MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	GGA	2	6	27	32	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187076	TTG	2	6	1152	1157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187076	GCG	2	6	5432	5437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187076	TCA	2	6	7191	7196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187076	CGC	2	6	7206	7211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NT_187076	CGG	2	6	8255	8260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187076	CTG	2	6	8271	8276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187076	TGA	2	6	8283	8288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187076	CTG	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187076	GCC	2	6	11205	11210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187076	AAC	2	6	11595	11600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187076	GTA	2	6	12263	12268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187076	TGG	2	6	12913	12918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187076	AAT	2	6	12938	12943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187076	TTA	2	6	13015	13020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187076	GAG	2	6	13029	13034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187076	TAA	2	6	13315	13320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187076	TCG	2	6	13894	13899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187076	TTA	2	6	14095	14100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187076	TGC	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187076	TAT	2	6	18630	18635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187076	CGT	2	6	18636	18641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187076	ATT	2	6	19432	19437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187076	TTG	2	6	23823	23828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187076	GGC	2	6	28772	28777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187076	TTG	2	6	28855	28860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187076	ATA	2	6	31027	31032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187076	GGC	2	6	31077	31082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187076	TGG	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187076	GGC	2	6	32029	32034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187076	TCG	2	6	34025	34030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187076	ATG	2	6	37309	37314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187076	TAG	2	6	38618	38623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187076	ATT	2	6	38632	38637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187076	TAT	2	6	38701	38706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187076	CTG	2	6	40467	40472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187076	CTT	2	6	41012	41017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187076	ATA	3	9	41149	41157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187076	TAA	2	6	43026	43031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187076	TGC	2	6	43048	43053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187076	TCA	2	6	45593	45598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187076	CCT	2	6	47470	47475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NT_187076	TTA	2	6	47551	47556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187076	AAC	2	6	47590	47595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187076	GAT	2	6	49062	49067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187076	GAC	2	6	49094	49099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187076	GCC	2	6	50952	50957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NT_187076	GCT	2	6	51714	51719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187076	GCT	2	6	51948	51953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187076	AAC	2	6	51956	51961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187076	ACC	2	6	51983	51988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NT_187076	CGG	2	6	52005	52010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187076	CAG	2	6	52015	52020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187076	CAC	2	6	52152	52157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NT_187076	GGC	2	6	52188	52193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187076	CGG	2	6	52204	52209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187076	AGG	3	9	52235	52243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187076	ACA	2	6	54768	54773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187076	TTA	2	6	54792	54797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187076	CAT	2	6	56099	56104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187076	AAT	2	6	56107	56112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187076	CAG	2	6	56121	56126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187076	ATC	2	6	59924	59929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187076	CCT	2	6	60909	60914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187076	AGT	2	6	60957	60962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187076	ATA	2	6	60968	60973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187076	CTT	2	6	61619	61624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187076	AAT	2	6	65168	65173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187076	GAA	2	6	66197	66202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187076	AAT	2	6	67453	67458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187076	AAC	2	6	67513	67518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187076	CGT	2	6	70461	70466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187076	ACG	2	6	70468	70473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187076	AGG	2	6	73032	73037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187076	CCG	2	6	73043	73048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NT_187076	ACG	2	6	76167	76172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187076	TGT	2	6	76333	76338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187076	TAA	2	6	76353	76358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187076	ATT	2	6	76450	76455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187076	GTT	2	6	76461	76466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187076	GCG	2	6	81128	81133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187076	GCC	2	6	81145	81150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NT_187076	GCT	2	6	82763	82768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187076	CGA	2	6	82840	82845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187076	TGC	2	6	84171	84176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187076	AAT	2	6	84187	84192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187076	ATT	2	6	84208	84213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187076	GAT	2	6	86324	86329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187076	TCA	2	6	87653	87658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187076	TCG	2	6	87684	87689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187076	GGC	2	6	87702	87707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187076	CTT	2	6	87743	87748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187076	TTA	2	6	87821	87826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187076	ATA	2	6	87958	87963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187076	GAT	2	6	88652	88657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187076	AAT	2	6	94895	94900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187076	TAA	2	6	94944	94949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187076	CAA	2	6	94974	94979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187076	TGT	2	6	95152	95157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187076	ATA	2	6	95172	95177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187076	TAA	2	6	95208	95213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187076	GAG	2	6	95248	95253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187076	CTG	2	6	96252	96257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187076	TAA	2	6	96425	96430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187076	CCA	2	6	96442	96447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NT_187076	CTC	2	6	96452	96457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NT_187076	ATG	2	6	96467	96472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187076	CAT	2	6	96517	96522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187076	ATT	2	6	96564	96569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187076	ATC	2	6	97570	97575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187076	ATC	2	6	97616	97621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187076	TGC	2	6	97774	97779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187076	TAT	2	6	100578	100583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187076	TCG	2	6	101466	101471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187076	TGA	2	6	101501	101506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187076	ATG	2	6	101507	101512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187076	CAG	2	6	105717	105722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187076	ATG	2	6	105726	105731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187076	CTG	2	6	105733	105738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187076	CGT	2	6	105851	105856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187076	CAA	2	6	105899	105904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187076	GAT	3	9	105958	105966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187076	CGT	2	6	105973	105978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187076	CAA	2	6	105985	105990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187076	CGT	2	6	108092	108097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187076	AGA	2	6	110916	110921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187076	GCC	2	6	110984	110989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NT_187076	TCC	2	6	112016	112021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NT_187076	ATA	2	6	112034	112039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187076	TAA	2	6	112048	112053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187076	ATT	2	6	115710	115715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187076	CAG	2	6	116533	116538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187076	GGA	2	6	116567	116572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187076	TTA	2	6	117755	117760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187076	GTG	2	6	122692	122697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187076	AAT	2	6	122758	122763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187076	ATA	2	6	122800	122805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187076	GTT	2	6	128170	128175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187076	ATA	2	6	128207	128212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.