MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187072	GGCGCG	2	12	1343	1354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248464
2	NT_187072	AATAGC	2	12	2352	2363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409248465
3	NT_187072	GCTGGA	2	12	4906	4917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248468
4	NT_187072	ACCGGT	2	12	6297	6308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248469
5	NT_187072	GGCGGG	2	12	8776	8787	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	409248472
6	NT_187072	TGGAGC	2	12	11947	11958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248477
7	NT_187072	TGAAGC	2	12	13702	13713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248477
8	NT_187072	GTGGAC	2	12	13932	13943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248477
9	NT_187072	TGCCAG	2	12	15360	15371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248478
10	NT_187072	GGTATC	2	12	16004	16015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248479
11	NT_187072	CATCCT	2	12	17487	17498	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	409248481
12	NT_187072	CAGGCG	2	12	33466	33477	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248495
13	NT_187072	CGCCCG	2	12	35002	35013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248496
14	NT_187072	GCTGGG	2	12	35116	35127	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409248496
15	NT_187072	CGATGC	2	12	36004	36015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248497
16	NT_187072	CTTCGC	2	12	36181	36192	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409248498
17	NT_187072	TCCCTT	2	12	36310	36321	0 %	50 %	0 %	50 %	409248498
18	NT_187072	TCATGG	2	12	37942	37953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248500
19	NT_187072	TTCGCG	2	12	46071	46082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248506
20	NT_187072	CGGCAG	2	12	46329	46340	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248506
21	NT_187072	CTCCAG	2	12	48398	48409	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409248507
22	NT_187072	GTTGAA	2	12	51486	51497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248509
23	NT_187072	GGTTCA	2	12	55768	55779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248514
24	NT_187072	CAATTG	2	12	57845	57856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409248515
25	NT_187072	CGCTGG	2	12	59247	59258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248517
26	NT_187072	CGCTGA	2	12	60269	60280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248518
27	NT_187072	TGGCGT	2	12	61185	61196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409248519
28	NT_187072	GCGTCA	2	12	61447	61458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248519
29	NT_187072	CGTCAC	2	12	62651	62662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409248520
30	NT_187072	CAGCCC	2	12	62732	62743	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409248520
31	NT_187072	CTTCCG	2	12	66469	66480	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409248526
32	NT_187072	TGCCGA	2	12	67201	67212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248526
33	NT_187072	GCCGTT	2	12	69021	69032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248528
34	NT_187072	GGATAA	2	12	70786	70797	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409248529
35	NT_187072	CTGAAC	2	12	73808	73819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248531
36	NT_187072	TGGCGA	2	12	79106	79117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248537
37	NT_187072	AAAGCA	2	12	81691	81702	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	409248539
38	NT_187072	GCGAAA	2	12	82120	82131	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409248539
39	NT_187072	AAGCGC	2	12	84267	84278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248541
40	NT_187072	CTGGCG	2	12	84791	84802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248541
41	NT_187072	CGTTGC	2	12	87022	87033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248543
42	NT_187072	ACGCGC	2	12	88858	88869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248544
43	NT_187072	CAGGCA	2	12	90903	90914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248546
44	NT_187072	GTGCGC	2	12	91277	91288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248547
45	NT_187072	GGCGCT	2	12	92450	92461	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248548
46	NT_187072	GCCAGC	2	12	103545	103556	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248560
47	NT_187072	CGCTGC	2	12	103884	103895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248560
48	NT_187072	CGGCGA	2	12	115364	115375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248571
49	NT_187072	ACGTTC	2	12	117675	117686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248572
50	NT_187072	CGGCTG	2	12	117939	117950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248572
51	NT_187072	AAAGTG	2	12	119770	119781	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409248573
52	NT_187072	TCACCG	2	12	124798	124809	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409248578
53	NT_187072	TCTACC	2	12	126660	126671	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	409248578
54	NT_187072	CAGGCG	2	12	131491	131502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248587
55	NT_187072	TAGCGA	2	12	137596	137607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248593
56	NT_187072	TTTATG	2	12	139755	139766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409248594
57	NT_187072	TTGCGC	2	12	140778	140789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248595
58	NT_187072	TTTAAC	2	12	141243	141254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	409248596
59	NT_187072	GCGCGG	2	12	142654	142665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248597
60	NT_187072	GAATCT	2	12	142800	142811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409248598
61	NT_187072	TATTGA	2	12	146210	146221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409248599
62	NT_187072	GCCGAT	2	12	151469	151480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248606
63	NT_187072	CCAGCA	2	12	151537	151548	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409248606
64	NT_187072	CCCGCC	2	12	157928	157939	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	409248613
65	NT_187072	GACGCC	2	12	161955	161966	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248614
66	NT_187072	AGATGC	2	12	162804	162815	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248616
67	NT_187072	ATGCGT	2	12	163724	163735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248616
68	NT_187072	TGGCGG	2	12	167743	167754	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409248619
69	NT_187072	CGGGAT	2	12	174871	174882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248626
70	NT_187072	TGCTGG	2	12	178682	178693	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409248629
71	NT_187072	CCTTCG	2	12	192158	192169	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409248641
72	NT_187072	CGTTAG	2	12	200600	200611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248649
73	NT_187072	CGACAC	2	12	202366	202377	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409248650
74	NT_187072	TGCGCG	2	12	211707	211718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248657
75	NT_187072	GTGCCG	2	12	213960	213971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248659
76	NT_187072	GCCGAT	2	12	216240	216251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248660
77	NT_187072	TGGCGC	2	12	218308	218319	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248662
78	NT_187072	TCATTA	2	12	220229	220240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	409248666
79	NT_187072	TTTGAA	2	12	225107	225118	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409248671
80	NT_187072	GCAGAA	2	12	227516	227527	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409248674

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.