MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187075	GGTGAC	2	12	6504	6515	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248822
2	NT_187075	GATCGC	2	12	7550	7561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248824
3	NT_187075	GCGTGG	2	12	12894	12905	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409248830
4	NT_187075	GGATGC	2	12	13993	14004	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248832
5	NT_187075	TGGCGC	2	12	14677	14688	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248833
6	NT_187075	CCAGCG	2	12	17110	17121	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248837
7	NT_187075	GGCATT	2	12	17920	17931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248838
8	NT_187075	CGCCAG	3	18	20262	20279	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248840
9	NT_187075	GCTGCG	2	12	22316	22327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248840
10	NT_187075	CCTGCG	2	12	27925	27936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248846
11	NT_187075	GGTATG	2	12	29527	29538	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409248847
12	NT_187075	CGTTGC	2	12	31661	31672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248848
13	NT_187075	GAGTCA	2	12	33321	33332	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248851
14	NT_187075	TGGATA	2	12	36512	36523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248855
15	NT_187075	GGCGCT	2	12	38839	38850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248856
16	NT_187075	ACCCGG	2	12	39221	39232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248857
17	NT_187075	AGCGCC	2	12	47841	47852	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248869
18	NT_187075	TGGAGG	2	12	49890	49901	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	409248870
19	NT_187075	CGATCG	2	12	50779	50790	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248871
20	NT_187075	ATCGTC	2	12	50913	50924	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248871
21	NT_187075	TGGAAG	2	12	52098	52109	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409248873
22	NT_187075	CGCAAT	2	12	53221	53232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248874
23	NT_187075	CGCTGG	2	12	54796	54807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248875
24	NT_187075	GAAACC	2	12	55095	55106	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409248875
25	NT_187075	GTTTTG	2	12	55699	55710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248875
26	NT_187075	TTGAGC	2	12	60627	60638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248881
27	NT_187075	ATCGTG	2	12	64462	64473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248883
28	NT_187075	ATGGCG	2	12	65202	65213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248884
29	NT_187075	CAAATC	2	12	66124	66135	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	409248886
30	NT_187075	CCAGAA	2	12	67303	67314	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409248887
31	NT_187075	CAGAAT	2	12	67807	67818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409248887
32	NT_187075	AAATTT	2	12	69935	69946	50 %	50 %	0 %	0 %	409248889
33	NT_187075	TGGCGG	2	12	75849	75860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409248895
34	NT_187075	AGCGGA	2	12	77853	77864	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409248896
35	NT_187075	AAAATC	2	12	82006	82017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409248898

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.