MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187073	AAATT	2	10	2220	2229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187073	TGGCA	2	10	2558	2567	20 %	20 %	40 %	20 %	409248678
3	NT_187073	GTGCC	2	10	3098	3107	0 %	20 %	40 %	40 %	409248678
4	NT_187073	ACAAA	2	10	3507	3516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187073	ATGCG	2	10	3631	3640	20 %	20 %	40 %	20 %	409248679
6	NT_187073	ATGTC	2	10	4932	4941	20 %	40 %	20 %	20 %	409248680
7	NT_187073	CGATT	2	10	5148	5157	20 %	40 %	20 %	20 %	409248680
8	NT_187073	GTTTC	2	10	5993	6002	0 %	60 %	20 %	20 %	409248681
9	NT_187073	ACTGG	2	10	8024	8033	20 %	20 %	40 %	20 %	409248683
10	NT_187073	CGCGG	2	10	9068	9077	0 %	0 %	60 %	40 %	409248685
11	NT_187073	GCCAG	2	10	9417	9426	20 %	0 %	40 %	40 %	409248685
12	NT_187073	GGCAG	2	10	12640	12649	20 %	0 %	60 %	20 %	409248688
13	NT_187073	CCCTG	2	10	13257	13266	0 %	20 %	20 %	60 %	409248688
14	NT_187073	GAAAC	2	10	15880	15889	60 %	0 %	20 %	20 %	409248691
15	NT_187073	CGGGA	2	10	15892	15901	20 %	0 %	60 %	20 %	409248691
16	NT_187073	GCACA	2	10	16008	16017	40 %	0 %	20 %	40 %	409248691
17	NT_187073	TTGTT	2	10	16480	16489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187073	GGCCG	2	10	18434	18443	0 %	0 %	60 %	40 %	409248692
19	NT_187073	GCGGT	2	10	20823	20832	0 %	20 %	60 %	20 %	409248694
20	NT_187073	ATGAT	2	10	23518	23527	40 %	40 %	20 %	0 %	409248699
21	NT_187073	GGAAA	2	10	25291	25300	60 %	0 %	40 %	0 %	409248702
22	NT_187073	CGGCG	2	10	27113	27122	0 %	0 %	60 %	40 %	409248704
23	NT_187073	CTGGC	2	10	28371	28380	0 %	20 %	40 %	40 %	409248705
24	NT_187073	TCCCG	2	10	31209	31218	0 %	20 %	20 %	60 %	409248707
25	NT_187073	GGCCT	2	10	32107	32116	0 %	20 %	40 %	40 %	409248707
26	NT_187073	TCGCT	2	10	32417	32426	0 %	40 %	20 %	40 %	409248707
27	NT_187073	TTTGA	2	10	34676	34685	20 %	60 %	20 %	0 %	409248709
28	NT_187073	TAAAT	2	10	34687	34696	60 %	40 %	0 %	0 %	409248709
29	NT_187073	GGGCT	2	10	35039	35048	0 %	20 %	60 %	20 %	409248709
30	NT_187073	AATTT	2	10	35693	35702	40 %	60 %	0 %	0 %	409248710
31	NT_187073	GGGCT	2	10	36058	36067	0 %	20 %	60 %	20 %	409248710
32	NT_187073	GTTGG	2	10	36282	36291	0 %	40 %	60 %	0 %	409248712
33	NT_187073	TAAGA	2	10	36855	36864	60 %	20 %	20 %	0 %	409248712
34	NT_187073	GTGCC	2	10	37729	37738	0 %	20 %	40 %	40 %	409248713
35	NT_187073	AGCGC	2	10	38552	38561	20 %	0 %	40 %	40 %	409248713
36	NT_187073	CACCC	2	10	38757	38766	20 %	0 %	0 %	80 %	409248713
37	NT_187073	CCGGC	2	10	38836	38845	0 %	0 %	40 %	60 %	409248713
38	NT_187073	GGCAT	2	10	41120	41129	20 %	20 %	40 %	20 %	409248715
39	NT_187073	GGAAG	2	10	42064	42073	40 %	0 %	60 %	0 %	409248715
40	NT_187073	GCAGC	2	10	42907	42916	20 %	0 %	40 %	40 %	409248715
41	NT_187073	CGGGG	2	10	43503	43512	0 %	0 %	80 %	20 %	409248715
42	NT_187073	ATATT	2	10	43879	43888	40 %	60 %	0 %	0 %	409248715
43	NT_187073	ACATA	2	10	44287	44296	60 %	20 %	0 %	20 %	409248716
44	NT_187073	ATGAA	2	10	44427	44436	60 %	20 %	20 %	0 %	409248716
45	NT_187073	CTTAT	2	10	44761	44770	20 %	60 %	0 %	20 %	409248716
46	NT_187073	TTTGT	2	10	45798	45807	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187073	TTCTA	2	10	45987	45996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NT_187073	ACGAC	2	10	49183	49192	40 %	0 %	20 %	40 %	409248720
49	NT_187073	TTATA	2	10	52862	52871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187073	AATTA	2	10	52987	52996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187073	TATTC	2	10	55236	55245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NT_187073	AAATT	2	10	56146	56155	60 %	40 %	0 %	0 %	409248727
53	NT_187073	ACCCC	2	10	56612	56621	20 %	0 %	0 %	80 %	409248727
54	NT_187073	GCGTG	2	10	57423	57432	0 %	20 %	60 %	20 %	409248728
55	NT_187073	CTGGC	2	10	58901	58910	0 %	20 %	40 %	40 %	409248728
56	NT_187073	CGGGC	2	10	59490	59499	0 %	0 %	60 %	40 %	409248729
57	NT_187073	GATGG	2	10	59508	59517	20 %	20 %	60 %	0 %	409248729
58	NT_187073	TCTGT	2	10	61432	61441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NT_187073	TTACT	2	10	62028	62037	20 %	60 %	0 %	20 %	409248732
60	NT_187073	GGCTT	2	10	62626	62635	0 %	40 %	40 %	20 %	409248732
61	NT_187073	GTTGA	2	10	63746	63755	20 %	40 %	40 %	0 %	409248733
62	NT_187073	TTTCA	2	10	63874	63883	20 %	60 %	0 %	20 %	409248733
63	NT_187073	CTGCG	2	10	66673	66682	0 %	20 %	40 %	40 %	409248736
64	NT_187073	GGAAC	2	10	67251	67260	40 %	0 %	40 %	20 %	409248736
65	NT_187073	TGCGA	2	10	68664	68673	20 %	20 %	40 %	20 %	409248737
66	NT_187073	TTAAA	2	10	71877	71886	60 %	40 %	0 %	0 %	409248740
67	NT_187073	GCGTT	2	10	74671	74680	0 %	40 %	40 %	20 %	409248743
68	NT_187073	CGCGC	2	10	77101	77110	0 %	0 %	40 %	60 %	409248745
69	NT_187073	GTTTG	2	10	77965	77974	0 %	60 %	40 %	0 %	409248746
70	NT_187073	GTAAG	2	10	78747	78756	40 %	20 %	40 %	0 %	409248747
71	NT_187073	TGCGC	2	10	80124	80133	0 %	20 %	40 %	40 %	409248749
72	NT_187073	AGCGA	2	10	80826	80835	40 %	0 %	40 %	20 %	409248750
73	NT_187073	GCTGT	2	10	82882	82891	0 %	40 %	40 %	20 %	409248752
74	NT_187073	CATGA	2	10	83773	83782	40 %	20 %	20 %	20 %	409248754
75	NT_187073	GCGCC	2	10	84023	84032	0 %	0 %	40 %	60 %	409248754
76	NT_187073	AAAAT	2	10	84861	84870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.