MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187075	GT	3	6	466	471	0 %	50 %	50 %	0 %	409248817
2	NT_187075	GT	3	6	574	579	0 %	50 %	50 %	0 %	409248817
3	NT_187075	TC	3	6	1881	1886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187075	CG	3	6	2468	2473	0 %	0 %	50 %	50 %	409248818
5	NT_187075	TG	3	6	2911	2916	0 %	50 %	50 %	0 %	409248819
6	NT_187075	GC	3	6	3362	3367	0 %	0 %	50 %	50 %	409248819
7	NT_187075	GC	3	6	3425	3430	0 %	0 %	50 %	50 %	409248819
8	NT_187075	CG	3	6	5094	5099	0 %	0 %	50 %	50 %	409248820
9	NT_187075	AG	3	6	5523	5528	50 %	0 %	50 %	0 %	409248821
10	NT_187075	GC	3	6	6040	6045	0 %	0 %	50 %	50 %	409248821
11	NT_187075	GC	3	6	6487	6492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187075	GA	3	6	6788	6793	50 %	0 %	50 %	0 %	409248822
13	NT_187075	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	409248825
14	NT_187075	TA	3	6	9227	9232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187075	GC	3	6	9609	9614	0 %	0 %	50 %	50 %	409248826
16	NT_187075	CG	3	6	9752	9757	0 %	0 %	50 %	50 %	409248826
17	NT_187075	AT	3	6	10633	10638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187075	TA	3	6	11421	11426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187075	CG	4	8	12030	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	409248830
20	NT_187075	CT	3	6	12425	12430	0 %	50 %	0 %	50 %	409248830
21	NT_187075	GC	3	6	12867	12872	0 %	0 %	50 %	50 %	409248830
22	NT_187075	GC	5	10	13515	13524	0 %	0 %	50 %	50 %	409248831
23	NT_187075	GC	3	6	13668	13673	0 %	0 %	50 %	50 %	409248831
24	NT_187075	TG	3	6	13858	13863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187075	TC	3	6	14359	14364	0 %	50 %	0 %	50 %	409248832
26	NT_187075	CG	3	6	14367	14372	0 %	0 %	50 %	50 %	409248832
27	NT_187075	GC	3	6	14824	14829	0 %	0 %	50 %	50 %	409248833
28	NT_187075	GC	3	6	14920	14925	0 %	0 %	50 %	50 %	409248833
29	NT_187075	CT	3	6	16263	16268	0 %	50 %	0 %	50 %	409248835
30	NT_187075	CG	3	6	16988	16993	0 %	0 %	50 %	50 %	409248837
31	NT_187075	CG	4	8	17258	17265	0 %	0 %	50 %	50 %	409248837
32	NT_187075	GC	4	8	17408	17415	0 %	0 %	50 %	50 %	409248837
33	NT_187075	TC	4	8	17938	17945	0 %	50 %	0 %	50 %	409248838
34	NT_187075	AG	3	6	18920	18925	50 %	0 %	50 %	0 %	409248839
35	NT_187075	GA	4	8	19004	19011	50 %	0 %	50 %	0 %	409248839
36	NT_187075	GC	3	6	19675	19680	0 %	0 %	50 %	50 %	409248839
37	NT_187075	GC	3	6	19870	19875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NT_187075	GC	3	6	20564	20569	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
39	NT_187075	GC	3	6	20753	20758	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
40	NT_187075	GC	3	6	21142	21147	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
41	NT_187075	GC	3	6	21252	21257	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
42	NT_187075	GC	3	6	21687	21692	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
43	NT_187075	CG	3	6	21802	21807	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
44	NT_187075	GC	3	6	22151	22156	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
45	NT_187075	GC	3	6	22645	22650	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
46	NT_187075	CG	3	6	22872	22877	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
47	NT_187075	CG	3	6	22931	22936	0 %	0 %	50 %	50 %	409248840
48	NT_187075	GC	3	6	23674	23679	0 %	0 %	50 %	50 %	409248841
49	NT_187075	CG	3	6	23947	23952	0 %	0 %	50 %	50 %	409248841
50	NT_187075	CG	3	6	24070	24075	0 %	0 %	50 %	50 %	409248841
51	NT_187075	CG	3	6	25897	25902	0 %	0 %	50 %	50 %	409248844
52	NT_187075	GA	3	6	26041	26046	50 %	0 %	50 %	0 %	409248844
53	NT_187075	CG	3	6	27049	27054	0 %	0 %	50 %	50 %	409248846
54	NT_187075	GC	3	6	27690	27695	0 %	0 %	50 %	50 %	409248846
55	NT_187075	CG	3	6	28311	28316	0 %	0 %	50 %	50 %	409248846
56	NT_187075	AT	3	6	28588	28593	50 %	50 %	0 %	0 %	409248847
57	NT_187075	GC	3	6	28600	28605	0 %	0 %	50 %	50 %	409248847
58	NT_187075	TG	3	6	28936	28941	0 %	50 %	50 %	0 %	409248847
59	NT_187075	CG	3	6	29121	29126	0 %	0 %	50 %	50 %	409248847
60	NT_187075	GC	3	6	29373	29378	0 %	0 %	50 %	50 %	409248847
61	NT_187075	GC	3	6	30994	30999	0 %	0 %	50 %	50 %	409248848
62	NT_187075	GC	3	6	31303	31308	0 %	0 %	50 %	50 %	409248848
63	NT_187075	GC	3	6	31336	31341	0 %	0 %	50 %	50 %	409248848
64	NT_187075	GA	3	6	32959	32964	50 %	0 %	50 %	0 %	409248850
65	NT_187075	GC	3	6	33438	33443	0 %	0 %	50 %	50 %	409248851
66	NT_187075	GC	3	6	34064	34069	0 %	0 %	50 %	50 %	409248851
67	NT_187075	AC	3	6	34285	34290	50 %	0 %	0 %	50 %	409248851
68	NT_187075	CG	4	8	34623	34630	0 %	0 %	50 %	50 %	409248853
69	NT_187075	GC	3	6	34741	34746	0 %	0 %	50 %	50 %	409248853
70	NT_187075	AG	3	6	35654	35659	50 %	0 %	50 %	0 %	409248853
71	NT_187075	GC	3	6	36328	36333	0 %	0 %	50 %	50 %	409248855
72	NT_187075	CG	3	6	36733	36738	0 %	0 %	50 %	50 %	409248855
73	NT_187075	GC	3	6	36751	36756	0 %	0 %	50 %	50 %	409248855
74	NT_187075	CG	3	6	36904	36909	0 %	0 %	50 %	50 %	409248855
75	NT_187075	GT	3	6	39347	39352	0 %	50 %	50 %	0 %	409248857
76	NT_187075	AG	3	6	39461	39466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187075	CG	3	6	39758	39763	0 %	0 %	50 %	50 %	409248858
78	NT_187075	AG	3	6	39807	39812	50 %	0 %	50 %	0 %	409248858
79	NT_187075	TC	3	6	39954	39959	0 %	50 %	0 %	50 %	409248858
80	NT_187075	GA	3	6	40027	40032	50 %	0 %	50 %	0 %	409248858
81	NT_187075	AT	3	6	40245	40250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187075	CG	3	6	40357	40362	0 %	0 %	50 %	50 %	409248859
83	NT_187075	CG	3	6	42427	42432	0 %	0 %	50 %	50 %	409248861
84	NT_187075	GC	3	6	42949	42954	0 %	0 %	50 %	50 %	409248862
85	NT_187075	GT	3	6	43260	43265	0 %	50 %	50 %	0 %	409248863
86	NT_187075	CG	3	6	43309	43314	0 %	0 %	50 %	50 %	409248863
87	NT_187075	CG	4	8	43895	43902	0 %	0 %	50 %	50 %	409248864
88	NT_187075	CG	3	6	44397	44402	0 %	0 %	50 %	50 %	409248864
89	NT_187075	AG	3	6	44800	44805	50 %	0 %	50 %	0 %	409248865
90	NT_187075	GC	3	6	45889	45894	0 %	0 %	50 %	50 %	409248867
91	NT_187075	CG	3	6	46168	46173	0 %	0 %	50 %	50 %	409248867
92	NT_187075	CG	3	6	46490	46495	0 %	0 %	50 %	50 %	409248867
93	NT_187075	GC	3	6	46630	46635	0 %	0 %	50 %	50 %	409248867
94	NT_187075	CG	3	6	47701	47706	0 %	0 %	50 %	50 %	409248869
95	NT_187075	GC	3	6	48040	48045	0 %	0 %	50 %	50 %	409248869
96	NT_187075	GC	3	6	48210	48215	0 %	0 %	50 %	50 %	409248869
97	NT_187075	CT	3	6	48234	48239	0 %	50 %	0 %	50 %	409248869
98	NT_187075	CG	3	6	48463	48468	0 %	0 %	50 %	50 %	409248870
99	NT_187075	GA	3	6	48956	48961	50 %	0 %	50 %	0 %	409248870
100	NT_187075	CA	3	6	49278	49283	50 %	0 %	0 %	50 %	409248870
101	NT_187075	GC	3	6	49695	49700	0 %	0 %	50 %	50 %	409248870
102	NT_187075	CA	3	6	49822	49827	50 %	0 %	0 %	50 %	409248870
103	NT_187075	CT	3	6	50189	50194	0 %	50 %	0 %	50 %	409248870
104	NT_187075	CT	3	6	50551	50556	0 %	50 %	0 %	50 %	409248871
105	NT_187075	GC	3	6	50639	50644	0 %	0 %	50 %	50 %	409248871
106	NT_187075	CT	3	6	51448	51453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NT_187075	GC	3	6	52058	52063	0 %	0 %	50 %	50 %	409248873
108	NT_187075	CG	3	6	52451	52456	0 %	0 %	50 %	50 %	409248873
109	NT_187075	GC	3	6	52625	52630	0 %	0 %	50 %	50 %	409248873
110	NT_187075	GC	3	6	53274	53279	0 %	0 %	50 %	50 %	409248874
111	NT_187075	GC	4	8	54857	54864	0 %	0 %	50 %	50 %	409248875
112	NT_187075	GC	3	6	54908	54913	0 %	0 %	50 %	50 %	409248875
113	NT_187075	GC	3	6	55137	55142	0 %	0 %	50 %	50 %	409248875
114	NT_187075	GT	3	6	55800	55805	0 %	50 %	50 %	0 %	409248875
115	NT_187075	GT	3	6	56531	56536	0 %	50 %	50 %	0 %	409248876
116	NT_187075	GC	3	6	56634	56639	0 %	0 %	50 %	50 %	409248876
117	NT_187075	TG	3	6	56682	56687	0 %	50 %	50 %	0 %	409248876
118	NT_187075	CT	3	6	57062	57067	0 %	50 %	0 %	50 %	409248877
119	NT_187075	CG	3	6	58230	58235	0 %	0 %	50 %	50 %	409248878
120	NT_187075	GC	3	6	58449	58454	0 %	0 %	50 %	50 %	409248879
121	NT_187075	GC	3	6	58500	58505	0 %	0 %	50 %	50 %	409248879
122	NT_187075	TG	3	6	58586	58591	0 %	50 %	50 %	0 %	409248879
123	NT_187075	CG	3	6	58822	58827	0 %	0 %	50 %	50 %	409248879
124	NT_187075	GC	3	6	58883	58888	0 %	0 %	50 %	50 %	409248879
125	NT_187075	GC	3	6	59571	59576	0 %	0 %	50 %	50 %	409248880
126	NT_187075	AG	3	6	60986	60991	50 %	0 %	50 %	0 %	409248881
127	NT_187075	GC	3	6	61242	61247	0 %	0 %	50 %	50 %	409248881
128	NT_187075	GC	3	6	61746	61751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NT_187075	AG	3	6	62307	62312	50 %	0 %	50 %	0 %	409248882
130	NT_187075	TC	3	6	62533	62538	0 %	50 %	0 %	50 %	409248882
131	NT_187075	TC	3	6	62969	62974	0 %	50 %	0 %	50 %	409248882
132	NT_187075	CG	3	6	63851	63856	0 %	0 %	50 %	50 %	409248883
133	NT_187075	GA	4	8	63918	63925	50 %	0 %	50 %	0 %	409248883
134	NT_187075	GC	3	6	64961	64966	0 %	0 %	50 %	50 %	409248884
135	NT_187075	GA	4	8	65322	65329	50 %	0 %	50 %	0 %	409248884
136	NT_187075	AC	3	6	65896	65901	50 %	0 %	0 %	50 %	409248885
137	NT_187075	CG	4	8	68280	68287	0 %	0 %	50 %	50 %	409248887
138	NT_187075	CG	3	6	69437	69442	0 %	0 %	50 %	50 %	409248888
139	NT_187075	AT	3	6	70029	70034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187075	CG	3	6	70705	70710	0 %	0 %	50 %	50 %	409248890
141	NT_187075	TA	3	6	73030	73035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187075	GC	3	6	73429	73434	0 %	0 %	50 %	50 %	409248893
143	NT_187075	GC	3	6	73964	73969	0 %	0 %	50 %	50 %	409248893
144	NT_187075	CG	3	6	74164	74169	0 %	0 %	50 %	50 %	409248893
145	NT_187075	GC	3	6	75400	75405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NT_187075	TA	3	6	75482	75487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187075	GC	3	6	75983	75988	0 %	0 %	50 %	50 %	409248895
148	NT_187075	TG	3	6	76940	76945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187075	GA	3	6	77033	77038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187075	GC	4	8	77331	77338	0 %	0 %	50 %	50 %	409248896
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162	NT_187075	GA	3	6	86551	86556	50 %	0 %	50 %	0 %	409248903

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.