MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	CG	3	6	823	828	0 %	0 %	50 %	50 %	409248905
2	NT_187076	CT	3	6	1267	1272	0 %	50 %	0 %	50 %	409248906
3	NT_187076	CG	5	10	2062	2071	0 %	0 %	50 %	50 %	409248907
4	NT_187076	CG	3	6	2434	2439	0 %	0 %	50 %	50 %	409248907
5	NT_187076	GA	3	6	2883	2888	50 %	0 %	50 %	0 %	409248907
6	NT_187076	GC	3	6	3291	3296	0 %	0 %	50 %	50 %	409248907
7	NT_187076	CT	3	6	3549	3554	0 %	50 %	0 %	50 %	409248908
8	NT_187076	GC	3	6	4146	4151	0 %	0 %	50 %	50 %	409248908
9	NT_187076	GA	3	6	4684	4689	50 %	0 %	50 %	0 %	409248908
10	NT_187076	CT	3	6	4694	4699	0 %	50 %	0 %	50 %	409248908
11	NT_187076	GC	3	6	4851	4856	0 %	0 %	50 %	50 %	409248908
12	NT_187076	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	409248911
13	NT_187076	CT	3	6	6318	6323	0 %	50 %	0 %	50 %	409248911
14	NT_187076	GC	3	6	6376	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	409248911
15	NT_187076	GC	3	6	6754	6759	0 %	0 %	50 %	50 %	409248911
16	NT_187076	CG	3	6	8637	8642	0 %	0 %	50 %	50 %	409248913
17	NT_187076	GC	3	6	9856	9861	0 %	0 %	50 %	50 %	409248915
18	NT_187076	CT	3	6	10740	10745	0 %	50 %	0 %	50 %	409248915
19	NT_187076	GC	3	6	14346	14351	0 %	0 %	50 %	50 %	409248921
20	NT_187076	GC	3	6	14607	14612	0 %	0 %	50 %	50 %	409248921
21	NT_187076	TG	3	6	15581	15586	0 %	50 %	50 %	0 %	409248921
22	NT_187076	CG	3	6	16252	16257	0 %	0 %	50 %	50 %	409248921
23	NT_187076	GC	3	6	17727	17732	0 %	0 %	50 %	50 %	409248922
24	NT_187076	GC	3	6	17980	17985	0 %	0 %	50 %	50 %	409248922
25	NT_187076	AG	4	8	18280	18287	50 %	0 %	50 %	0 %	409248922
26	NT_187076	CG	3	6	18831	18836	0 %	0 %	50 %	50 %	409248923
27	NT_187076	GC	3	6	19324	19329	0 %	0 %	50 %	50 %	409248923
28	NT_187076	TC	3	6	19649	19654	0 %	50 %	0 %	50 %	409248924
29	NT_187076	CG	3	6	20442	20447	0 %	0 %	50 %	50 %	409248924
30	NT_187076	CG	3	6	21147	21152	0 %	0 %	50 %	50 %	409248924
31	NT_187076	CG	3	6	21741	21746	0 %	0 %	50 %	50 %	409248924
32	NT_187076	CG	3	6	22689	22694	0 %	0 %	50 %	50 %	409248924
33	NT_187076	GC	4	8	22974	22981	0 %	0 %	50 %	50 %	409248925
34	NT_187076	AG	3	6	23613	23618	50 %	0 %	50 %	0 %	409248925
35	NT_187076	GC	3	6	23950	23955	0 %	0 %	50 %	50 %	409248926
36	NT_187076	GC	4	8	24492	24499	0 %	0 %	50 %	50 %	409248927
37	NT_187076	CT	3	6	24553	24558	0 %	50 %	0 %	50 %	409248927
38	NT_187076	GC	3	6	25400	25405	0 %	0 %	50 %	50 %	409248930
39	NT_187076	CG	3	6	25990	25995	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
40	NT_187076	GC	3	6	26199	26204	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
41	NT_187076	CG	3	6	26454	26459	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
42	NT_187076	GC	3	6	26670	26675	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
43	NT_187076	GC	3	6	27093	27098	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
44	NT_187076	GC	4	8	27110	27117	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
45	NT_187076	CG	4	8	27162	27169	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
46	NT_187076	GC	3	6	27225	27230	0 %	0 %	50 %	50 %	409248931
47	NT_187076	AG	3	6	27761	27766	50 %	0 %	50 %	0 %	409248931
48	NT_187076	GC	3	6	27970	27975	0 %	0 %	50 %	50 %	409248932
49	NT_187076	GC	3	6	31267	31272	0 %	0 %	50 %	50 %	409248935
50	NT_187076	GC	3	6	31777	31782	0 %	0 %	50 %	50 %	409248935
51	NT_187076	TA	3	6	32268	32273	50 %	50 %	0 %	0 %	409248937
52	NT_187076	CG	3	6	32299	32304	0 %	0 %	50 %	50 %	409248937
53	NT_187076	GC	3	6	32559	32564	0 %	0 %	50 %	50 %	409248937
54	NT_187076	CG	3	6	32679	32684	0 %	0 %	50 %	50 %	409248937
55	NT_187076	GC	4	8	33028	33035	0 %	0 %	50 %	50 %	409248938
56	NT_187076	CG	3	6	33219	33224	0 %	0 %	50 %	50 %	409248938
57	NT_187076	GC	3	6	33441	33446	0 %	0 %	50 %	50 %	409248938
58	NT_187076	GA	3	6	33528	33533	50 %	0 %	50 %	0 %	409248938
59	NT_187076	TA	3	6	34987	34992	50 %	50 %	0 %	0 %	409248939
60	NT_187076	GC	3	6	35194	35199	0 %	0 %	50 %	50 %	409248939
61	NT_187076	GT	3	6	35307	35312	0 %	50 %	50 %	0 %	409248939
62	NT_187076	AT	3	6	35578	35583	50 %	50 %	0 %	0 %	409248940
63	NT_187076	GC	3	6	35603	35608	0 %	0 %	50 %	50 %	409248940
64	NT_187076	CG	3	6	36476	36481	0 %	0 %	50 %	50 %	409248940
65	NT_187076	GC	4	8	36743	36750	0 %	0 %	50 %	50 %	409248940
66	NT_187076	GC	3	6	38167	38172	0 %	0 %	50 %	50 %	409248941
67	NT_187076	GC	3	6	38544	38549	0 %	0 %	50 %	50 %	409248941
68	NT_187076	GC	3	6	39579	39584	0 %	0 %	50 %	50 %	409248942
69	NT_187076	CG	3	6	39644	39649	0 %	0 %	50 %	50 %	409248942
70	NT_187076	CG	3	6	39937	39942	0 %	0 %	50 %	50 %	409248942
71	NT_187076	CG	3	6	40535	40540	0 %	0 %	50 %	50 %	409248943
72	NT_187076	GA	3	6	41921	41926	50 %	0 %	50 %	0 %	409248944
73	NT_187076	GC	4	8	41961	41968	0 %	0 %	50 %	50 %	409248944
74	NT_187076	CG	4	8	43266	43273	0 %	0 %	50 %	50 %	409248946
75	NT_187076	GC	4	8	44656	44663	0 %	0 %	50 %	50 %	409248946
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77	NT_187076	CG	3	6	46787	46792	0 %	0 %	50 %	50 %	409248949
78	NT_187076	GC	3	6	47173	47178	0 %	0 %	50 %	50 %	409248949
79	NT_187076	GC	3	6	48105	48110	0 %	0 %	50 %	50 %	409248950
80	NT_187076	GA	3	6	48252	48257	50 %	0 %	50 %	0 %	409248950
81	NT_187076	AT	3	6	48530	48535	50 %	50 %	0 %	0 %	409248951
82	NT_187076	TC	3	6	48548	48553	0 %	50 %	0 %	50 %	409248951
83	NT_187076	AG	3	6	49561	49566	50 %	0 %	50 %	0 %	409248952
84	NT_187076	GC	3	6	49763	49768	0 %	0 %	50 %	50 %	409248952
85	NT_187076	TG	3	6	50322	50327	0 %	50 %	50 %	0 %	409248953
86	NT_187076	GC	3	6	50495	50500	0 %	0 %	50 %	50 %	409248953
87	NT_187076	GC	3	6	50765	50770	0 %	0 %	50 %	50 %	409248953
88	NT_187076	GA	3	6	50981	50986	50 %	0 %	50 %	0 %	409248954
89	NT_187076	TC	3	6	53284	53289	0 %	50 %	0 %	50 %	409248955
90	NT_187076	GC	3	6	56658	56663	0 %	0 %	50 %	50 %	409248958
91	NT_187076	GC	3	6	56821	56826	0 %	0 %	50 %	50 %	409248958
92	NT_187076	TC	3	6	56864	56869	0 %	50 %	0 %	50 %	409248958
93	NT_187076	CG	3	6	56991	56996	0 %	0 %	50 %	50 %	409248958
94	NT_187076	CG	4	8	57157	57164	0 %	0 %	50 %	50 %	409248959
95	NT_187076	TG	3	6	57592	57597	0 %	50 %	50 %	0 %	409248959
96	NT_187076	CA	3	6	57812	57817	50 %	0 %	0 %	50 %	409248959
97	NT_187076	CG	3	6	58002	58007	0 %	0 %	50 %	50 %	409248959
98	NT_187076	GC	3	6	58436	58441	0 %	0 %	50 %	50 %	409248960
99	NT_187076	CG	3	6	59287	59292	0 %	0 %	50 %	50 %	409248961
100	NT_187076	CG	3	6	59386	59391	0 %	0 %	50 %	50 %	409248961
101	NT_187076	CG	4	8	59606	59613	0 %	0 %	50 %	50 %	409248961
102	NT_187076	GC	3	6	59828	59833	0 %	0 %	50 %	50 %	409248961
103	NT_187076	GC	3	6	59867	59872	0 %	0 %	50 %	50 %	409248961
104	NT_187076	CG	3	6	60289	60294	0 %	0 %	50 %	50 %	409248962
105	NT_187076	GA	4	8	60698	60705	50 %	0 %	50 %	0 %	409248962
106	NT_187076	TC	3	6	61428	61433	0 %	50 %	0 %	50 %	409248963
107	NT_187076	GC	3	6	62111	62116	0 %	0 %	50 %	50 %	409248964
108	NT_187076	AC	3	6	62771	62776	50 %	0 %	0 %	50 %	409248965
109	NT_187076	CG	3	6	63008	63013	0 %	0 %	50 %	50 %	409248965
110	NT_187076	TA	3	6	63137	63142	50 %	50 %	0 %	0 %	409248965
111	NT_187076	TG	3	6	63747	63752	0 %	50 %	50 %	0 %	409248965
112	NT_187076	GC	3	6	63965	63970	0 %	0 %	50 %	50 %	409248965
113	NT_187076	TA	3	6	66522	66527	50 %	50 %	0 %	0 %	409248968
114	NT_187076	CT	3	6	66582	66587	0 %	50 %	0 %	50 %	409248968
115	NT_187076	TA	3	6	67411	67416	50 %	50 %	0 %	0 %	409248968
116	NT_187076	AG	3	6	67559	67564	50 %	0 %	50 %	0 %	409248969
117	NT_187076	GC	3	6	67854	67859	0 %	0 %	50 %	50 %	409248969
118	NT_187076	TA	3	6	68360	68365	50 %	50 %	0 %	0 %	409248969
119	NT_187076	CG	4	8	69309	69316	0 %	0 %	50 %	50 %	409248970
120	NT_187076	GC	3	6	69594	69599	0 %	0 %	50 %	50 %	409248970
121	NT_187076	CG	5	10	69837	69846	0 %	0 %	50 %	50 %	409248970
122	NT_187076	CA	3	6	70634	70639	50 %	0 %	0 %	50 %	409248971
123	NT_187076	GC	3	6	70924	70929	0 %	0 %	50 %	50 %	409248971
124	NT_187076	GC	3	6	71467	71472	0 %	0 %	50 %	50 %	409248971
125	NT_187076	CG	3	6	71615	71620	0 %	0 %	50 %	50 %	409248971
126	NT_187076	AG	3	6	71853	71858	50 %	0 %	50 %	0 %	409248972
127	NT_187076	GC	3	6	71920	71925	0 %	0 %	50 %	50 %	409248972
128	NT_187076	TA	3	6	73438	73443	50 %	50 %	0 %	0 %	409248973
129	NT_187076	AG	3	6	73529	73534	50 %	0 %	50 %	0 %	409248973
130	NT_187076	CG	3	6	73982	73987	0 %	0 %	50 %	50 %	409248974
131	NT_187076	CA	3	6	74054	74059	50 %	0 %	0 %	50 %	409248974
132	NT_187076	GC	3	6	74158	74163	0 %	0 %	50 %	50 %	409248974
133	NT_187076	CG	3	6	74542	74547	0 %	0 %	50 %	50 %	409248974
134	NT_187076	GC	3	6	74789	74794	0 %	0 %	50 %	50 %	409248974
135	NT_187076	TG	3	6	74872	74877	0 %	50 %	50 %	0 %	409248974
136	NT_187076	AG	3	6	75030	75035	50 %	0 %	50 %	0 %	409248974
137	NT_187076	GC	3	6	75533	75538	0 %	0 %	50 %	50 %	409248975
138	NT_187076	TG	3	6	76659	76664	0 %	50 %	50 %	0 %	409248976
139	NT_187076	GC	3	6	77182	77187	0 %	0 %	50 %	50 %	409248976
140	NT_187076	GC	3	6	77677	77682	0 %	0 %	50 %	50 %	409248976
141	NT_187076	CT	4	8	77950	77957	0 %	50 %	0 %	50 %	409248976
142	NT_187076	GC	3	6	78370	78375	0 %	0 %	50 %	50 %	409248977
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.