MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment c

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167352	ACT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679247
2	NT_167352	TAA	2	6	301	306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
3	NT_167352	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679247
4	NT_167352	AAT	3	9	342	350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
5	NT_167352	ATA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
6	NT_167352	ATC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679249
7	NT_167352	TAT	2	6	1744	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679249
8	NT_167352	AAT	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679249
9	NT_167352	TAT	2	6	2612	2617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
10	NT_167352	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
11	NT_167352	TTC	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679250
12	NT_167352	TAC	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679250
13	NT_167352	AGA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
14	NT_167352	TAG	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679250
15	NT_167352	TAA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
16	NT_167352	AGA	2	6	2853	2858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
17	NT_167352	CTC	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679250
18	NT_167352	AAT	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
19	NT_167352	ATA	2	6	2980	2985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
20	NT_167352	ATT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
21	NT_167352	GAG	3	9	3070	3078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679250
22	NT_167352	AGA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
23	NT_167352	AGA	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
24	NT_167352	GAA	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
25	NT_167352	GAA	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
26	NT_167352	AGA	3	9	3191	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
27	NT_167352	TTA	2	6	4255	4260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
28	NT_167352	TAT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
29	NT_167352	TAG	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679252
30	NT_167352	ATG	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679253
31	NT_167352	AGA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679253
32	NT_167352	TAA	2	6	5406	5411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679253
33	NT_167352	TAT	2	6	5519	5524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679254
34	NT_167352	ATG	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679254
35	NT_167352	AAT	2	6	5577	5582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679254
36	NT_167352	GAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679254
37	NT_167352	TAG	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679254
38	NT_167352	TTG	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679255
39	NT_167352	ATT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679255
40	NT_167352	TCA	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679255
41	NT_167352	TCA	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679255
42	NT_167352	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
43	NT_167352	TAT	2	6	6535	6540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679255
44	NT_167352	ATA	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
45	NT_167352	TAA	3	9	6596	6604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.