MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187074	ACTC	2	8	228	235	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187074	TAAA	2	8	321	328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187074	ATTT	2	8	538	545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187074	ATAC	2	8	695	702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187074	CAAC	2	8	770	777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NT_187074	GCGG	2	8	1111	1118	0 %	0 %	75 %	25 %	409248757
7	NT_187074	CTTG	2	8	1150	1157	0 %	50 %	25 %	25 %	409248757
8	NT_187074	GTCA	2	8	1360	1367	25 %	25 %	25 %	25 %	409248757
9	NT_187074	GCCA	2	8	1785	1792	25 %	0 %	25 %	50 %	409248758
10	NT_187074	GATC	2	8	2409	2416	25 %	25 %	25 %	25 %	409248759
11	NT_187074	GACG	2	8	4010	4017	25 %	0 %	50 %	25 %	409248760
12	NT_187074	AATC	2	8	4248	4255	50 %	25 %	0 %	25 %	409248761
13	NT_187074	CTTT	2	8	4479	4486	0 %	75 %	0 %	25 %	409248761
14	NT_187074	CTGC	2	8	6616	6623	0 %	25 %	25 %	50 %	409248765
15	NT_187074	CCTG	2	8	7212	7219	0 %	25 %	25 %	50 %	409248765
16	NT_187074	AGCG	2	8	7304	7311	25 %	0 %	50 %	25 %	409248765
17	NT_187074	TCTT	2	8	7527	7534	0 %	75 %	0 %	25 %	409248766
18	NT_187074	CACG	2	8	8008	8015	25 %	0 %	25 %	50 %	409248766
19	NT_187074	CAAC	2	8	8258	8265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187074	CTGA	2	8	9822	9829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187074	TAAG	2	8	10078	10085	50 %	25 %	25 %	0 %	409248770
22	NT_187074	CAGC	2	8	10510	10517	25 %	0 %	25 %	50 %	409248770
23	NT_187074	AAAG	2	8	11794	11801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187074	AATA	2	8	12314	12321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187074	TGTT	2	8	12477	12484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187074	CAGT	2	8	13740	13747	25 %	25 %	25 %	25 %	409248774
27	NT_187074	TGAA	2	8	13995	14002	50 %	25 %	25 %	0 %	409248775
28	NT_187074	GCCA	2	8	15005	15012	25 %	0 %	25 %	50 %	409248775
29	NT_187074	ATGA	2	8	15140	15147	50 %	25 %	25 %	0 %	409248775
30	NT_187074	CAGG	2	8	15302	15309	25 %	0 %	50 %	25 %	409248775
31	NT_187074	GATC	2	8	15413	15420	25 %	25 %	25 %	25 %	409248776
32	NT_187074	TGGC	2	8	15463	15470	0 %	25 %	50 %	25 %	409248776
33	NT_187074	CCAA	2	8	15473	15480	50 %	0 %	0 %	50 %	409248776
34	NT_187074	GAAT	2	8	16194	16201	50 %	25 %	25 %	0 %	409248777
35	NT_187074	AACC	2	8	16231	16238	50 %	0 %	0 %	50 %	409248777
36	NT_187074	ATGG	2	8	16421	16428	25 %	25 %	50 %	0 %	409248777
37	NT_187074	CGGG	2	8	16564	16571	0 %	0 %	75 %	25 %	409248777
38	NT_187074	ATCC	2	8	16601	16608	25 %	25 %	0 %	50 %	409248777
39	NT_187074	TGGT	2	8	17621	17628	0 %	50 %	50 %	0 %	409248778
40	NT_187074	GAAA	2	8	17634	17641	75 %	0 %	25 %	0 %	409248778
41	NT_187074	ATGG	2	8	18058	18065	25 %	25 %	50 %	0 %	409248779
42	NT_187074	ACGG	2	8	18445	18452	25 %	0 %	50 %	25 %	409248779
43	NT_187074	GATT	2	8	19072	19079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187074	CCAT	2	8	19166	19173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NT_187074	TTTC	2	8	19516	19523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NT_187074	GCCA	2	8	21422	21429	25 %	0 %	25 %	50 %	409248781
47	NT_187074	GGCT	2	8	23234	23241	0 %	25 %	50 %	25 %	409248782
48	NT_187074	AATC	2	8	23289	23296	50 %	25 %	0 %	25 %	409248782
49	NT_187074	GTTG	2	8	23350	23357	0 %	50 %	50 %	0 %	409248782
50	NT_187074	GCCA	2	8	23522	23529	25 %	0 %	25 %	50 %	409248782
51	NT_187074	AGAC	2	8	23959	23966	50 %	0 %	25 %	25 %	409248782
52	NT_187074	GTCG	2	8	24400	24407	0 %	25 %	50 %	25 %	409248782
53	NT_187074	CGCT	2	8	25616	25623	0 %	25 %	25 %	50 %	409248784
54	NT_187074	GATT	2	8	25679	25686	25 %	50 %	25 %	0 %	409248784
55	NT_187074	TACT	2	8	25889	25896	25 %	50 %	0 %	25 %	409248784
56	NT_187074	AAAC	2	8	26216	26223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NT_187074	ATAG	2	8	26347	26354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187074	ATGA	2	8	26727	26734	50 %	25 %	25 %	0 %	409248785
59	NT_187074	TTTG	2	8	26886	26893	0 %	75 %	25 %	0 %	409248785
60	NT_187074	CTGT	2	8	27021	27028	0 %	50 %	25 %	25 %	409248785
61	NT_187074	GTGA	2	8	27066	27073	25 %	25 %	50 %	0 %	409248785
62	NT_187074	ATGG	2	8	27602	27609	25 %	25 %	50 %	0 %	409248786
63	NT_187074	AAGG	2	8	28209	28216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187074	CTTT	2	8	28578	28585	0 %	75 %	0 %	25 %	409248787
65	NT_187074	TTAA	2	8	30060	30067	50 %	50 %	0 %	0 %	409248789
66	NT_187074	GCTG	2	8	30673	30680	0 %	25 %	50 %	25 %	409248790
67	NT_187074	TATC	2	8	31954	31961	25 %	50 %	0 %	25 %	409248791
68	NT_187074	CGGT	2	8	32574	32581	0 %	25 %	50 %	25 %	409248792
69	NT_187074	TATT	2	8	32748	32755	25 %	75 %	0 %	0 %	409248792
70	NT_187074	CAAA	2	8	33425	33432	75 %	0 %	0 %	25 %	409248793
71	NT_187074	GATT	2	8	34283	34290	25 %	50 %	25 %	0 %	409248794
72	NT_187074	GCCA	2	8	34820	34827	25 %	0 %	25 %	50 %	409248794
73	NT_187074	CAGC	2	8	34927	34934	25 %	0 %	25 %	50 %	409248794
74	NT_187074	AAGC	2	8	34949	34956	50 %	0 %	25 %	25 %	409248794
75	NT_187074	TGCT	2	8	35023	35030	0 %	50 %	25 %	25 %	409248795
76	NT_187074	CACG	2	8	35616	35623	25 %	0 %	25 %	50 %	409248795
77	NT_187074	GACG	2	8	36564	36571	25 %	0 %	50 %	25 %	409248795
78	NT_187074	AGAA	2	8	36853	36860	75 %	0 %	25 %	0 %	409248795
79	NT_187074	CATC	2	8	36876	36883	25 %	25 %	0 %	50 %	409248795
80	NT_187074	CGCC	2	8	37090	37097	0 %	0 %	25 %	75 %	409248795
81	NT_187074	CCAG	2	8	37614	37621	25 %	0 %	25 %	50 %	409248795
82	NT_187074	GCCA	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	409248795
83	NT_187074	ACAT	2	8	38740	38747	50 %	25 %	0 %	25 %	409248796
84	NT_187074	GATC	2	8	39098	39105	25 %	25 %	25 %	25 %	409248796
85	NT_187074	AGTC	2	8	39690	39697	25 %	25 %	25 %	25 %	409248797
86	NT_187074	CTTA	2	8	39722	39729	25 %	50 %	0 %	25 %	409248797
87	NT_187074	TCGC	2	8	39757	39764	0 %	25 %	25 %	50 %	409248797
88	NT_187074	TGGC	2	8	40800	40807	0 %	25 %	50 %	25 %	409248797
89	NT_187074	CGGA	2	8	42077	42084	25 %	0 %	50 %	25 %	409248798
90	NT_187074	CTGG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	50 %	25 %	409248800
91	NT_187074	GTTT	2	8	44040	44047	0 %	75 %	25 %	0 %	409248800
92	NT_187074	TGGC	2	8	44144	44151	0 %	25 %	50 %	25 %	409248800
93	NT_187074	ATTG	2	8	44414	44421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187074	TCTG	2	8	44510	44517	0 %	50 %	25 %	25 %	409248801
95	NT_187074	GATT	2	8	44663	44670	25 %	50 %	25 %	0 %	409248801
96	NT_187074	TCCA	2	8	45204	45211	25 %	25 %	0 %	50 %	409248801
97	NT_187074	ACCG	2	8	45305	45312	25 %	0 %	25 %	50 %	409248801
98	NT_187074	ACCG	2	8	45641	45648	25 %	0 %	25 %	50 %	409248801
99	NT_187074	TGAA	2	8	45748	45755	50 %	25 %	25 %	0 %	409248801
100	NT_187074	TGAT	2	8	46234	46241	25 %	50 %	25 %	0 %	409248801
101	NT_187074	GCCA	2	8	46685	46692	25 %	0 %	25 %	50 %	409248802
102	NT_187074	GGGC	2	8	46958	46965	0 %	0 %	75 %	25 %	409248802
103	NT_187074	AAAT	2	8	47135	47142	75 %	25 %	0 %	0 %	409248802
104	NT_187074	TTTA	2	8	49213	49220	25 %	75 %	0 %	0 %	409248802
105	NT_187074	TTGA	2	8	49374	49381	25 %	50 %	25 %	0 %	409248802
106	NT_187074	TGAA	2	8	49404	49411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187074	AGCG	2	8	49459	49466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NT_187074	CAGC	2	8	49751	49758	25 %	0 %	25 %	50 %	409248803
109	NT_187074	GGGA	2	8	49882	49889	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187074	GCTC	2	8	50040	50047	0 %	25 %	25 %	50 %	409248804
111	NT_187074	GAAC	2	8	50127	50134	50 %	0 %	25 %	25 %	409248804
112	NT_187074	ATGG	2	8	50560	50567	25 %	25 %	50 %	0 %	409248804
113	NT_187074	ATTG	2	8	50593	50600	25 %	50 %	25 %	0 %	409248804
114	NT_187074	GTGG	2	8	51046	51053	0 %	25 %	75 %	0 %	409248804
115	NT_187074	ACCG	2	8	51214	51221	25 %	0 %	25 %	50 %	409248804
116	NT_187074	GATG	2	8	51357	51364	25 %	25 %	50 %	0 %	409248805
117	NT_187074	CTGG	2	8	51468	51475	0 %	25 %	50 %	25 %	409248805
118	NT_187074	ATGG	2	8	52337	52344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187074	CTGA	2	8	52430	52437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NT_187074	GCTG	2	8	52927	52934	0 %	25 %	50 %	25 %	409248806
121	NT_187074	TGAG	2	8	52986	52993	25 %	25 %	50 %	0 %	409248806
122	NT_187074	GAAC	2	8	53371	53378	50 %	0 %	25 %	25 %	409248806
123	NT_187074	GCGT	2	8	54022	54029	0 %	25 %	50 %	25 %	409248807
124	NT_187074	CTTT	2	8	54622	54629	0 %	75 %	0 %	25 %	409248807
125	NT_187074	GGTT	2	8	54777	54784	0 %	50 %	50 %	0 %	409248807
126	NT_187074	GAAA	2	8	56226	56233	75 %	0 %	25 %	0 %	409248808
127	NT_187074	CCCG	2	8	56453	56460	0 %	0 %	25 %	75 %	409248808
128	NT_187074	CAGA	2	8	57028	57035	50 %	0 %	25 %	25 %	409248809
129	NT_187074	TATT	2	8	57123	57130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187074	AGGG	2	8	57999	58006	25 %	0 %	75 %	0 %	409248810
131	NT_187074	GAGC	2	8	58118	58125	25 %	0 %	50 %	25 %	409248810
132	NT_187074	AATA	2	8	58299	58306	75 %	25 %	0 %	0 %	409248810
133	NT_187074	TAAT	2	8	58344	58351	50 %	50 %	0 %	0 %	409248810
134	NT_187074	CTAT	2	8	59226	59233	25 %	50 %	0 %	25 %	409248811
135	NT_187074	CAAA	2	8	59484	59491	75 %	0 %	0 %	25 %	409248811
136	NT_187074	CGAC	2	8	59766	59773	25 %	0 %	25 %	50 %	409248811
137	NT_187074	GACA	2	8	60105	60112	50 %	0 %	25 %	25 %	409248812
138	NT_187074	ACTC	2	8	61272	61279	25 %	25 %	0 %	50 %	409248812
139	NT_187074	GTGG	2	8	61914	61921	0 %	25 %	75 %	0 %	409248813
140	NT_187074	TTCA	2	8	62091	62098	25 %	50 %	0 %	25 %	409248813
141	NT_187074	TTTC	2	8	62165	62172	0 %	75 %	0 %	25 %	409248813
142	NT_187074	AGCC	2	8	62763	62770	25 %	0 %	25 %	50 %	409248813
143	NT_187074	GCTG	2	8	62982	62989	0 %	25 %	50 %	25 %	409248814
144	NT_187074	GTGG	2	8	63412	63419	0 %	25 %	75 %	0 %	409248814
145	NT_187074	GGCG	2	8	63619	63626	0 %	0 %	75 %	25 %	409248814
146	NT_187074	GGCA	2	8	63697	63704	25 %	0 %	50 %	25 %	409248814
147	NT_187074	GTTT	2	8	64543	64550	0 %	75 %	25 %	0 %	409248814
148	NT_187074	GCCA	2	8	64911	64918	25 %	0 %	25 %	50 %	409248815
149	NT_187074	GCCG	2	8	65019	65026	0 %	0 %	50 %	50 %	409248815
150	NT_187074	AGAA	2	8	65168	65175	75 %	0 %	25 %	0 %	409248815
151	NT_187074	TCCA	2	8	65259	65266	25 %	25 %	0 %	50 %	409248815
152	NT_187074	GCAG	2	8	65816	65823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.