MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	TATT	2	8	33	40	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187076	GGAA	2	8	9422	9429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187076	CCCA	2	8	9477	9484	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NT_187076	AGGG	2	8	11738	11745	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187076	AACT	2	8	13753	13760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NT_187076	TTGT	2	8	13925	13932	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187076	TTAA	2	8	14022	14029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187076	AATC	2	8	14115	14122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NT_187076	TACA	2	8	18649	18656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187076	ATGT	2	8	18664	18671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187076	TGTT	2	8	19399	19406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187076	ACGG	2	8	30798	30805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NT_187076	ACGG	2	8	30856	30863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NT_187076	CGTC	2	8	34050	34057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NT_187076	GAAG	2	8	38668	38675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187076	TCGG	2	8	42077	42084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NT_187076	CGTT	2	8	50898	50905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187076	CTAT	2	8	54824	54831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NT_187076	GCCT	2	8	56065	56072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187076	CGCT	2	8	62515	62522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187076	ATTT	2	8	67484	67491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187076	ATTT	2	8	76253	76260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187076	TAAA	2	8	76290	76297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187076	CCGT	2	8	87589	87596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NT_187076	ATTA	2	8	87854	87861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187076	TAAT	2	8	87895	87902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187076	ATCT	2	8	87910	87917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NT_187076	TGGC	2	8	96158	96165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187076	ATAA	2	8	96167	96174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187076	CGCC	2	8	98024	98031	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NT_187076	TTAT	2	8	99087	99094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187076	ATAA	2	8	100466	100473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187076	GAAA	2	8	100549	100556	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187076	AGGG	2	8	107990	107997	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187076	CGTT	2	8	108005	108012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187076	AGTA	2	8	108056	108063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187076	TGGT	2	8	116508	116515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187076	ACTC	2	8	117669	117676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NT_187076	TCCC	2	8	120344	120351	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NT_187076	GAGG	2	8	120357	120364	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187076	TATC	2	8	132423	132430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NT_187076	TCTG	2	8	133773	133780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187076	TAAA	2	8	146794	146801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187076	TTTA	2	8	147855	147862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187076	CGGG	2	8	148037	148044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NT_187076	ACTT	2	8	149885	149892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NT_187076	AAAG	2	8	151887	151894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187076	TTAT	2	8	151959	151966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187076	TTTC	2	8	156671	156678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NT_187076	TTAT	2	8	166574	166581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187076	ATTT	2	8	166632	166639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187076	AATT	2	8	166688	166695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187076	TTTA	2	8	172395	172402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187076	GCGT	2	8	174647	174654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NT_187076	GGCA	2	8	178494	178501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NT_187076	GCTC	2	8	187019	187026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NT_187076	TCAT	2	8	187042	187049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NT_187076	CGCA	2	8	187269	187276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.