MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187075	TGAT	2	8	232	239	25 %	50 %	25 %	0 %	409248817
2	NT_187075	CTGG	2	8	409	416	0 %	25 %	50 %	25 %	409248817
3	NT_187075	TACT	2	8	419	426	25 %	50 %	0 %	25 %	409248817
4	NT_187075	TAAC	2	8	454	461	50 %	25 %	0 %	25 %	409248817
5	NT_187075	AAGC	2	8	1971	1978	50 %	0 %	25 %	25 %	409248818
6	NT_187075	AATT	2	8	2213	2220	50 %	50 %	0 %	0 %	409248818
7	NT_187075	CGTC	2	8	2824	2831	0 %	25 %	25 %	50 %	409248819
8	NT_187075	CAGC	2	8	3044	3051	25 %	0 %	25 %	50 %	409248819
9	NT_187075	GCGG	2	8	3143	3150	0 %	0 %	75 %	25 %	409248819
10	NT_187075	AAGT	2	8	3734	3741	50 %	25 %	25 %	0 %	409248819
11	NT_187075	GTTT	2	8	4179	4186	0 %	75 %	25 %	0 %	409248820
12	NT_187075	AATG	2	8	4638	4645	50 %	25 %	25 %	0 %	409248820
13	NT_187075	CCGT	2	8	5021	5028	0 %	25 %	25 %	50 %	409248820
14	NT_187075	GTTC	2	8	5222	5229	0 %	50 %	25 %	25 %	409248820
15	NT_187075	TGGC	2	8	5419	5426	0 %	25 %	50 %	25 %	409248821
16	NT_187075	GCTG	2	8	5603	5610	0 %	25 %	50 %	25 %	409248821
17	NT_187075	TGAG	2	8	6229	6236	25 %	25 %	50 %	0 %	409248821
18	NT_187075	CTGG	2	8	7230	7237	0 %	25 %	50 %	25 %	409248823
19	NT_187075	ATAC	2	8	7427	7434	50 %	25 %	0 %	25 %	409248824
20	NT_187075	CCGA	2	8	7830	7837	25 %	0 %	25 %	50 %	409248824
21	NT_187075	TTCG	2	8	7917	7924	0 %	50 %	25 %	25 %	409248824
22	NT_187075	TATC	2	8	8278	8285	25 %	50 %	0 %	25 %	409248824
23	NT_187075	ATCG	2	8	8315	8322	25 %	25 %	25 %	25 %	409248824
24	NT_187075	TGCC	2	8	8934	8941	0 %	25 %	25 %	50 %	409248825
25	NT_187075	GCGG	2	8	9858	9865	0 %	0 %	75 %	25 %	409248826
26	NT_187075	TTAA	2	8	9919	9926	50 %	50 %	0 %	0 %	409248826
27	NT_187075	GCGT	2	8	9932	9939	0 %	25 %	50 %	25 %	409248826
28	NT_187075	GTTT	2	8	10016	10023	0 %	75 %	25 %	0 %	409248826
29	NT_187075	ACCT	2	8	11644	11651	25 %	25 %	0 %	50 %	409248829
30	NT_187075	GCCT	2	8	11788	11795	0 %	25 %	25 %	50 %	409248829
31	NT_187075	AATG	2	8	11917	11924	50 %	25 %	25 %	0 %	409248830
32	NT_187075	TGCC	2	8	12261	12268	0 %	25 %	25 %	50 %	409248830
33	NT_187075	GGCG	2	8	12311	12318	0 %	0 %	75 %	25 %	409248830
34	NT_187075	GGAT	2	8	13340	13347	25 %	25 %	50 %	0 %	409248831
35	NT_187075	CGTC	2	8	14161	14168	0 %	25 %	25 %	50 %	409248832
36	NT_187075	ACCG	2	8	14715	14722	25 %	0 %	25 %	50 %	409248833
37	NT_187075	GATG	2	8	15340	15347	25 %	25 %	50 %	0 %	409248834
38	NT_187075	CCGG	2	8	16445	16452	0 %	0 %	50 %	50 %	409248836
39	NT_187075	CTGA	2	8	17240	17247	25 %	25 %	25 %	25 %	409248837
40	NT_187075	TGGA	2	8	18223	18230	25 %	25 %	50 %	0 %	409248838
41	NT_187075	GTTT	2	8	18549	18556	0 %	75 %	25 %	0 %	409248838
42	NT_187075	GTCA	2	8	19025	19032	25 %	25 %	25 %	25 %	409248839
43	NT_187075	AATA	2	8	20389	20396	75 %	25 %	0 %	0 %	409248840
44	NT_187075	GCCA	2	8	20428	20435	25 %	0 %	25 %	50 %	409248840
45	NT_187075	CAGC	2	8	20732	20739	25 %	0 %	25 %	50 %	409248840
46	NT_187075	CAGC	2	8	21348	21355	25 %	0 %	25 %	50 %	409248840
47	NT_187075	GCCA	2	8	22096	22103	25 %	0 %	25 %	50 %	409248840
48	NT_187075	CAAG	2	8	23012	23019	50 %	0 %	25 %	25 %	409248840
49	NT_187075	AGCG	2	8	23307	23314	25 %	0 %	50 %	25 %	409248841
50	NT_187075	CCAG	2	8	23431	23438	25 %	0 %	25 %	50 %	409248841
51	NT_187075	CCGA	2	8	25035	25042	25 %	0 %	25 %	50 %	409248843
52	NT_187075	CAGC	2	8	26207	26214	25 %	0 %	25 %	50 %	409248844
53	NT_187075	GGCC	2	8	27719	27726	0 %	0 %	50 %	50 %	409248846
54	NT_187075	TCAG	2	8	27803	27810	25 %	25 %	25 %	25 %	409248846
55	NT_187075	CTAT	2	8	28066	28073	25 %	50 %	0 %	25 %	409248846
56	NT_187075	TGGC	2	8	29011	29018	0 %	25 %	50 %	25 %	409248847
57	NT_187075	TCTA	2	8	29189	29196	25 %	50 %	0 %	25 %	409248847
58	NT_187075	GCGA	2	8	30147	30154	25 %	0 %	50 %	25 %	409248848
59	NT_187075	GCGG	2	8	30460	30467	0 %	0 %	75 %	25 %	409248848
60	NT_187075	CTGG	2	8	30828	30835	0 %	25 %	50 %	25 %	409248848
61	NT_187075	ATCA	2	8	30863	30870	50 %	25 %	0 %	25 %	409248848
62	NT_187075	TCGT	2	8	30911	30918	0 %	50 %	25 %	25 %	409248848
63	NT_187075	GGCG	2	8	30984	30991	0 %	0 %	75 %	25 %	409248848
64	NT_187075	TGGA	2	8	31225	31232	25 %	25 %	50 %	0 %	409248848
65	NT_187075	TATT	2	8	31389	31396	25 %	75 %	0 %	0 %	409248848
66	NT_187075	GCAG	2	8	31466	31473	25 %	0 %	50 %	25 %	409248848
67	NT_187075	GAAA	2	8	32220	32227	75 %	0 %	25 %	0 %	409248849
68	NT_187075	CAAA	2	8	32299	32306	75 %	0 %	0 %	25 %	409248849
69	NT_187075	GCGG	2	8	32669	32676	0 %	0 %	75 %	25 %	409248850
70	NT_187075	TGAA	2	8	32811	32818	50 %	25 %	25 %	0 %	409248850
71	NT_187075	CGCT	2	8	34106	34113	0 %	25 %	25 %	50 %	409248851
72	NT_187075	TTTA	2	8	34178	34185	25 %	75 %	0 %	0 %	409248851
73	NT_187075	TGAT	2	8	34206	34213	25 %	50 %	25 %	0 %	409248851
74	NT_187075	GGTC	2	8	35946	35953	0 %	25 %	50 %	25 %	409248854
75	NT_187075	CCAG	2	8	36710	36717	25 %	0 %	25 %	50 %	409248855
76	NT_187075	CCAG	2	8	37094	37101	25 %	0 %	25 %	50 %	409248855
77	NT_187075	AACC	2	8	37111	37118	50 %	0 %	0 %	50 %	409248855
78	NT_187075	AAGA	2	8	37231	37238	75 %	0 %	25 %	0 %	409248855
79	NT_187075	CGAA	2	8	37343	37350	50 %	0 %	25 %	25 %	409248855
80	NT_187075	TGCG	2	8	37373	37380	0 %	25 %	50 %	25 %	409248855
81	NT_187075	AACG	2	8	37675	37682	50 %	0 %	25 %	25 %	409248855
82	NT_187075	ATGG	2	8	39183	39190	25 %	25 %	50 %	0 %	409248857
83	NT_187075	TTAT	2	8	39283	39290	25 %	75 %	0 %	0 %	409248857
84	NT_187075	GTTT	2	8	39491	39498	0 %	75 %	25 %	0 %	409248858
85	NT_187075	TGCG	2	8	42716	42723	0 %	25 %	50 %	25 %	409248862
86	NT_187075	CATA	2	8	42758	42765	50 %	25 %	0 %	25 %	409248862
87	NT_187075	TCGC	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	409248863
88	NT_187075	GGCG	2	8	43790	43797	0 %	0 %	75 %	25 %	409248864
89	NT_187075	CGGC	2	8	43885	43892	0 %	0 %	50 %	50 %	409248864
90	NT_187075	TGGA	2	8	44086	44093	25 %	25 %	50 %	0 %	409248864
91	NT_187075	TGCG	2	8	44164	44171	0 %	25 %	50 %	25 %	409248864
92	NT_187075	AGGC	2	8	44480	44487	25 %	0 %	50 %	25 %	409248864
93	NT_187075	CGAT	2	8	46426	46433	25 %	25 %	25 %	25 %	409248867
94	NT_187075	GTGG	2	8	47088	47095	0 %	25 %	75 %	0 %	409248868
95	NT_187075	GCCA	2	8	47582	47589	25 %	0 %	25 %	50 %	409248869
96	NT_187075	GCCA	2	8	48410	48417	25 %	0 %	25 %	50 %	409248870
97	NT_187075	CGAT	2	8	49010	49017	25 %	25 %	25 %	25 %	409248870
98	NT_187075	AGTA	2	8	50150	50157	50 %	25 %	25 %	0 %	409248870
99	NT_187075	TTTA	2	8	50291	50298	25 %	75 %	0 %	0 %	409248871
100	NT_187075	GGTA	2	8	50441	50448	25 %	25 %	50 %	0 %	409248871
101	NT_187075	TGCC	2	8	51282	51289	0 %	25 %	25 %	50 %	409248872
102	NT_187075	ATTC	2	8	51320	51327	25 %	50 %	0 %	25 %	409248872
103	NT_187075	GCTC	2	8	51383	51390	0 %	25 %	25 %	50 %	409248872
104	NT_187075	GGCG	2	8	51408	51415	0 %	0 %	75 %	25 %	409248872
105	NT_187075	TGCG	2	8	51965	51972	0 %	25 %	50 %	25 %	409248873
106	NT_187075	CCAG	2	8	52524	52531	25 %	0 %	25 %	50 %	409248873
107	NT_187075	GCTG	2	8	53169	53176	0 %	25 %	50 %	25 %	409248874
108	NT_187075	GGCA	2	8	53259	53266	25 %	0 %	50 %	25 %	409248874
109	NT_187075	CTGG	2	8	53755	53762	0 %	25 %	50 %	25 %	409248874
110	NT_187075	ACGG	2	8	54420	54427	25 %	0 %	50 %	25 %	409248875
111	NT_187075	ACTG	2	8	54443	54450	25 %	25 %	25 %	25 %	409248875
112	NT_187075	CAGA	2	8	55301	55308	50 %	0 %	25 %	25 %	409248875
113	NT_187075	GGCG	2	8	55598	55605	0 %	0 %	75 %	25 %	409248875
114	NT_187075	ATGA	2	8	56028	56035	50 %	25 %	25 %	0 %	409248875
115	NT_187075	GCGG	2	8	56557	56564	0 %	0 %	75 %	25 %	409248876
116	NT_187075	CGCT	2	8	57099	57106	0 %	25 %	25 %	50 %	409248877
117	NT_187075	GGCT	2	8	57192	57199	0 %	25 %	50 %	25 %	409248877
118	NT_187075	GGCT	2	8	57253	57260	0 %	25 %	50 %	25 %	409248877
119	NT_187075	CTGG	2	8	57910	57917	0 %	25 %	50 %	25 %	409248878
120	NT_187075	ACTC	2	8	58378	58385	25 %	25 %	0 %	50 %	409248879
121	NT_187075	ATGA	2	8	58961	58968	50 %	25 %	25 %	0 %	409248879
122	NT_187075	AGCC	2	8	59163	59170	25 %	0 %	25 %	50 %	409248879
123	NT_187075	GCCA	2	8	60132	60139	25 %	0 %	25 %	50 %	409248881
124	NT_187075	ACTG	2	8	60238	60245	25 %	25 %	25 %	25 %	409248881
125	NT_187075	TGGT	2	8	60705	60712	0 %	50 %	50 %	0 %	409248881
126	NT_187075	TGAG	2	8	60980	60987	25 %	25 %	50 %	0 %	409248881
127	NT_187075	ATTG	2	8	62178	62185	25 %	50 %	25 %	0 %	409248882
128	NT_187075	TATT	2	8	62547	62554	25 %	75 %	0 %	0 %	409248882
129	NT_187075	GATA	2	8	63141	63148	50 %	25 %	25 %	0 %	409248882
130	NT_187075	CTTT	2	8	63378	63385	0 %	75 %	0 %	25 %	409248883
131	NT_187075	CAGG	2	8	63399	63406	25 %	0 %	50 %	25 %	409248883
132	NT_187075	TTTA	2	8	63519	63526	25 %	75 %	0 %	0 %	409248883
133	NT_187075	AAGC	2	8	63765	63772	50 %	0 %	25 %	25 %	409248883
134	NT_187075	CGTT	2	8	63996	64003	0 %	50 %	25 %	25 %	409248883
135	NT_187075	ATGC	2	8	64501	64508	25 %	25 %	25 %	25 %	409248883
136	NT_187075	CAGC	2	8	65411	65418	25 %	0 %	25 %	50 %	409248884
137	NT_187075	CGTG	2	8	66263	66270	0 %	25 %	50 %	25 %	409248886
138	NT_187075	GCCA	2	8	66394	66401	25 %	0 %	25 %	50 %	409248886
139	NT_187075	GAAC	2	8	66494	66501	50 %	0 %	25 %	25 %	409248886
140	NT_187075	GCCA	2	8	66842	66849	25 %	0 %	25 %	50 %	409248887
141	NT_187075	TTTC	2	8	66975	66982	0 %	75 %	0 %	25 %	409248887
142	NT_187075	GCTG	2	8	67227	67234	0 %	25 %	50 %	25 %	409248887
143	NT_187075	GTAC	2	8	67263	67270	25 %	25 %	25 %	25 %	409248887
144	NT_187075	AGCC	2	8	68167	68174	25 %	0 %	25 %	50 %	409248887
145	NT_187075	TAGG	2	8	68551	68558	25 %	25 %	50 %	0 %	409248887
146	NT_187075	AAGT	2	8	68570	68577	50 %	25 %	25 %	0 %	409248887
147	NT_187075	TCAT	2	8	68910	68917	25 %	50 %	0 %	25 %	409248888
148	NT_187075	GCTT	2	8	69295	69302	0 %	50 %	25 %	25 %	409248888
149	NT_187075	GCGT	2	8	69312	69319	0 %	25 %	50 %	25 %	409248888
150	NT_187075	TGCG	2	8	70319	70326	0 %	25 %	50 %	25 %	409248890
151	NT_187075	CGCT	2	8	70337	70344	0 %	25 %	25 %	50 %	409248890
152	NT_187075	TCGG	2	8	70982	70989	0 %	25 %	50 %	25 %	409248890
153	NT_187075	GCCA	2	8	71078	71085	25 %	0 %	25 %	50 %	409248890
154	NT_187075	AACC	2	8	71327	71334	50 %	0 %	0 %	50 %	409248890
155	NT_187075	ACCA	2	8	71410	71417	50 %	0 %	0 %	50 %	409248890
156	NT_187075	GAAA	2	8	73619	73626	75 %	0 %	25 %	0 %	409248893
157	NT_187075	CTTC	2	8	74431	74438	0 %	50 %	0 %	50 %	409248893
158	NT_187075	ATCT	2	8	74928	74935	25 %	50 %	0 %	25 %	409248894
159	NT_187075	ATGA	2	8	75198	75205	50 %	25 %	25 %	0 %	409248894
160	NT_187075	GACC	2	8	75942	75949	25 %	0 %	25 %	50 %	409248895
161	NT_187075	GAAC	2	8	76528	76535	50 %	0 %	25 %	25 %	409248895
162	NT_187075	GAAG	2	8	77208	77215	50 %	0 %	50 %	0 %	409248896
163	NT_187075	GCCA	2	8	77400	77407	25 %	0 %	25 %	50 %	409248896
164	NT_187075	AACG	2	8	77611	77618	50 %	0 %	25 %	25 %	409248896
165	NT_187075	TAAA	2	8	78074	78081	75 %	25 %	0 %	0 %	409248896
166	NT_187075	GGTA	2	8	78120	78127	25 %	25 %	50 %	0 %	409248896
167	NT_187075	GCGT	2	8	78662	78669	0 %	25 %	50 %	25 %	409248896
168	NT_187075	GCTC	2	8	78926	78933	0 %	25 %	25 %	50 %	409248896
169	NT_187075	CCTG	2	8	79112	79119	0 %	25 %	25 %	50 %	409248896
170	NT_187075	GAAA	2	8	79200	79207	75 %	0 %	25 %	0 %	409248896
171	NT_187075	GCTG	2	8	81116	81123	0 %	25 %	50 %	25 %	409248898
172	NT_187075	GCAA	2	8	81352	81359	50 %	0 %	25 %	25 %	409248898
173	NT_187075	CTTT	2	8	82224	82231	0 %	75 %	0 %	25 %	409248899
174	NT_187075	CCAG	2	8	82886	82893	25 %	0 %	25 %	50 %	409248900
175	NT_187075	GTTT	2	8	82983	82990	0 %	75 %	25 %	0 %	409248900
176	NT_187075	GTTC	2	8	83664	83671	0 %	50 %	25 %	25 %	409248901
177	NT_187075	CATC	2	8	84064	84071	25 %	25 %	0 %	50 %	409248902
178	NT_187075	GCCA	2	8	84897	84904	25 %	0 %	25 %	50 %	409248902
179	NT_187075	CCTG	2	8	85482	85489	0 %	25 %	25 %	50 %	409248902
180	NT_187075	ATGG	2	8	85758	85765	25 %	25 %	50 %	0 %	409248903
181	NT_187075	CGGG	2	8	86402	86409	0 %	0 %	75 %	25 %	409248903

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.