MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187072	CGTGC	2	10	5969	5978	0 %	20 %	40 %	40 %	409248469
2	NT_187072	TTGAT	2	10	6139	6148	20 %	60 %	20 %	0 %	409248469
3	NT_187072	GCGAA	2	10	13300	13309	40 %	0 %	40 %	20 %	409248477
4	NT_187072	CGTAC	2	10	14190	14199	20 %	20 %	20 %	40 %	409248477
5	NT_187072	TTGCC	2	10	15827	15836	0 %	40 %	20 %	40 %	409248479
6	NT_187072	CGTCC	2	10	15937	15946	0 %	20 %	20 %	60 %	409248479
7	NT_187072	TCAGC	2	10	19055	19064	20 %	20 %	20 %	40 %	409248482
8	NT_187072	GGCCA	2	10	19203	19212	20 %	0 %	40 %	40 %	409248482
9	NT_187072	GTACG	2	10	21774	21783	20 %	20 %	40 %	20 %	409248484
10	NT_187072	CAGAA	2	10	22487	22496	60 %	0 %	20 %	20 %	409248484
11	NT_187072	CCGCA	2	10	24606	24615	20 %	0 %	20 %	60 %	409248487
12	NT_187072	CGGTT	2	10	25111	25120	0 %	40 %	40 %	20 %	409248488
13	NT_187072	TGGCG	2	10	26891	26900	0 %	20 %	60 %	20 %	409248490
14	NT_187072	TTTCC	2	10	30798	30807	0 %	60 %	0 %	40 %	409248494
15	NT_187072	GTGGC	2	10	31367	31376	0 %	20 %	60 %	20 %	409248494
16	NT_187072	TGCAC	2	10	33431	33440	20 %	20 %	20 %	40 %	409248495
17	NT_187072	GCGCT	2	10	34136	34145	0 %	20 %	40 %	40 %	409248496
18	NT_187072	GGCGC	2	10	34550	34559	0 %	0 %	60 %	40 %	409248496
19	NT_187072	GCGAC	2	10	34863	34872	20 %	0 %	40 %	40 %	409248496
20	NT_187072	AACGT	2	10	37320	37329	40 %	20 %	20 %	20 %	409248499
21	NT_187072	CCCAA	2	10	39470	39479	40 %	0 %	0 %	60 %	409248502
22	NT_187072	TTGTT	2	10	40177	40186	0 %	80 %	20 %	0 %	409248502
23	NT_187072	GCTTC	2	10	41557	41566	0 %	40 %	20 %	40 %	409248503
24	NT_187072	TGCGT	2	10	41844	41853	0 %	40 %	40 %	20 %	409248503
25	NT_187072	TGATC	2	10	43544	43553	20 %	40 %	20 %	20 %	409248504
26	NT_187072	GCTGA	2	10	45054	45063	20 %	20 %	40 %	20 %	409248506
27	NT_187072	TGGCG	2	10	46704	46713	0 %	20 %	60 %	20 %	409248506
28	NT_187072	AGCGC	2	10	47264	47273	20 %	0 %	40 %	40 %	409248506
29	NT_187072	CCGCG	2	10	48349	48358	0 %	0 %	40 %	60 %	409248507
30	NT_187072	GGGGT	2	10	49745	49754	0 %	20 %	80 %	0 %	409248507
31	NT_187072	ACGGT	2	10	51574	51583	20 %	20 %	40 %	20 %	409248509
32	NT_187072	TGGCG	2	10	51942	51951	0 %	20 %	60 %	20 %	409248509
33	NT_187072	CAGCG	2	10	54669	54678	20 %	0 %	40 %	40 %	409248514
34	NT_187072	GCCGG	2	10	54969	54978	0 %	0 %	60 %	40 %	409248514
35	NT_187072	CGAGC	2	10	55094	55103	20 %	0 %	40 %	40 %	409248514
36	NT_187072	ATTTG	2	10	55537	55546	20 %	60 %	20 %	0 %	409248514
37	NT_187072	TTGCC	2	10	60041	60050	0 %	40 %	20 %	40 %	409248518
38	NT_187072	AGCAG	2	10	60718	60727	40 %	0 %	40 %	20 %	409248519
39	NT_187072	AGTTT	2	10	62949	62958	20 %	60 %	20 %	0 %	409248520
40	NT_187072	TAGTG	2	10	63367	63376	20 %	40 %	40 %	0 %	409248521
41	NT_187072	TCGAT	2	10	64798	64807	20 %	40 %	20 %	20 %	409248522
42	NT_187072	CGGCG	2	10	67109	67118	0 %	0 %	60 %	40 %	409248526
43	NT_187072	CGTTT	2	10	67571	67580	0 %	60 %	20 %	20 %	409248526
44	NT_187072	ATTGG	2	10	67835	67844	20 %	40 %	40 %	0 %	409248527
45	NT_187072	GGTTT	2	10	70727	70736	0 %	60 %	40 %	0 %	409248529
46	NT_187072	ATTCC	2	10	72672	72681	20 %	40 %	0 %	40 %	409248531
47	NT_187072	AAAGC	2	10	74969	74978	60 %	0 %	20 %	20 %	409248534
48	NT_187072	CCGCA	2	10	75502	75511	20 %	0 %	20 %	60 %	409248534
49	NT_187072	AGTTC	2	10	77873	77882	20 %	40 %	20 %	20 %	409248535
50	NT_187072	TGCCT	2	10	77973	77982	0 %	40 %	20 %	40 %	409248536
51	NT_187072	TATCG	2	10	79753	79762	20 %	40 %	20 %	20 %	409248537
52	NT_187072	AAGCG	2	10	82626	82635	40 %	0 %	40 %	20 %	409248539
53	NT_187072	GTTTG	2	10	84529	84538	0 %	60 %	40 %	0 %	409248541
54	NT_187072	CGTAT	2	10	86000	86009	20 %	40 %	20 %	20 %	409248542
55	NT_187072	ATCAG	2	10	87836	87845	40 %	20 %	20 %	20 %	409248544
56	NT_187072	CTGCC	2	10	89845	89854	0 %	20 %	20 %	60 %	409248545
57	NT_187072	CGGCG	2	10	92575	92584	0 %	0 %	60 %	40 %	409248548
58	NT_187072	CCGGC	2	10	95929	95938	0 %	0 %	40 %	60 %	409248551
59	NT_187072	CGCTG	2	10	96821	96830	0 %	20 %	40 %	40 %	409248551
60	NT_187072	GATCA	2	10	100974	100983	40 %	20 %	20 %	20 %	409248557
61	NT_187072	CGTCA	2	10	101720	101729	20 %	20 %	20 %	40 %	409248558
62	NT_187072	ATCCC	2	10	103420	103429	20 %	20 %	0 %	60 %	409248560
63	NT_187072	AGCGC	2	10	104128	104137	20 %	0 %	40 %	40 %	409248560
64	NT_187072	TGAGC	2	10	105977	105986	20 %	20 %	40 %	20 %	409248561
65	NT_187072	CGCAT	2	10	106239	106248	20 %	20 %	20 %	40 %	409248562
66	NT_187072	CGAAC	2	10	106968	106977	40 %	0 %	20 %	40 %	409248564
67	NT_187072	ATGAC	2	10	108200	108209	40 %	20 %	20 %	20 %	409248565
68	NT_187072	CTGGA	2	10	108790	108799	20 %	20 %	40 %	20 %	409248566
69	NT_187072	CAGAA	2	10	110909	110918	60 %	0 %	20 %	20 %	409248568
70	NT_187072	CGAAG	2	10	113780	113789	40 %	0 %	40 %	20 %	409248570
71	NT_187072	TGCTG	2	10	120240	120249	0 %	40 %	40 %	20 %	409248573
72	NT_187072	GGCAT	2	10	121207	121216	20 %	20 %	40 %	20 %	409248574
73	NT_187072	GGCCA	2	10	121629	121638	20 %	0 %	40 %	40 %	409248575
74	NT_187072	GCGCC	2	10	121642	121651	0 %	0 %	40 %	60 %	409248575
75	NT_187072	CGTTT	2	10	122144	122153	0 %	60 %	20 %	20 %	409248575
76	NT_187072	GGGGA	2	10	122196	122205	20 %	0 %	80 %	0 %	409248575
77	NT_187072	TCTGG	2	10	125835	125844	0 %	40 %	40 %	20 %	409248578
78	NT_187072	CGGCG	2	10	129138	129147	0 %	0 %	60 %	40 %	409248585
79	NT_187072	CCGCT	2	10	129845	129854	0 %	20 %	20 %	60 %	409248585
80	NT_187072	GCCCA	2	10	132397	132406	20 %	0 %	20 %	60 %	409248588
81	NT_187072	GCGCA	2	10	132802	132811	20 %	0 %	40 %	40 %	409248588
82	NT_187072	ATCGG	2	10	134193	134202	20 %	20 %	40 %	20 %	409248590
83	NT_187072	GCCGC	2	10	135403	135412	0 %	0 %	40 %	60 %	409248592
84	NT_187072	ATCCA	2	10	140753	140762	40 %	20 %	0 %	40 %	409248595
85	NT_187072	CGGCG	2	10	142870	142879	0 %	0 %	60 %	40 %	409248598
86	NT_187072	TGGTC	2	10	143736	143745	0 %	40 %	40 %	20 %	409248598
87	NT_187072	AGCGC	2	10	146385	146394	20 %	0 %	40 %	40 %	409248599
88	NT_187072	GTGTT	2	10	146769	146778	0 %	60 %	40 %	0 %	409248600
89	NT_187072	CGGCG	2	10	148293	148302	0 %	0 %	60 %	40 %	409248602
90	NT_187072	TGGGC	2	10	148864	148873	0 %	20 %	60 %	20 %	409248603
91	NT_187072	TTCGG	2	10	149173	149182	0 %	40 %	40 %	20 %	409248603
92	NT_187072	CTTGC	2	10	150182	150191	0 %	40 %	20 %	40 %	409248604
93	NT_187072	TGAGC	2	10	150594	150603	20 %	20 %	40 %	20 %	409248605
94	NT_187072	GCACG	2	10	151858	151867	20 %	0 %	40 %	40 %	409248606
95	NT_187072	AGATC	2	10	152263	152272	40 %	20 %	20 %	20 %	409248607
96	NT_187072	CGCGG	2	10	152685	152694	0 %	0 %	60 %	40 %	409248608
97	NT_187072	CGCGG	2	10	152869	152878	0 %	0 %	60 %	40 %	409248608
98	NT_187072	GCCAG	2	10	154853	154862	20 %	0 %	40 %	40 %	409248609
99	NT_187072	GCGCG	2	10	155419	155428	0 %	0 %	60 %	40 %	409248610
100	NT_187072	CGGGG	2	10	157237	157246	0 %	0 %	80 %	20 %	409248613
101	NT_187072	AGCGC	2	10	157906	157915	20 %	0 %	40 %	40 %	409248613
102	NT_187072	GCGAA	2	10	159357	159366	40 %	0 %	40 %	20 %	409248613
103	NT_187072	GGCGG	2	10	161170	161179	0 %	0 %	80 %	20 %	409248614
104	NT_187072	GTTGA	2	10	163019	163028	20 %	40 %	40 %	0 %	409248616
105	NT_187072	TTCAA	2	10	163125	163134	40 %	40 %	0 %	20 %	409248616
106	NT_187072	GGAAT	2	10	163879	163888	40 %	20 %	40 %	0 %	409248616
107	NT_187072	GCAGC	2	10	164538	164547	20 %	0 %	40 %	40 %	409248616
108	NT_187072	TGGCG	2	10	165741	165750	0 %	20 %	60 %	20 %	409248618
109	NT_187072	TGGTC	2	10	165869	165878	0 %	40 %	40 %	20 %	409248618
110	NT_187072	GGCGT	2	10	166932	166941	0 %	20 %	60 %	20 %	409248619
111	NT_187072	CAACC	2	10	171713	171722	40 %	0 %	0 %	60 %	409248622
112	NT_187072	GCCGC	2	10	173668	173677	0 %	0 %	40 %	60 %	409248624
113	NT_187072	CAGGT	2	10	176500	176509	20 %	20 %	40 %	20 %	409248628
114	NT_187072	TGGGA	2	10	177855	177864	20 %	20 %	60 %	0 %	409248629
115	NT_187072	CGGCG	2	10	177993	178002	0 %	0 %	60 %	40 %	409248629
116	NT_187072	GTGAT	2	10	184576	184585	20 %	40 %	40 %	0 %	409248635
117	NT_187072	CCGGG	2	10	185628	185637	0 %	0 %	60 %	40 %	409248636
118	NT_187072	CGGCG	2	10	188857	188866	0 %	0 %	60 %	40 %	409248639
119	NT_187072	CTGAA	2	10	193253	193262	40 %	20 %	20 %	20 %	409248642
120	NT_187072	AAGCG	2	10	193317	193326	40 %	0 %	40 %	20 %	409248642
121	NT_187072	TGGTG	2	10	195221	195230	0 %	40 %	60 %	0 %	409248644
122	NT_187072	ATGGC	2	10	197489	197498	20 %	20 %	40 %	20 %	409248646
123	NT_187072	ACTTT	2	10	198784	198793	20 %	60 %	0 %	20 %	409248647
124	NT_187072	TACGG	2	10	202697	202706	20 %	20 %	40 %	20 %	409248650
125	NT_187072	TCCAG	2	10	204710	204719	20 %	20 %	20 %	40 %	409248652
126	NT_187072	GTGAA	2	10	205991	206000	40 %	20 %	40 %	0 %	409248654
127	NT_187072	ATGCC	2	10	207082	207091	20 %	20 %	20 %	40 %	409248655
128	NT_187072	GGGAA	2	10	207530	207539	40 %	0 %	60 %	0 %	409248655
129	NT_187072	CCGCG	2	10	211020	211029	0 %	0 %	40 %	60 %	409248657
130	NT_187072	GCCGC	2	10	213045	213054	0 %	0 %	40 %	60 %	409248659
131	NT_187072	GCCGG	2	10	214275	214284	0 %	0 %	60 %	40 %	409248659
132	NT_187072	TGCTC	2	10	216844	216853	0 %	40 %	20 %	40 %	409248660
133	NT_187072	TCCCT	2	10	217191	217200	0 %	40 %	0 %	60 %	409248661
134	NT_187072	GACCA	2	10	223703	223712	40 %	0 %	20 %	40 %	409248669
135	NT_187072	GGTCG	2	10	224705	224714	0 %	20 %	60 %	20 %	409248671
136	NT_187072	GATTT	2	10	224757	224766	20 %	60 %	20 %	0 %	409248671
137	NT_187072	ACCAG	2	10	225377	225386	40 %	0 %	20 %	40 %	409248672
138	NT_187072	GGCGC	2	10	225512	225521	0 %	0 %	60 %	40 %	409248672

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.