MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	GTAA	2	8	55	62	50 %	25 %	25 %	0 %	409248905
2	NT_187076	CCAG	2	8	278	285	25 %	0 %	25 %	50 %	409248905
3	NT_187076	AGCG	2	8	922	929	25 %	0 %	50 %	25 %	409248905
4	NT_187076	CGCA	2	8	2306	2313	25 %	0 %	25 %	50 %	409248907
5	NT_187076	AGGT	2	8	3105	3112	25 %	25 %	50 %	0 %	409248907
6	NT_187076	AATT	2	8	3844	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	409248908
7	NT_187076	AGTT	2	8	5200	5207	25 %	50 %	25 %	0 %	409248908
8	NT_187076	TTTC	2	8	5312	5319	0 %	75 %	0 %	25 %	409248909
9	NT_187076	CTCG	2	8	5376	5383	0 %	25 %	25 %	50 %	409248909
10	NT_187076	CATT	2	8	7357	7364	25 %	50 %	0 %	25 %	409248912
11	NT_187076	GGAA	2	8	7462	7469	50 %	0 %	50 %	0 %	409248912
12	NT_187076	TTTC	2	8	7637	7644	0 %	75 %	0 %	25 %	409248912
13	NT_187076	GAAT	2	8	7908	7915	50 %	25 %	25 %	0 %	409248912
14	NT_187076	CATA	2	8	8085	8092	50 %	25 %	0 %	25 %	409248912
15	NT_187076	TGAA	2	8	8299	8306	50 %	25 %	25 %	0 %	409248913
16	NT_187076	GCTG	2	8	8526	8533	0 %	25 %	50 %	25 %	409248913
17	NT_187076	GTAC	2	8	8566	8573	25 %	25 %	25 %	25 %	409248913
18	NT_187076	TATT	2	8	8684	8691	25 %	75 %	0 %	0 %	409248913
19	NT_187076	GATT	2	8	9991	9998	25 %	50 %	25 %	0 %	409248915
20	NT_187076	CAGC	2	8	10099	10106	25 %	0 %	25 %	50 %	409248915
21	NT_187076	AAGG	2	8	10127	10134	50 %	0 %	50 %	0 %	409248915
22	NT_187076	CAGC	2	8	10303	10310	25 %	0 %	25 %	50 %	409248915
23	NT_187076	GCCA	2	8	10989	10996	25 %	0 %	25 %	50 %	409248915
24	NT_187076	GACA	2	8	11021	11028	50 %	0 %	25 %	25 %	409248915
25	NT_187076	GGCT	2	8	11765	11772	0 %	25 %	50 %	25 %	409248917
26	NT_187076	ATAA	2	8	12019	12026	75 %	25 %	0 %	0 %	409248917
27	NT_187076	ATAA	2	8	12112	12119	75 %	25 %	0 %	0 %	409248917
28	NT_187076	AAGG	2	8	12703	12710	50 %	0 %	50 %	0 %	409248918
29	NT_187076	TTAT	2	8	12766	12773	25 %	75 %	0 %	0 %	409248918
30	NT_187076	GATG	2	8	12800	12807	25 %	25 %	50 %	0 %	409248918
31	NT_187076	TCGG	2	8	12847	12854	0 %	25 %	50 %	25 %	409248918
32	NT_187076	GAAT	2	8	13083	13090	50 %	25 %	25 %	0 %	409248919
33	NT_187076	CAGC	2	8	13173	13180	25 %	0 %	25 %	50 %	409248919
34	NT_187076	ATTT	2	8	13200	13207	25 %	75 %	0 %	0 %	409248919
35	NT_187076	ATCT	2	8	13468	13475	25 %	50 %	0 %	25 %	409248920
36	NT_187076	CAAT	2	8	13479	13486	50 %	25 %	0 %	25 %	409248920
37	NT_187076	TACC	2	8	14331	14338	25 %	25 %	0 %	50 %	409248921
38	NT_187076	AGTC	2	8	14578	14585	25 %	25 %	25 %	25 %	409248921
39	NT_187076	CAGC	2	8	14598	14605	25 %	0 %	25 %	50 %	409248921
40	NT_187076	CGAT	2	8	15050	15057	25 %	25 %	25 %	25 %	409248921
41	NT_187076	TCAA	2	8	15287	15294	50 %	25 %	0 %	25 %	409248921
42	NT_187076	AAGA	2	8	15653	15660	75 %	0 %	25 %	0 %	409248921
43	NT_187076	ACGA	2	8	15670	15677	50 %	0 %	25 %	25 %	409248921
44	NT_187076	AATA	2	8	15982	15989	75 %	25 %	0 %	0 %	409248921
45	NT_187076	CTTC	2	8	16056	16063	0 %	50 %	0 %	50 %	409248921
46	NT_187076	GCTG	2	8	16487	16494	0 %	25 %	50 %	25 %	409248921
47	NT_187076	CGAT	2	8	17321	17328	25 %	25 %	25 %	25 %	409248921
48	NT_187076	TGTT	2	8	17409	17416	0 %	75 %	25 %	0 %	409248922
49	NT_187076	CGAA	2	8	17679	17686	50 %	0 %	25 %	25 %	409248922
50	NT_187076	CAGC	2	8	18115	18122	25 %	0 %	25 %	50 %	409248922
51	NT_187076	CAGC	2	8	19937	19944	25 %	0 %	25 %	50 %	409248924
52	NT_187076	CAGC	2	8	20363	20370	25 %	0 %	25 %	50 %	409248924
53	NT_187076	GAAA	2	8	20457	20464	75 %	0 %	25 %	0 %	409248924
54	NT_187076	TAAA	2	8	20749	20756	75 %	25 %	0 %	0 %	409248924
55	NT_187076	TATT	2	8	20980	20987	25 %	75 %	0 %	0 %	409248924
56	NT_187076	GATC	2	8	21134	21141	25 %	25 %	25 %	25 %	409248924
57	NT_187076	CTGG	2	8	21257	21264	0 %	25 %	50 %	25 %	409248924
58	NT_187076	GATG	2	8	21434	21441	25 %	25 %	50 %	0 %	409248924
59	NT_187076	TGGC	2	8	22212	22219	0 %	25 %	50 %	25 %	409248924
60	NT_187076	ATCG	2	8	22695	22702	25 %	25 %	25 %	25 %	409248924
61	NT_187076	GCCA	2	8	24364	24371	25 %	0 %	25 %	50 %	409248927
62	NT_187076	TGGC	3	12	24685	24696	0 %	25 %	50 %	25 %	409248928
63	NT_187076	TGAT	2	8	25008	25015	25 %	50 %	25 %	0 %	409248928
64	NT_187076	GTTG	2	8	25329	25336	0 %	50 %	50 %	0 %	409248930
65	NT_187076	CTGA	2	8	26511	26518	25 %	25 %	25 %	25 %	409248931
66	NT_187076	AAAG	2	8	27263	27270	75 %	0 %	25 %	0 %	409248931
67	NT_187076	CTTT	2	8	27438	27445	0 %	75 %	0 %	25 %	409248931
68	NT_187076	TCAG	2	8	28899	28906	25 %	25 %	25 %	25 %	409248934
69	NT_187076	CGTA	2	8	29286	29293	25 %	25 %	25 %	25 %	409248934
70	NT_187076	GTAC	2	8	29769	29776	25 %	25 %	25 %	25 %	409248934
71	NT_187076	TGAT	2	8	29843	29850	25 %	50 %	25 %	0 %	409248934
72	NT_187076	GTCG	2	8	30315	30322	0 %	25 %	50 %	25 %	409248934
73	NT_187076	AGAA	2	8	31710	31717	75 %	0 %	25 %	0 %	409248935
74	NT_187076	ATCT	2	8	32233	32240	25 %	50 %	0 %	25 %	409248937
75	NT_187076	GGAT	2	8	32241	32248	25 %	25 %	50 %	0 %	409248937
76	NT_187076	GCGG	2	8	32906	32913	0 %	0 %	75 %	25 %	409248937
77	NT_187076	CTGG	2	8	33715	33722	0 %	25 %	50 %	25 %	409248938
78	NT_187076	GGGC	2	8	35150	35157	0 %	0 %	75 %	25 %	409248939
79	NT_187076	GCGG	2	8	35494	35501	0 %	0 %	75 %	25 %	409248940
80	NT_187076	TCGC	2	8	35538	35545	0 %	25 %	25 %	50 %	409248940
81	NT_187076	CAGC	2	8	35694	35701	25 %	0 %	25 %	50 %	409248940
82	NT_187076	CGAT	2	8	36194	36201	25 %	25 %	25 %	25 %	409248940
83	NT_187076	CAGC	2	8	36687	36694	25 %	0 %	25 %	50 %	409248940
84	NT_187076	AGAC	2	8	36774	36781	50 %	0 %	25 %	25 %	409248940
85	NT_187076	CAGC	2	8	38025	38032	25 %	0 %	25 %	50 %	409248941
86	NT_187076	GGTT	2	8	38563	38570	0 %	50 %	50 %	0 %	409248941
87	NT_187076	CTTT	2	8	39163	39170	0 %	75 %	0 %	25 %	409248942
88	NT_187076	ATGA	2	8	39368	39375	50 %	25 %	25 %	0 %	409248942
89	NT_187076	GCCT	2	8	39471	39478	0 %	25 %	25 %	50 %	409248942
90	NT_187076	TCAC	2	8	39508	39515	25 %	25 %	0 %	50 %	409248942
91	NT_187076	AGTT	2	8	40920	40927	25 %	50 %	25 %	0 %	409248943
92	NT_187076	ATAA	2	8	42912	42919	75 %	25 %	0 %	0 %	409248945
93	NT_187076	GTTC	2	8	43742	43749	0 %	50 %	25 %	25 %	409248946
94	NT_187076	CCGC	2	8	44869	44876	0 %	0 %	25 %	75 %	409248946
95	NT_187076	AGCC	2	8	44910	44917	25 %	0 %	25 %	50 %	409248946
96	NT_187076	ACCG	2	8	44985	44992	25 %	0 %	25 %	50 %	409248946
97	NT_187076	CTTT	2	8	45499	45506	0 %	75 %	0 %	25 %	409248946
98	NT_187076	CAAT	2	8	45973	45980	50 %	25 %	0 %	25 %	409248947
99	NT_187076	CCGT	2	8	46216	46223	0 %	25 %	25 %	50 %	409248948
100	NT_187076	GTCG	2	8	46291	46298	0 %	25 %	50 %	25 %	409248948
101	NT_187076	CCAG	2	8	46323	46330	25 %	0 %	25 %	50 %	409248948
102	NT_187076	CGGG	2	8	46967	46974	0 %	0 %	75 %	25 %	409248949
103	NT_187076	CAAC	2	8	48698	48705	50 %	0 %	0 %	50 %	409248951
104	NT_187076	GATC	2	8	48896	48903	25 %	25 %	25 %	25 %	409248951
105	NT_187076	CAGC	2	8	48955	48962	25 %	0 %	25 %	50 %	409248951
106	NT_187076	GATC	2	8	50663	50670	25 %	25 %	25 %	25 %	409248953
107	NT_187076	CGAC	2	8	51405	51412	25 %	0 %	25 %	50 %	409248954
108	NT_187076	CTGG	2	8	52298	52305	0 %	25 %	50 %	25 %	409248955
109	NT_187076	GCTG	2	8	52876	52883	0 %	25 %	50 %	25 %	409248955
110	NT_187076	ATTT	2	8	53385	53392	25 %	75 %	0 %	0 %	409248955
111	NT_187076	GGCG	2	8	53468	53475	0 %	0 %	75 %	25 %	409248955
112	NT_187076	TTCC	2	8	54112	54119	0 %	50 %	0 %	50 %	409248955
113	NT_187076	GAAA	2	8	54403	54410	75 %	0 %	25 %	0 %	409248955
114	NT_187076	CGTT	2	8	54611	54618	0 %	50 %	25 %	25 %	409248955
115	NT_187076	ATCG	2	8	54874	54881	25 %	25 %	25 %	25 %	409248957
116	NT_187076	ACCG	2	8	56558	56565	25 %	0 %	25 %	50 %	409248958
117	NT_187076	CCAG	2	8	57274	57281	25 %	0 %	25 %	50 %	409248959
118	NT_187076	GGCT	2	8	57431	57438	0 %	25 %	50 %	25 %	409248959
119	NT_187076	CAGA	2	8	57653	57660	50 %	0 %	25 %	25 %	409248959
120	NT_187076	CTGG	2	8	58731	58738	0 %	25 %	50 %	25 %	409248960
121	NT_187076	GACA	2	8	58759	58766	50 %	0 %	25 %	25 %	409248960
122	NT_187076	GTTT	2	8	59318	59325	0 %	75 %	25 %	0 %	409248961
123	NT_187076	CATC	2	8	59768	59775	25 %	25 %	0 %	50 %	409248961
124	NT_187076	TGTC	2	8	59890	59897	0 %	50 %	25 %	25 %	409248961
125	NT_187076	CTAT	2	8	62348	62355	25 %	50 %	0 %	25 %	409248964
126	NT_187076	ATGT	2	8	62620	62627	25 %	50 %	25 %	0 %	409248965
127	NT_187076	AGCC	2	8	63143	63150	25 %	0 %	25 %	50 %	409248965
128	NT_187076	AGAC	2	8	63813	63820	50 %	0 %	25 %	25 %	409248965
129	NT_187076	AAAT	2	8	64685	64692	75 %	25 %	0 %	0 %	409248966
130	NT_187076	ATTA	2	8	64872	64879	50 %	50 %	0 %	0 %	409248966
131	NT_187076	ATTA	2	8	65038	65045	50 %	50 %	0 %	0 %	409248966
132	NT_187076	GTAA	2	8	66342	66349	50 %	25 %	25 %	0 %	409248968
133	NT_187076	ATTT	2	8	67316	67323	25 %	75 %	0 %	0 %	409248968
134	NT_187076	ATGG	2	8	67651	67658	25 %	25 %	50 %	0 %	409248969
135	NT_187076	AATG	2	8	67780	67787	50 %	25 %	25 %	0 %	409248969
136	NT_187076	GGCA	2	8	67792	67799	25 %	0 %	50 %	25 %	409248969
137	NT_187076	TAAA	2	8	68085	68092	75 %	25 %	0 %	0 %	409248969
138	NT_187076	CATT	2	8	68309	68316	25 %	50 %	0 %	25 %	409248969
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.