT_187076	CGCGC	2	10	172637	172646	0 %	0 %	40 %	60 %	409249072
110	NT_187076	TAGCG	2	10	174257	174266	20 %	20 %	40 %	20 %	409249074
111	NT_187076	TTCAA	2	10	174685	174694	40 %	40 %	0 %	20 %	409249075
112	NT_187076	TTTTC	2	10	176342	176351	0 %	80 %	0 %	20 %	409249077
113	NT_187076	TTAAT	2	10	177241	177250	40 %	60 %	0 %	0 %	409249079
114	NT_187076	GGCCA	2	10	179448	179457	20 %	0 %	40 %	40 %	409249080
115	NT_187076	TCCGC	2	10	179557	179566	0 %	20 %	20 %	60 %	409249080
116	NT_187076	CAGAC	2	10	180289	180298	40 %	0 %	20 %	40 %	409249081
117	NT_187076	GCCGT	2	10	181141	181150	0 %	20 %	40 %	40 %	409249082
118	NT_187076	GATAG	2	10	187562	187571	40 %	20 %	40 %	0 %	409249089
119	NT_187076	AGGCC	2	10	189339	189348	20 %	0 %	40 %	40 %	409249090
120	NT_187076	CGGGA	2	10	194432	194441	20 %	0 %	60 %	20 %	409249095

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.