MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187072	CAG	2	6	37	42	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187072	CCG	2	6	45	50	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187072	GGC	2	6	51	56	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187072	CCG	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187072	CTG	2	6	313	318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187072	CCA	2	6	366	371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187072	GGA	2	6	550	555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187072	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187072	GGT	2	6	622	627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187072	GGC	2	6	691	696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187072	CAG	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187072	TGG	2	6	804	809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187072	CAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187072	CCA	2	6	951	956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NT_187072	CAT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187072	GCA	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187072	CGC	2	6	1101	1106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NT_187072	TCA	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187072	GCA	3	9	1145	1153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187072	GCA	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187072	ATC	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187072	GAC	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187072	ACG	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187072	GAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187072	GCC	2	6	1588	1593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NT_187072	CCG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NT_187072	TAA	2	6	3041	3046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187072	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187072	TTA	2	6	3114	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187072	TCT	2	6	8447	8452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187072	GGC	2	6	8555	8560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187072	TTA	2	6	9996	10001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187072	TTG	2	6	10023	10028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187072	TGT	2	6	10090	10095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187072	TAA	2	6	11638	11643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187072	CGG	2	6	14887	14892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187072	TAA	2	6	15012	15017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187072	TTA	2	6	15096	15101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187072	GGC	2	6	16246	16251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187072	CGG	2	6	17140	17145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187072	TAA	2	6	21280	21285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187072	TAT	2	6	22870	22875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187072	TTG	2	6	22883	22888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187072	ATG	2	6	22928	22933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187072	ATT	2	6	22984	22989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187072	CCG	2	6	23244	23249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NT_187072	GGC	2	6	26717	26722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187072	AAC	2	6	28184	28189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187072	AAT	2	6	28466	28471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187072	ATG	2	6	28697	28702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187072	TAT	2	6	29324	29329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187072	TGA	2	6	29677	29682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187072	ATT	2	6	29717	29722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187072	GCC	2	6	29891	29896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NT_187072	ATT	2	6	29911	29916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187072	TAA	2	6	29922	29927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187072	TGT	3	9	29999	30007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187072	ATA	2	6	30017	30022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187072	ATA	2	6	30058	30063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187072	TAT	2	6	30071	30076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187072	TAA	2	6	30315	30320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187072	AAT	2	6	30388	30393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187072	TAA	2	6	30509	30514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187072	TAA	2	6	30548	30553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187072	TAC	2	6	32510	32515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187072	CAA	2	6	32561	32566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187072	TCA	2	6	32689	32694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187072	AAG	2	6	32751	32756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187072	GCT	2	6	32786	32791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187072	ATC	2	6	32792	32797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187072	AAT	2	6	32924	32929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187072	TAA	2	6	32968	32973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187072	ATC	2	6	32981	32986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187072	ACT	2	6	35435	35440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187072	CAG	2	6	35478	35483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187072	CGA	2	6	35521	35526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187072	GGC	2	6	35549	35554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187072	GGC	2	6	36078	36083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187072	CAT	2	6	42932	42937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187072	GGC	2	6	47805	47810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187072	TAA	2	6	50278	50283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187072	AAG	2	6	50299	50304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187072	CCA	2	6	50316	50321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NT_187072	TGA	2	6	50349	50354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187072	GCA	2	6	50396	50401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187072	CCG	2	6	50460	50465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NT_187072	ATC	2	6	50512	50517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187072	GTC	2	6	52192	52197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187072	GGA	2	6	52246	52251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187072	ATG	2	6	52957	52962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187072	CAG	2	6	52973	52978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187072	ATA	2	6	53213	53218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187072	TCG	2	6	53266	53271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187072	GCC	2	6	54613	54618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NT_187072	TCA	2	6	58105	58110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187072	GTC	2	6	58141	58146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187072	TCT	2	6	58170	58175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187072	ATG	2	6	59054	59059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187072	TCA	2	6	59143	59148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187072	GGC	2	6	59950	59955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187072	GCC	2	6	62185	62190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NT_187072	ATC	2	6	62203	62208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187072	GCG	2	6	62215	62220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187072	TAT	2	6	65104	65109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187072	AAT	2	6	65124	65129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187072	CAT	2	6	65298	65303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187072	CAG	2	6	65348	65353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187072	ATA	2	6	65354	65359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187072	CTG	2	6	65361	65366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187072	GAC	2	6	65395	65400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187072	CGG	2	6	65430	65435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187072	TGA	2	6	65454	65459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187072	GCC	2	6	70401	70406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NT_187072	AGT	3	9	70438	70446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187072	TTG	2	6	70563	70568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187072	TAA	2	6	70833	70838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187072	ATT	2	6	71077	71082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187072	TCG	2	6	72172	72177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187072	ATT	2	6	72222	72227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187072	TCT	2	6	72266	72271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187072	CTT	2	6	72272	72277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187072	CCT	2	6	72279	72284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NT_187072	ATT	2	6	72286	72291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187072	TGA	2	6	72369	72374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187072	CGG	2	6	75910	75915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187072	GCC	2	6	75934	75939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NT_187072	AAT	2	6	75975	75980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187072	ATT	2	6	75985	75990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187072	TCG	2	6	76114	76119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187072	CGG	2	6	76294	76299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187072	TCC	2	6	76441	76446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NT_187072	AAG	2	6	76491	76496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187072	CTG	2	6	76642	76647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187072	ATT	2	6	76672	76677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187072	AAG	2	6	76826	76831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187072	CAA	2	6	76851	76856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187072	AAT	2	6	87630	87635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187072	GCC	2	6	92196	92201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NT_187072	CCG	2	6	93444	93449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NT_187072	CTG	2	6	94603	94608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187072	TAT	2	6	95249	95254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NT_187072	CCT	2	6	219289	219294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NT_187072	AAT	2	6	224275	224280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NT_187072	TAT	2	6	226849	226854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NT_187072	CTG	2	6	226977	226982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.