MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187075	ATG	2	6	85	90	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248817
2	NT_187075	TTG	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248817
3	NT_187075	GCG	2	6	172	177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248817
4	NT_187075	TAC	2	6	215	220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248817
5	NT_187075	TAA	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248817
6	NT_187075	TTC	2	6	320	325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248817
7	NT_187075	GGT	2	6	342	347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248817
8	NT_187075	GGT	2	6	462	467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248817
9	NT_187075	CTG	2	6	544	549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248817
10	NT_187075	TGT	2	6	563	568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248817
11	NT_187075	AGC	2	6	591	596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248817
12	NT_187075	CAA	2	6	722	727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248817
13	NT_187075	CGA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248817
14	NT_187075	TGT	2	6	761	766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248817
15	NT_187075	GCA	2	6	888	893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248817
16	NT_187075	CGG	2	6	1088	1093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248817
17	NT_187075	CGG	2	6	1112	1117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248817
18	NT_187075	CAT	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248817
19	NT_187075	AAC	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248817
20	NT_187075	GCA	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248817
21	NT_187075	ACA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248817
22	NT_187075	TTG	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248817
23	NT_187075	CAA	2	6	1367	1372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248817
24	NT_187075	CGA	2	6	1529	1534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248817
25	NT_187075	ACG	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248817
26	NT_187075	CAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248817
27	NT_187075	GAA	2	6	1778	1783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248817
28	NT_187075	CGG	3	9	1814	1822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248817
29	NT_187075	TGA	2	6	2070	2075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248818
30	NT_187075	GTT	2	6	2110	2115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248818
31	NT_187075	TCA	3	9	2251	2259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248818
32	NT_187075	CAT	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248818
33	NT_187075	AGC	2	6	2351	2356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248818
34	NT_187075	TAA	2	6	2364	2369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248818
35	NT_187075	GAA	2	6	2419	2424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248818
36	NT_187075	TCA	2	6	2457	2462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248818
37	NT_187075	GGT	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248818
38	NT_187075	ATC	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248819
39	NT_187075	TAA	2	6	2780	2785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248819
40	NT_187075	CCG	3	9	2788	2796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248819
41	NT_187075	CCT	2	6	2797	2802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248819
42	NT_187075	GAC	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248819
43	NT_187075	CAT	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248819
44	NT_187075	CGC	2	6	3029	3034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248819
45	NT_187075	TAT	2	6	3053	3058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248819
46	NT_187075	CCA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248819
47	NT_187075	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248819
48	NT_187075	TTC	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248819
49	NT_187075	GCC	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248819
50	NT_187075	GTT	2	6	3296	3301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248819
51	NT_187075	ATT	2	6	3564	3569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248819
52	NT_187075	CAC	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248819
53	NT_187075	GCC	2	6	3721	3726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248819
54	NT_187075	ATG	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248820
55	NT_187075	GAG	3	9	4220	4228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248820
56	NT_187075	TTA	2	6	4317	4322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248820
57	NT_187075	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248820
58	NT_187075	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248820
59	NT_187075	TGG	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248820
60	NT_187075	CGC	2	6	4505	4510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248820
61	NT_187075	GTG	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248820
62	NT_187075	AAC	2	6	4594	4599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248820
63	NT_187075	GCC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248820
64	NT_187075	CTG	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248820
65	NT_187075	GTC	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248820
66	NT_187075	CGC	2	6	5012	5017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248820
67	NT_187075	ACT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248820
68	NT_187075	CTG	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248820
69	NT_187075	TTG	2	6	5156	5161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248820
70	NT_187075	TGA	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248820
71	NT_187075	GAC	2	6	5250	5255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248820
72	NT_187075	TGG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248820
73	NT_187075	CGG	2	6	5371	5376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248821
74	NT_187075	GTA	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248821
75	NT_187075	GTA	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248821
76	NT_187075	CAG	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248821
77	NT_187075	CGC	2	6	5688	5693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248821
78	NT_187075	GGC	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248821
79	NT_187075	AGG	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248821
80	NT_187075	GAC	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248821
81	NT_187075	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248821
82	NT_187075	GCG	2	6	6434	6439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248821
83	NT_187075	CAG	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248822
84	NT_187075	AGG	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248822
85	NT_187075	TCG	2	6	7095	7100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248823
86	NT_187075	ACT	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248823
87	NT_187075	ATT	2	6	7219	7224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248823
88	NT_187075	ATT	2	6	7246	7251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248823
89	NT_187075	AAG	2	6	7497	7502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248824
90	NT_187075	ATC	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248824
91	NT_187075	CGC	2	6	7675	7680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248824
92	NT_187075	CCA	3	9	7750	7758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248824
93	NT_187075	CTG	2	6	7793	7798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248824
94	NT_187075	TAA	2	6	7933	7938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248824
95	NT_187075	GCA	2	6	8050	8055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248824
96	NT_187075	AAT	2	6	8239	8244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248824
97	NT_187075	CAC	2	6	8294	8299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248824
98	NT_187075	CCG	2	6	8365	8370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248824
99	NT_187075	ATT	2	6	8539	8544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248825
100	NT_187075	GGC	2	6	8554	8559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248825
101	NT_187075	TTA	2	6	8592	8597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248825
102	NT_187075	CGG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248825
103	NT_187075	TCA	2	6	8722	8727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248825
104	NT_187075	TGT	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248825
105	NT_187075	AGC	2	6	8806	8811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248825
106	NT_187075	CCT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248825
107	NT_187075	CAG	2	6	8863	8868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248825
108	NT_187075	GCC	2	6	8900	8905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248825
109	NT_187075	ATT	2	6	9110	9115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248825
110	NT_187075	GCT	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248825
111	NT_187075	CTG	2	6	9679	9684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248826
112	NT_187075	GCG	2	6	9803	9808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248826
113	NT_187075	CGG	2	6	9813	9818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248826
114	NT_187075	GGC	2	6	9829	9834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248826
115	NT_187075	TGG	2	6	9890	9895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248826
116	NT_187075	TCA	2	6	9944	9949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248826
117	NT_187075	TAA	2	6	10107	10112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248826
118	NT_187075	TGC	2	6	10244	10249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248826
119	NT_187075	TTC	2	6	10252	10257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248826
120	NT_187075	CAC	2	6	10272	10277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248826
121	NT_187075	TTG	2	6	10306	10311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248826
122	NT_187075	CCG	2	6	10337	10342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248826
123	NT_187075	CGG	2	6	10496	10501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248826
124	NT_187075	CGT	2	6	10543	10548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248826
125	NT_187075	GTT	2	6	10898	10903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248827
126	NT_187075	AGA	3	9	10922	10930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248827
127	NT_187075	TGC	2	6	11092	11097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248827
128	NT_187075	GTT	2	6	11159	11164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248828
129	NT_187075	TCT	2	6	11210	11215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248828
130	NT_187075	TAA	2	6	11254	11259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248828
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255	NT_187075	CTT	2	6	20486	20491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248840
256	NT_187075	GTT	2	6	20645	20650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248840
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258	NT_187075	CCG	2	6	20684	20689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248840
259	NT_187075	CGG	2	6	20708	20713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248840
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279	NT_187075	GGC	2	6	21597	21602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248840
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283	NT_187075	GCG	2	6	21950	21955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248840
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287	NT_187075	CGT	2	6	22085	22090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248840
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